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1、該研究從湖北省農(nóng)科院試驗田和中國農(nóng)科院植保所溫室的3個水稻品種(轉(zhuǎn)Xa21基因水稻,皖A(yù),秈優(yōu)63)隨機排列小區(qū)的水稻根際分離所得到的細(xì)菌為材料,以香農(nóng)指數(shù)(Shannon index)為群落多樣性指標(biāo),對3個不同的細(xì)菌群落多樣性進行了比較和顯著差異性檢驗.結(jié)果表明,田間和溫室3個不同處理根際細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和種群數(shù)目除在某個取樣時期有顯著性差異外總體上無顯著性差異.溫室和田間3個處理之間的細(xì)菌數(shù)目均隨季節(jié)的變化而變化,即作物的生長發(fā)育及衰
2、老的過程中,微生物種群有著相似的變化,根際細(xì)菌隨著外界氣候的變化而呈現(xiàn)適應(yīng)性變化,TR(轉(zhuǎn)基因水稻)對根際細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)影響遠(yuǎn)遠(yuǎn)小于季節(jié)、氣候、地區(qū)的影響.對水稻不同生育時期根際優(yōu)勢細(xì)菌內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)序列(intergenic transcribespacer region,即ITS,是指16S rRNA和23S rRNA之間的區(qū)域)基因的克隆,序列測定.并利用分子生物學(xué)軟件Vecter 9.0在RISSC數(shù)據(jù)庫已經(jīng)收集的2614個細(xì)菌的I
3、TS,進行了分析比對得出結(jié)論.幾個重要的屬間的細(xì)菌的ITS序列長度有明顯差異,分別是Flexibacter flexilis 745bp,Bacillus sp377bp,Bacillus sp 329bp,Tropherymasp 574bp,Bacillus sp 377bp,Xanthomonas campestris 647bp,Bacillus sp 31 9bp,Bacillus sp 352bp,Escherichia c
4、oli 495bp,根據(jù)已經(jīng)報道的序列,將分離所得的9個優(yōu)勢細(xì)菌鑒定到5個不同的屬,分別屬于Bacillus sp,Flexibacter flexilis,Xanthomonascampestris,Escherichia coli,Tropheryma sp,從而得出各個屬細(xì)菌的動態(tài)變化.利用ITS的方法,可以快速的鑒定細(xì)菌.中國作為水稻起源中心,保護中國水稻遺傳資源、生物多樣性,轉(zhuǎn)基因水稻的安全性,特別是生態(tài)安全性顯得尤其重要,所
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