24973.中國南海海綿astrosclerawilleyana共附生微生物與功能基因的多樣性與空間分布

1、上海交通大學碩士學位論文I2011年上海交通大學碩士學位論文中國南海海綿中國南海海綿AstrosclerawilleyanaAstrosclerawilleyana共附生微生物共附生微生物與功能基因的多樣性功能基因的多樣性與空間分布與空間分布姓名：楊振亞系所：生命科學技術(shù)學院專業(yè)：生物工程研究方向：海洋微生物學習年限：2009.09～2011.06學位級別：理學碩士指導老師：李志勇教授上海交通大學生命科學技術(shù)學院二零一一年六月上海交通大

2、學碩士學位論文V中國南海海綿中國南海海綿AstrosclerawilleyanaAstrosclerawilleyana共附生微生物共附生微生物與功能基因的多樣性功能基因的多樣性與空間分布與空間分布摘要海洋微生物的生存環(huán)境的差異，例如海水成分、生長溫度等，不但影響存在的微生物類群，而且影響微生物代謝物的產(chǎn)生。海綿動物體表和體內(nèi)寄生的微生物在其不同部位發(fā)揮著不同的作用，因此，由于海綿利用其獨特的遍布全身的腔狀管道結(jié)構(gòu)來過濾海水中的微生物，

3、推測海綿的共附生微生物類群存在空間分布的特異性，在海綿表層與內(nèi)層不同部位的分布會有所差別。本文利用分子生物學技術(shù)對中國南海海綿Astrosclerawilleyana共附生微生物與功能基因的多樣性與空間分布進行了研究。成功的建立了中國南海海綿Astrosclerawilleyana樣品外層（ctex層）與內(nèi)層（endosome層）兩個樣本的細菌、古菌、放線菌、藍細菌的16SrRNA基因克隆文庫以及amoA功能基因和nirS功能基因的克隆

4、文庫，并對總共10個文庫進行了不同規(guī)模的陽性克隆測序。共獲得OTU49個。中國南海海綿Astrosclerawilleyana的共生微生物群落中，已確定分類地位的細菌分屬7個門：Planctomycetes、Cyanobacteria、Bacteroidetes、Firmicutes、Alphaproteobacteria、Gammaproteobacteria、Actinobacteria。在放線菌門中，主要包含Actinobacte

5、ridae（包括Propionibacterineae、Frankineae、Micrococcineae、Cynebacterineae）和Acidimicrobiadae兩個亞綱。而在共附生古菌群落當中，分別有Crenarchaeota和Euryarchaeota被檢測出來。其中，Bacteroidetes，Propionibacterineae與Frankineae僅在endosome層中被檢測到，Planctomycetes和C