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文檔簡介
1、本研究采用AFLP標(biāo)記技術(shù)進(jìn)行花鱸、刀鱭、梭魚、棘頭梅童魚、大瀧六線魚、太平洋鯡魚和斑頭魚七種海洋魚類的群體遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性研究,并探討了花鱸和鱸魚、棘頭梅童魚和黑鰓梅童魚種間分化,得出了如下結(jié)論:
(1)對采自中國沿海的花鱸3個群體和日本沿海的鱸魚4個群體進(jìn)行了AFLP分析,結(jié)果表明日本有明海鱸魚群體的Nei遺傳多樣性指數(shù)和Shannon多樣性指數(shù)略高于其他6個群體的遺傳多樣性指數(shù),且都處于中等程度偏下水平;UPGM
2、A樹顯示來自中國的3個花鱸群體和來自日本的4個鱸魚群體分別聚類;花鱸兩兩群體的Fst值(0.084-0.140)和鱸魚兩兩群體之間的Fst值(0.045-0.153)明顯低于花鱸群體和鱸魚群體之間的Fst值(0.283-0.556);花鱸群體之間和鱸魚群體之間的基因流均大于1,而花鱸與鱸魚群體之間的基因流均小于1。因此,本研究的結(jié)果也支持中日鱸魚屬于不同物種這一結(jié)論。
(2)為進(jìn)一步分析中國沿海與日本沿海的刀鱭群體間遺傳分
3、化水平,本研究采用AFLP標(biāo)記技術(shù)對中日刀鱭群體的遺傳多樣性和群體遺傳結(jié)構(gòu)進(jìn)行了研究。UPGMA樹結(jié)果顯示日本兩個群體的所有個體在系統(tǒng)樹上形成了一個小的分支,但是整體上仍然與中國群體形成了一個大支;中國群體之間的Fst值以及日本群體之間的Fst值顯著小于中日群體之間的Fst值,中日刀鱭群體之間存在較為顯著的遺傳分化,但刀鱭中日種群間的遺傳分化指數(shù)遠(yuǎn)小于刀鱭與風(fēng)鱭之間的遺傳分化指數(shù);研究結(jié)果顯示中日刀鱭群體問的基因交流可能十分有限。
4、> (3)對來自中日沿海的8個地理群體的91尾梭魚樣品進(jìn)行了AFLP分析,從核基因角度探討梭魚不同地理群體的遺傳變異,結(jié)果顯示梭魚群體的多態(tài)位點比例僅為22.73%-38.46%,相對較低;UPGMA聚類樹顯示梭魚8個群體分為兩個不同的地理組群,南方群體和北方群體,南方群體包括珠江和云林群體,北方群體包括其余的6個群體;兩兩群體之間的遺傳分化指數(shù)Fst也顯示南方群體與北方群體存在較大的遺傳分化,暗示其分布范圍內(nèi)的南海海區(qū)群體與北方
5、群體(包括東海、黃渤海和日本沿海)存在較大的遺傳分化;研究結(jié)果認(rèn)為梭魚線粒體所揭示的3個支系不是代表了3個隱蔽種,而南北兩個群體可能代表兩個隱蔽種。
(4)石首魚科是自上新世至今十分繁盛的海洋魚類,廣泛分布于熱帶、亞熱帶的近海水域。本研究以黑鰓梅童魚為外群,對采自中國沿海的棘頭梅童魚5個地理群體進(jìn)行了AFLP分析,同時探討兩種梅童魚種間遺傳差異,研究結(jié)果顯示,棘頭梅童魚60個個體中共擴(kuò)增出458條清晰的條帶,多態(tài)位點比例為
6、95.85%;兩種梅童魚UPGMA聚類樹的結(jié)果表明兩種梅童魚明顯分為兩個支,在棘頭梅童魚5個群體中,舟山和上海聚為一支,溫州和廈門聚為一支,最后與深圳聚為一支;棘頭梅童魚5個群體之間的遺傳分化指數(shù)均較大,從0.1648(舟山和上海)到0.3074(深圳和上海);5個群體問的基因流系數(shù)均遠(yuǎn)小于1,表明各個群體間基因流受阻;研究結(jié)果支持棘頭梅童魚與黑鰓梅童魚為2種不同的梅童魚的觀點,并認(rèn)為棘頭梅童魚不同地理群體之間的基因交流非常有限。
7、> (5)針對線粒體DNA和微衛(wèi)星研究結(jié)果的差異,采用AFLP標(biāo)記技術(shù)對采自中國沿海的5個地理群體以及日本沿海1個地理群體的大瀧六線魚進(jìn)行補充研究。結(jié)果顯示日本青森群體的Nei遺傳多樣性指數(shù)和Shannon遺傳多樣性指數(shù)最高,丹東群體最低;UPGMA聚類樹的結(jié)果顯示大瀧六線魚的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)比較簡單,雖然存在兩個分支,但是沒有檢測到與采樣地點相對應(yīng)的分支;兩兩群體的Fst值較小,僅為0.016-0.122;基于Fst值計算兩兩群體之間的
8、基因流,結(jié)果顯示每組基因流都大于1,并且有5組群體之間的基因流都大于4;AFLP標(biāo)記技術(shù)的研究結(jié)果支持大瀧六線魚是一個隨機(jī)交配的群體。
(6)采用AFLP標(biāo)記技術(shù)對采自整個分布范圍的太平洋鯡魚開展了分子系統(tǒng)地理學(xué)研究。8個群體的遺傳多樣性指數(shù)都比較相近,并無明顯差異;UPGMA樹結(jié)果顯示所有個體分為兩大支,其中一支由希托克島的個體組成,另一支由其他七個群體組成,除鄂霍次克海群體存在一個小的分支外,不同的地理群體間無明顯的分
9、支,存在一定程度的交叉;托克島群體與其他群體的遺傳分化指數(shù)Fst較大,西勘察加與石狩灣群體之間的遺傳分化指數(shù)最??;兩兩群體之間的基因流的計算結(jié)果顯示希托克島群體與其他群體的基因流均小于1,而其他兩兩群體之間的基因流均大于1。本研究結(jié)果支持其他學(xué)者的分支A起源于西北太平洋某處避難所、而分支B應(yīng)該位于東太平洋避難所的結(jié)論。
(7)對采自中國青島和威海俚島近海的兩個斑頭魚群體進(jìn)行了AFLP比較分析。結(jié)果顯示兩群體的遺傳多樣性指數(shù)
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