香菇分子遺傳圖譜構(gòu)建及漆酶活性QTL的定位.pdf

1、以香菇(Lentinula edodes)的兩個(gè)栽培品種武香1號和L205各自的單孢W26和L6進(jìn)行雜交(W26×L6)，獲得的146個(gè)單孢作為遺傳分離群體。運(yùn)用SSR、Indel、CAPS分子標(biāo)記對香菇遺傳分離群體進(jìn)行PCR擴(kuò)增分析：從151對SSR引物中篩選得到38對具有多態(tài)性條帶的引物；在38對Indel引物中篩選得到17對具有較高多態(tài)性條帶的引物；在83對CAPS引物中，則僅有1對引物具有較高的多態(tài)性。
　　 將本研究中

2、篩選得到的56對引物，對本實(shí)驗(yàn)室前期構(gòu)建的分子遺傳連鎖圖進(jìn)行標(biāo)記加密。利用Joinmap作圖軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析，構(gòu)建了一個(gè)包含有571個(gè)標(biāo)記，11個(gè)連鎖群的香菇分子遺傳連鎖圖譜。圖譜總長度為967 cM，連鎖群的大小在22cM～233 cM之間，平均大小為87.9 cM；標(biāo)記間的距離在0～21 cM，標(biāo)記間的平均距離為1.87 cM。本實(shí)驗(yàn)中篩選到有10個(gè)分子標(biāo)記定位到連鎖群中，其中SSR分子標(biāo)記僅有一個(gè)，其余9個(gè)為Indel分子標(biāo)記，其

3、余46個(gè)分子標(biāo)記則有可能位于端?；蛑z粒位置。本實(shí)驗(yàn)所構(gòu)架的香菇高密度分子遺傳連鎖圖譜在2 cM、5 cM、10 cM以內(nèi)，一個(gè)標(biāo)記的覆蓋度分別為80.1%、98.2%、99.9%。
　　 利用上述圖譜對香菇漆酶活性進(jìn)行QTL定位研究。結(jié)果表明，與香菇單核體漆酶酶活性相關(guān)的QTL共有7個(gè)，其中漆酶酶活性總平均值定位到兩個(gè)QTL為qLac1和qLac2。qLac1位于LG3中約49.6 cM處，貢獻(xiàn)率為9.21%；qLac2位于L

4、G6中約42.4 cM處，貢獻(xiàn)率為8.95%。這兩個(gè)QTL均具有負(fù)的加性效應(yīng)，總貢獻(xiàn)率為18.16%。第5d的漆酶活性值定位到兩個(gè)QTL位為qLac5-1和qLac5-2。qLac5-1位于LG6中約40.6 cM處，貢獻(xiàn)率為9.73%；qLac5-2則位于LG6中約48.4 cM處，貢獻(xiàn)率為9.04%。這兩個(gè)QTL均具有負(fù)的加性效應(yīng)，總貢獻(xiàn)率為18.77%。第15d的漆酶活性值定位到一個(gè)QTL qLac15-1。qLac15-1位于L

5、G7中約43.4 cM處，具有正的加性效應(yīng)，貢獻(xiàn)率為11.51%。第20 d的漆酶活性值定位到兩個(gè)QTL為qLac20-1和qLac20-2.qLac20-1位于LG7中約35.0 cM處，具有正的加性效應(yīng)，貢獻(xiàn)率為65.53%；qLac20-2則位于LG7中約57.7 cM處，該QTL具有負(fù)的加性效應(yīng)，貢獻(xiàn)率為17.63%。
　　 利用SSR，Indel，CAPS分子標(biāo)記對香菇分子遺傳圖譜進(jìn)行了加密，獲得了高密度分子遺傳連鎖圖