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文檔簡介
1、楊樹是我國發(fā)展人工林的主要栽培樹種之一,是重要的工業(yè)原料,黑楊是其中較大的一組,經濟價值和遺傳價值極高,而三倍體黑楊相對于二倍體黑楊具有生長速度快,植株更為高大粗壯等生長優(yōu)勢。由于林木遺傳背景復雜,因此相關的基礎研究滯后,楊樹基因組測序的完成,給楊樹的研究帶來了前所未有的契機。microRNA(miRNA)是一類主要在轉錄后水平上調節(jié)基因表達的非編碼小分子RNA,長度多數為19~25 nt。研究表明miRNA在植物的生長發(fā)育、對環(huán)境條件
2、的脅迫應答及其它生理生化反應中均起著重要的調控作用。
本研究以二倍體及三倍體黑楊的幼嫩的葉片和老葉片為材料,利用高通量測序技術、頸環(huán)引物反轉錄法,實時定量PCR技術、轉基因技術及生物信息學方法,對一些與生長發(fā)育相關的miRNA的表達和功能進行初步研究,試圖從miRNA的角度對黑楊多倍體優(yōu)勢形成的機理進行分析。主要結果如下:
(1)利用新一代測序技術,對黑楊二倍體和三倍體進行小RNA測序,一共獲得來自110個家
3、族的773個miRNA,其中三倍體黑楊特有的miRNA為284個,二倍體黑楊特有的125個,在二倍體、三倍體共有的364個miRNA中,黑楊三倍體中表達量大于二倍體(2x vs.3x<1)的共有132個,占到總數的36%,小于二倍體(2x vs.3x>1)的有184個,比例為51%,表達量相同的為48個,比例為13%。二倍體和三倍體中新預測的miRNA10個;
(2)利用RT-qPCR檢測了miR159、miR164、mi
4、R167、miR171、miR319在黑楊二倍體和三倍體中的表達情況。所有的檢測對象在不同部位都有表達,表達模式均與測序結果一致,其中miR159、miR167、miR171、miR319在三倍體幼葉中高表達。miR164的在老葉中高表達。暗示這些miRNA與三倍體速生性狀形成相關。
(3)成功構建了miR164兩個前體及一條在二倍體與三倍體中共有的新miRNA前體過表達載體,通過農桿菌介導法成功轉入擬南芥中,得到轉基因植
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