中國奶山羊遺傳多樣性的微衛(wèi)星分析.pdf

1、為了研究中國奶山羊遺傳多樣性，應(yīng)用聯(lián)合國糧農(nóng)組織所推薦和本實(shí)驗(yàn)室研究證實(shí)具有良好多態(tài)性的15 對微衛(wèi)星引物并結(jié)合熒光PCR 技術(shù)，對6個(gè)中國奶山羊品種進(jìn)行了遺傳多樣性檢測。分析了中國培育品種嶗山奶山羊、文登奶山羊、西農(nóng)薩能奶山羊和關(guān)中奶山羊，引進(jìn)品種薩能奶山羊和努比亞奶山羊的遺傳多樣性，并分析了六個(gè)種群間的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系。通過遺傳學(xué)分析軟件Molkin 3.0、FSTAT(Version 2.9.3.2)和POPGENE1.32分析，用M

2、EGA5.1 繪制了系統(tǒng)發(fā)育樹，結(jié)果表明：
　　 1、所選15個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)等位基因數(shù)除BMS0812 外都在7個(gè)以上，只有BMS0812為中度多態(tài)，其余為高度多態(tài)。所有位點(diǎn)平均PIC 為0.7243，不同基因座的等位基因數(shù)差異較大，所檢測等位基因數(shù)在3 ～ 29之間，各位點(diǎn)平均有效等位基因數(shù)在1.9173(BMS0812)～9.4839(INRA011)間，與有效等位基因數(shù)相差較大，表明等位基因分布不均勻，可能與人工選育有關(guān)。平

3、均為11.26個(gè)，其中CSSM66、BMS1248和基因座INRA011等位基因數(shù)均達(dá)15個(gè)以上，所選15個(gè)微衛(wèi)星多態(tài)性比較好。
　　 2、所有奶山羊品種所有微衛(wèi)星基因座上共檢測到169個(gè)等位基因，其中有效等位基因73.72個(gè)，占43.62％。所有品種雜合度都比較高，說明種群受選擇、突變和遺傳漂變等因素的綜合影響較大。比較而言文登和嶗山奶山羊觀察雜合度低于期望雜合度，表明群體中純合子個(gè)體較多，說明兩品種培育時(shí)間晚，種群受選擇、突

4、變和遺傳漂變等因素影響小。而薩能奶山羊、努比亞奶山羊、西農(nóng)薩能奶山羊和關(guān)中奶山羊觀察雜合度高于期望雜合度，表明群體中雜合子個(gè)體較多。
　　 3、種群間遺傳分化及分化時(shí)間，所有奶山羊品種中總自共祖系數(shù)為0.6433，亞群內(nèi)平均共祖系數(shù)0.2871，近交系數(shù)為0.2865，F(xiàn)IS、FST和FIT值分別為0.0009、0.0752和0.0745。
　　 FIS 為正值，說明所研究的群體均處于雜合度缺失狀態(tài)，存在不同程度近交現(xiàn)象

5、；FST 在0.05-0.15之間，說明6個(gè)奶山羊群體之間呈中等遺傳分化。通過Nei 氏最小遺傳距離計(jì)算的分化年限，六個(gè)奶山羊品種中，文登奶山羊與嶗山奶山羊的分化時(shí)間為561年，西農(nóng)薩能奶山羊和關(guān)中奶山羊的分化時(shí)間為602年，說明品種間遺傳分化時(shí)間較短。西農(nóng)薩能奶山羊和努比亞奶山羊分化時(shí)間為2560年，薩能奶山羊和努比亞奶山羊分化時(shí)間為2460，表明它們的遺傳分化時(shí)間較長。通過共祖遺傳距離計(jì)算的分化時(shí)間在3209-4261之間。

6、　　 4、基于Nei 氏最小遺傳距離用UPGMA法構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)生樹，文登奶山羊先和嶗山奶山羊聚為一類，西農(nóng)薩能奶山羊和關(guān)中奶山羊聚為一類，然后又和薩能奶山羊聚為一類，最后與努比亞奶山羊聚為一類?；赗eynolds 遺傳距離繪制的系統(tǒng)發(fā)育圖與其相似?；谟H緣距離繪制的UPGMA系統(tǒng)發(fā)育圖得到，西農(nóng)薩能奶山羊和關(guān)中奶山羊的親緣距離最近，先聚為一類，親緣距離為0.3572，文登奶山羊與嶗山奶山羊、薩能奶山羊的親緣距離接近，分別為0.421

7、5和0.4346。基于分子共祖遺傳距離繪制的UPGMA系統(tǒng)發(fā)育圖表明，西農(nóng)薩能奶山羊和努比亞奶山羊共祖距離最小，為0.1765；西農(nóng)薩能和關(guān)中奶山羊共祖距離最大，為0.2344，文登奶山羊和嶗山奶山羊的共祖距離為0.2339。
　　 綜上所述，所選用的15個(gè)微衛(wèi)星座位多態(tài)信息含量高，可作為有效遺傳標(biāo)記用于品種間遺傳多樣性和系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系的分析。基于微衛(wèi)星標(biāo)記構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹表明奶山羊品種間遺傳進(jìn)化和親緣關(guān)系明確，遺傳距離大小與地理