鯉魚(yú)遺傳圖譜構(gòu)建及其相關(guān)性狀的QTL檢測(cè).pdf

1、采用磁珠富集法構(gòu)建鯉魚(yú)（Cyprinus carpio）三、四核苷酸重復(fù)微衛(wèi)星序列，設(shè)計(jì)并篩選出能夠在鯉魚(yú)基因組穩(wěn)定擴(kuò)增和具有多態(tài)性的多個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記。利用這些微衛(wèi)星標(biāo)記，以在表型性狀上具有明顯差異的荷包紅鯉（Cyprinus carpio var.wananensis）抗寒品系和柏氏鯉（Cyprinus pellegnini pellegnini Tchang）的F2為作圖群體，構(gòu)建鯉魚(yú)遺傳連鎖圖譜并對(duì)乳酸脫氫酶（LDH）活性和超氧化物

2、歧化酶（SOD）活性性狀進(jìn)行了QTL檢測(cè)。研究的主要結(jié)果如下： 1.鯉魚(yú)三、四核苷酸微衛(wèi)星引物的開(kāi)發(fā) 采用磁珠富集法和放射性雜交相結(jié)合建鯉魚(yú)（Cyprinus carpio）三、四核苷酸重復(fù)微衛(wèi)星序列，設(shè)計(jì)并合成微衛(wèi)星引物145對(duì)，篩選出112對(duì)具有多態(tài)性和穩(wěn)定擴(kuò)增的微衛(wèi)星引物。 2.遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建 利用Onemap軟件對(duì)篩選出的202個(gè)多態(tài)性標(biāo)記進(jìn)行連鎖分析，構(gòu)建出一個(gè)鯉魚(yú)連鎖圖譜。鯉魚(yú)連鎖圖譜有1

3、04個(gè)標(biāo)記（66個(gè)SSR，38個(gè)EST-SSR）定位到35個(gè)連鎖群上，其余98個(gè)標(biāo)記沒(méi)有定位到連鎖群上。該圖譜總長(zhǎng)度為869.8cM，標(biāo)記間平均距離為12.61cM。每個(gè)連鎖群含2～13個(gè)標(biāo)記，連鎖群長(zhǎng)度為0.6cM～151.8cM，各連鎖群平均圖距為0.55cM～30.1cM。 3.鯉魚(yú)乳酸脫氫酶（LDH）活性和超氧化物歧化酶（SOD）活性性狀進(jìn)行了QTL檢測(cè) 通過(guò)多態(tài)性微衛(wèi)星標(biāo)記與乳酸脫氫酶（LDH）活性和超氧化物歧

4、化酶（SOD）活性性狀QTL檢測(cè)，結(jié)果表明：HLJE222等12個(gè)座位與乳酸脫氫酶（LDH）活性性狀顯著相關(guān)（P<0.05），可解釋的表型變異型為4.00％～10.00％，其中HUE222座位與該性狀極顯著相關(guān)（P<0.01），可解釋的表型變異型為10.00％；HLJE599和HLJ1496這2個(gè)座位與超氧化物歧化酶（SOD）活性性狀顯著相關(guān)（P<0.05），可解釋的表型變異型為4.00％～6.00％，說(shuō)明這兩個(gè)座位可能與影響超氧化物歧

5、化酶（SOD）活性相關(guān)的基因連鎖。 4.檢測(cè)結(jié)果分析 利用已有的生物信息學(xué)工具，將相關(guān)的EST-SSR標(biāo)記與公共數(shù)據(jù)庫(kù)中的核酸序列以及已知蛋白序列進(jìn)行同源搜索分析，結(jié)果發(fā)現(xiàn)與鯉魚(yú)乳酸脫氫酶活性極顯著相關(guān)的EST（HLJE222），與斑馬魚(yú)DAZassociatedprotein1，mRNA相匹配，DAZ蛋白是一種短鏈的脫氫酶，是生物體細(xì)胞內(nèi)糖代謝過(guò)程的重要酶。這說(shuō)明此基因座與控制乳酸脫氫酶活性相關(guān)的基因連鎖，進(jìn)一步證明本