大眼鱖3個野生群體的形態(tài)特征及遺傳多樣性研究.pdf

1、大眼鱖（Siniperca kneri）隸屬鱸形目（Perciformes）、鮨科（Serranida）、鱖亞科（Sinipercinae）、鱖屬（Siniperca），俗稱桂花魚、白桂等，分布于中國長江、淮河及其以南水系，為中國南方特有種，其生長速度稍慢于翹嘴鱖（Siniperca chuatsi），而快于其它鱖類，其肉質(zhì)細(xì)膩、味道鮮美、營養(yǎng)豐富，是我國重要的名優(yōu)養(yǎng)殖魚類。貴州位于滇東高原到湘西丘陵之間的過渡地帶，地處長江和珠江的上游

2、，屬典型的喀斯特山地地貌，大眼鱖廣泛分布于長江流域的烏江、赤水河，錦江河、松桃河、清水江，珠江流域的都柳江和紅水河，是當(dāng)?shù)刂匾囊吧?jīng)濟(jì)魚類，資源正受到嚴(yán)重威脅。目前，我省國家級水產(chǎn)種質(zhì)資源保護(hù)區(qū)內(nèi)野生大眼鱖群體仍缺乏最基本的形態(tài)學(xué)參數(shù)，遺傳結(jié)構(gòu)及多樣性等背景資料仍知之甚少，資源優(yōu)勢未發(fā)揮其應(yīng)有的經(jīng)濟(jì)效益。本文基于傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)數(shù)據(jù)和框架測量數(shù)據(jù)、線粒體 DNA細(xì)胞色素 C氧化酶亞基Ⅰ基因（Cytochrome coxidase subun

3、it I, COI）片段、控制區(qū)全序列及核DNA ITS-1（First ribosomal internal transcribed spacer，ITS-1）全序列，對我省屬長江水系和珠江水系大眼鱖三個種群的形態(tài)差異性和遺傳多樣性進(jìn)行研究。
　　本研究主要結(jié)果如下：
　　1、結(jié)合傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)法和框架分析法，運用多元分析方法對貴州境內(nèi)烏江沿河段、錦江銅仁段、北盤江關(guān)嶺段大眼鱖3個群體的形態(tài)差異進(jìn)行了比較研究。結(jié)果表明：可數(shù)現(xiàn)

4、狀中，銅仁群體與沿河群體只在臀鰭條數(shù)上存在差異極顯著；銅仁群體與關(guān)嶺群體在胸鰭數(shù)、臀鰭數(shù)和尾鰭數(shù)上存在極顯著差異；沿河群體與關(guān)嶺群體在胸鰭數(shù)、腹鰭數(shù)和尾鰭數(shù)上存在極顯著差異。比例性狀顯示，銅仁群體眼最小，吻部最長，身體最矮；沿河群體眼最大，且左右兩眼間的距離最近，體型最薄，尾柄最短；關(guān)嶺群體的體型最高而且最厚，吻最短，眼間距最大，尾柄最長。聚類分析中，銅仁群體與沿河群體首先聚在一起，表明他們外部形態(tài)較為接近，而關(guān)嶺群體單獨聚為一支。以逐

5、步分析方法建立了3個大眼鱖群體的判別函數(shù)，綜合判別準(zhǔn)確率達(dá)91.2％。主成分篩選出在頭部、吻長、軀干部和尾部這些與攝食和游泳密切相關(guān)的性狀，其差異與比例性狀在3個群體間差異的結(jié)果一致。綜合研究結(jié)果顯示：銅仁群體與沿河群體外形較為相似，而他們與關(guān)嶺群體形態(tài)差異較大，地理分布的距離遠(yuǎn)近和環(huán)境差異是其外形變異的驅(qū)動因子。
　　2、采用PCR技術(shù)對169尾個體的線粒體DNA COI基因進(jìn)行擴(kuò)增、測序，獲得的序列長度為1512bp。分析顯示

6、：堿基A、T、C、G的平均含量分別為24.9%、28.6%、28.7%、17.8%，其中A+T（53.5%）含量高于G+C（46.5%）含量。169個樣本共檢測到5個多態(tài)位點，并定義了5種單倍型。對貴州的大眼鱖群體COI基因與洞庭湖大眼鱖COI基因序列進(jìn)行序列差異分析，結(jié)果顯示兩者之間存在10個變異位點，集中在1268nt-1456nt之間。大眼鱖3個群體間4種堿基在密碼子3個位點上的使用頻率無差別，與洞庭湖大眼鱖相比，密碼子第一位上的

7、4種堿基含量差別不大，密碼子第二位上T含量（40.9%）高于后者（39.9%），而A和C含量則低于后者；與洞庭湖翹嘴鱖比較差別很小，但與斑鱖、暗鱖、長體鱖和波紋鱖4種鱖魚比較，在密碼子第一位和第三位存在不同差異，特別是暗鱖和波紋鱖密碼子第三位中A含量（30.0%）明顯低于貴州的大眼鱖（31.8%），而波紋鱖G（8.9%）明顯高于后者（7.3%）。大眼鱖3個群體的平均單倍型多樣性為0.395，平均核苷酸多樣性為0.00029，遺傳多樣性貧

8、乏。
　　3、運用PCR技術(shù)和DNA測序技術(shù)對大眼鱖3個群體的線粒體DNA控制區(qū)序列進(jìn)行分析，結(jié)果顯示：3個群體的序列長度為828-833bp，序列差異小；群體間各堿基含量差異很小，其中A含量最高，G含量最低，A+T含量都明顯高于C+G含量；沿河群體檢測到13個堿基替換，其他兩個群體無堿基的替換；3個群體存在13個多態(tài)位點，并定義了5種單倍型，Hap1為3個群體共享單倍型，代表174個個樣本，占總樣本數(shù)的92%；沿河大眼鱖群體的單

9、倍型多樣性（Hd）和核苷酸多樣性指數(shù)（Pi）都高于其他兩個群體。總體上看大眼鱖3個群體的遺傳多樣性貧乏，銅仁大眼鱖群體與沿河大眼鱖群體有一定的基因交流，遺傳分化水平適中，而關(guān)嶺大眼鱖群體與它們因地理阻隔缺乏交流。
　　4、大眼鱖3個群體共151個體的ITS-1序列分析結(jié)果顯示：3個大眼鱖群體存在序列長度多態(tài)性，主要有753bp和755bp兩種類型，GC（72.8%）平均含量遠(yuǎn)高于AT含量（27.3）；共檢測到6個多態(tài)位點，產(chǎn)生6種

10、單倍型；3個群體各自都表現(xiàn)出較低的遺傳多樣性水平，從總體上看，單倍型多樣性指數(shù)為0.622，表明貴州大眼鱖群體的遺傳多樣性較豐富。在貴州大眼鱖ITS-1序列中發(fā)現(xiàn)(GC)n、(CT)n、(CG)n、(TCG)n4種微衛(wèi)星序列，其中(GC)n出現(xiàn)的頻率最高。3個群體間銅仁大眼鱖群體與沿河大眼群體遺傳分化小，有基因交流，而關(guān)嶺大眼鱖群體與銅仁大眼鱖群體和沿河大眼群體間，遺傳分化大且缺乏基因交流。
　　總之，貴州國家級水產(chǎn)種質(zhì)保護(hù)區(qū)內(nèi)3