河北省6個(gè)黑豬群體的遺傳多樣性分析.pdf

1、河北省是中國(guó)地方豬的起源地之一。隨著社會(huì)經(jīng)濟(jì)的發(fā)展，這些地方豬品種逐漸衰亡，只有少量黑豬零散分布。近年來，隨著特色畜產(chǎn)品的興起，河北省的黑豬養(yǎng)殖規(guī)模有所增加，但迄今為止，對(duì)于河北省地方豬遺傳資源現(xiàn)狀缺乏了解和研究。為了解河北省黑豬群體養(yǎng)殖狀況及遺傳資源多樣性現(xiàn)狀，以便更有效地對(duì)地方豬品種資源開展保護(hù)和開發(fā)利用。從2014年起，對(duì)河北省黑豬群體狀況開展調(diào)查，采用分層隨機(jī)抽樣法采集了6個(gè)縣（石家莊辛集、保定易縣、唐山遵化、廊坊霸州、張家口沽

2、源、承德圍場(chǎng)）的黑豬樣品。利用微衛(wèi)星標(biāo)記及mtDNA D-loop區(qū)兩種分子標(biāo)記對(duì)河北省6個(gè)黑豬群體的遺傳多樣性進(jìn)行分析。
　　在調(diào)查中發(fā)現(xiàn)，河北省境內(nèi)黑豬群體普遍規(guī)模較小，純種公豬數(shù)量極少，血統(tǒng)不清，群中雜種個(gè)體多，但在體型外貌上與地方豬相似。
　　微衛(wèi)星位點(diǎn)研究結(jié)果顯示河北省6個(gè)黑豬群體共計(jì)152個(gè)個(gè)體在27對(duì)微衛(wèi)星位點(diǎn)中共檢測(cè)到247個(gè)等位基因，平均每個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)上的等位基因數(shù)為9.15個(gè)，等位基因數(shù)最多的位點(diǎn)為S00

3、68，等位基因數(shù)有13個(gè)，等位基因數(shù)最少的位點(diǎn)為S0002，只有1個(gè)等位基因;27個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)在6個(gè)群體中的觀察等位基因數(shù)在1～12范圍之間，有效等位基因數(shù)在1.0000～9.8462范圍之間，有效等位基因數(shù)低于觀察等位基因數(shù)，說明等位基因在群體中的分布不均勻;6個(gè)群體的觀察雜合度(0.1747～0.3090)，期望雜合度(0.5285～0.7591)，多態(tài)信息含量(0.5029～0.7275)，說明黑豬群體具有豐富的遺傳多樣性。F-統(tǒng)

4、計(jì)量結(jié)果顯示6個(gè)群體中在27個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的Fis、Fit均大于0，說明6個(gè)黑豬群體內(nèi)有不同程度的近交;Fst值為0.1528，說明6個(gè)黑豬群體的分化程度較高。
　　mtDNA D-loop的研究結(jié)果顯示6個(gè)黑豬群體的mtDNA D-loop區(qū)A+T(55.25％)顯著高于C+G(44.73％)含量;比對(duì)后共發(fā)現(xiàn)53個(gè)變異位點(diǎn)，31種單倍型;單倍型多樣性和核苷酸多樣性的范圍在0.523～0.910、0.00056～0.00730，說

5、明群體有較豐富的遺傳多樣性;Fst在-0.008～0.246范圍之間，其中群體1和3、群體2和3、群體2和4、群體3和4分化指數(shù)為負(fù)數(shù)以及群體1和2、群體3和5接近0，說明群體內(nèi)部的差異要大于群體間的差異，其他群體間的遺傳分化指數(shù)較高。
　　在對(duì)6個(gè)黑豬群體的分析結(jié)果基礎(chǔ)上，提出群體1、4、6可擴(kuò)大血統(tǒng)數(shù)以延緩群體的近交狀態(tài)，由于群體2、3、5較雜，可開展針對(duì)性選育，提高群體的一致性。
　　由以上研究結(jié)果得出以下結(jié)論，發(fā)現(xiàn)的