5個(gè)鯉群體的遺傳多樣性分析和分子標(biāo)記的篩選.pdf

1、鯉是鯉形目(Cypriniformes)、鯉科(Cyprinidae)、鯉亞科(Cyprinae)中的一種廣泛分布于我國(guó)黑龍江、黃河、長(zhǎng)江流域等全國(guó)各淡水水域的經(jīng)濟(jì)魚類。鯉在我國(guó)具有悠久的養(yǎng)殖歷史和重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值，無(wú)論是天然種群還是養(yǎng)殖品種，年產(chǎn)量遠(yuǎn)超過(guò)其它魚類。但是由于盲目的開發(fā)利用，許多重要的鯉養(yǎng)殖種類的種質(zhì)資源遭到破壞。黃河鯉(Cyprinus.carpio haematopterus Temminck et Schlegel)、

2、黑龍江野鯉(C.carpiohaematopter us)、荷包紅鯉(C.carpio var.wuyuanensis)、興國(guó)紅鯉(C.carpio var.xingguonensis)和建鯉(C carpio va.jian)是我國(guó)中國(guó)鯉幾個(gè)具有代表性的養(yǎng)殖品種和野生種，在我國(guó)鯉魚遺傳育種研究中均占有非常重要的地位.
　　 本試驗(yàn)采用RAPD和微衛(wèi)星分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)荷包紅鯉、黃河鯉、建鯉、興國(guó)紅鯉和黑龍江野鯉等5個(gè)鯉群體的基因組

3、DNA進(jìn)行擴(kuò)增分析。在RAPD分析中，52個(gè)隨機(jī)引物中有36個(gè)引物擴(kuò)增出條帶，其中有28個(gè)引物能夠擴(kuò)增出清晰、穩(wěn)定的條帶，用以分析。在28個(gè)多態(tài)性隨機(jī)引物中共擴(kuò)增出4880個(gè)條帶，平均每個(gè)引物在每個(gè)個(gè)體中擴(kuò)增出3.68個(gè)條帶。位點(diǎn)總數(shù)為122個(gè)，多態(tài)位點(diǎn)數(shù)為107個(gè)，多態(tài)位點(diǎn)比例平均為89.50％.有效等位基因范圍為1.3262-1.4867;Shannon信息指數(shù)的范圍為0.2845-0.3903.5個(gè)鯉群體中，黃河鯉和黑龍江野鯉群體

4、間的遺傳相似性系數(shù)最大(0.9011)，建鯉和興國(guó)紅鯉群體間的遺傳相似性系數(shù)次之(0.8726)，黑龍江野鯉和興國(guó)紅鯉間的遺傳相似性系數(shù)最小(0.7993).
　　 在28個(gè)多態(tài)性引物中，引物S131在荷包紅鯉中擴(kuò)增出大小為1350bp的特異片段，而引物S472在建鯉和荷包紅鯉中擴(kuò)增出2050bp大小的特異片段。但是由于RAPD標(biāo)記的重復(fù)性和穩(wěn)定性較差，這在實(shí)際應(yīng)用中受到了一定的限制，需要更多的個(gè)體進(jìn)行驗(yàn)證。同時(shí)將RAPD標(biāo)記轉(zhuǎn)

5、化為SCAR標(biāo)記，獲得該兩群體的穩(wěn)定的DNA片段標(biāo)記，這對(duì)鯉種質(zhì)資源的鑒定和對(duì)遺傳資源的保護(hù)具有重要的意義.
　　 在運(yùn)用微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù)對(duì)5個(gè)鯉群體的遺傳多樣性進(jìn)行分析時(shí)，15對(duì)微衛(wèi)星引物中有6對(duì)能較好的擴(kuò)增出特異條帶，經(jīng)電泳檢測(cè)后，表現(xiàn)出清晰的片段大小和一定的多態(tài)性.微衛(wèi)星標(biāo)記在各群體中檢測(cè)到的有效等位基因數(shù)在1.2857-1.5096之間，平均值為1.3967.Shannon信息指數(shù)在0.3537-0.5554之間.各群體的

6、平均觀測(cè)雜合度在0.2222-0.3833之間，期望觀測(cè)雜合度在0.1904-0.3119.
　　 將SSR和RAPD的實(shí)驗(yàn)結(jié)果結(jié)合起來(lái)分析，結(jié)果發(fā)現(xiàn)，在5個(gè)鯉群體中，多態(tài)位點(diǎn)的比例從大到小依次是：黃河鯉(63.57％)、荷包紅鯉(61.43％)、建鯉(60.00％)、興國(guó)紅鯉(53.57％)和黑龍江野鯉(53.57％).5個(gè)鯉群體的Nei's遺傳多樣性指數(shù)和Shannon指數(shù)的大小順序?yàn)椋汉砂t鯉（兩個(gè)指數(shù)分別為0.2419和