幾種鯉魚遺傳多樣性分析和松浦鏡鯉分子輔助育種標(biāo)記篩選.pdf

1、本文首先利用SPSS13.0分析軟件對194尾松浦鏡鯉的體重、體長和尾長值進(jìn)行相關(guān)分析，并選用擴(kuò)增效果好的30個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記，檢測新品種松浦鏡鯉繁殖群體的有效等位基因數(shù)(Ne)、觀測雜合度(Ho)、期望雜合度(He)、多態(tài)信息含量(PIC)等遺傳參數(shù)，以卡方檢驗(yàn)估計(jì)群體Hardy～Weinberg平衡，最后還將30個(gè)基因座的不同基因型與個(gè)體的體重、體長和尾長進(jìn)行了相關(guān)分析。結(jié)果顯示，體重與體長高度線性相關(guān)，差異極顯著；尾長與體重、體長分別

2、呈顯著相關(guān)，差異顯著。多樣性指數(shù)結(jié)果表明共檢測到172個(gè)等位基因，片段長度在115～432bp之間，有效等位基因數(shù)為1.14～5.32；觀測雜合度為0.07～0.92，期望雜合度為0.13～0.91；多態(tài)信息含量為0.12～0.79，其中高度多態(tài)(PIC≥0.5)21個(gè)，中度多態(tài)(0.25≤PIC≤0.5)7個(gè)，表明這個(gè)群體的多樣性較高，信息含量比較豐富。研究還發(fā)現(xiàn)有4個(gè)遺傳位點(diǎn)：HLJ328、HLJ693、MFW29和MFW48與體長

3、性狀顯著相關(guān)(P<0.05)，其中，位點(diǎn)HLJ328、HLJ693和MFW48還與體重性狀顯著相關(guān)(P<0.05)，未發(fā)現(xiàn)與尾長性狀相關(guān)的位點(diǎn)。本文獲得的這些標(biāo)記具有生長特性優(yōu)勢，可作為松浦鏡鯉分子輔助育種的參考標(biāo)記。
　　 根據(jù)NCBI已公布的鯉魚MHCⅡB基因序列，設(shè)計(jì)一對特異性引物，采用PCR～SSCP方法對松浦鏡鯉魚及其他5種鯉魚群體MHCⅡB基因第3外顯子108bp擴(kuò)增片段進(jìn)行多態(tài)性分析，結(jié)果共獲得7種基因型(A～G)

4、，其中基因型為B型的個(gè)體數(shù)占所有群體總個(gè)體數(shù)的47.45％，且分布于所有群體，其它6種基因型出現(xiàn)頻率范圍為1.1％～17.15％。回收不同基因型的片段并測序，經(jīng)比對共發(fā)現(xiàn)4個(gè)堿基多態(tài)位點(diǎn)和3個(gè)氨基酸多態(tài)位點(diǎn)。易捕鯉和大頭鯉兩群體中各發(fā)現(xiàn)4個(gè)突變位點(diǎn)(占3.7％)；松荷鯉、松浦鯉和德國鏡鯉群體各發(fā)現(xiàn)3個(gè)突變位點(diǎn)(占2.7％)；松浦鏡鯉群體僅發(fā)現(xiàn)2個(gè)突變位點(diǎn)(占1.8％)。通過Popgene軟件計(jì)算出每個(gè)群體不同位點(diǎn)的雜合度和多態(tài)信息含量(