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![葉籽銀杏葉生雌性生殖器官發(fā)育相關基因的克隆與序列分析.pdf_第1頁](https://static.zsdocx.com/FlexPaper/FileRoot/2019-3/1/9/de03fd90-bdec-4e12-9e87-377ebbcd3340/de03fd90-bdec-4e12-9e87-377ebbcd33401.gif)
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文檔簡介
1、銀杏(Ginkgo biloba L.)系第四紀冰川之后惟一在中國保存下來的一孑遺種子植物。在其漫長的演化歷程中,銀杏的種子和葉片發(fā)生了明顯的形態(tài)變異。1891年,Shirai在日本發(fā)現(xiàn)了世界上第一株葉籽銀杏(Ginkgobiloba L.var.epiphylla Mak.)。作為銀杏家族中的特異種質(zhì),葉籽銀杏具有重要的觀賞價值和科研價值。本實驗室已對葉籽銀杏的分類地位和系統(tǒng)發(fā)育進行了研究,然而對于葉籽銀杏的發(fā)生機制還沒有確切的定論。
2、
本研究以葉籽銀杏和銀杏為研究試材,對其LEAFY同源基因和GbMADS5基因進行了克隆、分析。主要研究結(jié)果如下:
1.利用改良的CTAB法提取葉籽銀杏和銀杏的基因組DNA。經(jīng)電泳檢測,片段大小在23kb左右,DNA帶整齊清晰,沒有明顯拖尾,提取的DNA純度較高。用CTAB大量法提取葉籽銀杏的RNA,電泳檢測顯示,28SRNA和18SRNA電泳條帶清晰,不拖尾,并且28SRNA的亮度高于18SRNA的亮度,表
3、明RNA完整性較好,沒有降解。能用于分子克隆等后繼分子生物學實驗。
2.用RT-PCR擴增的葉籽銀杏GinLFYcDNA序列編碼區(qū)全長為1209bp,用DNmman軟件分析該序列顯示其編碼402個氨基酸,將該序列在GeneBank上注冊,注冊序列號為:GU563897。經(jīng)BLAST分析表明,葉籽銀杏GinLFY的cDNA序列與輻射松的PRFLL基因同源性是85%,羅漢松LEAFY基因的同源性為82%。與已注冊銀杏雌株的Gi
4、nLFY基因核苷酸序列及氨基酸序列的同源性都高達99%。葉籽銀杏的GinLFY基因組序列全長為3455bp,與cDNA序列多重比對后,該基因組序列含有2個內(nèi)含子,3個外顯子,大小分別為479bp、404bp和326bp。
葉籽銀杏GinNdly cDNA序列編碼區(qū)全長為1209bp,用DNAman軟件分析該序列,編碼402個氨基酸。將該序列在GeneBank上注冊,注冊序列號為:GU563898。經(jīng)BLAST分析表明,葉籽
5、銀杏GinNdly cDNA序列與紅豆杉的NEEDLY-like基因,日本柳杉CjNdly基因,羅漢松的NEEDLY-like基因的同源性分別為:86%、83%、84%。與已注冊銀杏GinNdly基因核苷酸及氨基酸序列的同源性也都高達99%。葉籽銀杏的GinNdly基因組序列全長為1504bp,與cDNA序列多重比對后,該基因組序列也含有2個內(nèi)含子,3個外顯子,大小分別為:449bp、428bp和332bp。
3.測得的葉
6、籽銀杏GbMADS5基因序列含有666bp,將該序列在GeneBank上注冊,注冊序列號為:GU563899。序列分析表明該基因含有一個完整的開放閱讀框,編碼221個氨基酸,含有MADS區(qū)、I區(qū)、K區(qū)和C-末端,具有典型的MIKC型植物MADS-box基因結(jié)構(gòu)。同源性比較顯示,GbMADS5與蘇鐵AG、云杉DAL2、擬南芥AGL11的同源性分別為91.07%、83.33%、60.87%。構(gòu)建的系統(tǒng)樹顯示,葉籽銀杏的GbMADS5基因歸于
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