鴨遺傳圖譜的構(gòu)建及重要經(jīng)濟(jì)性狀基因座的初步定位.pdf

1、鴨遺傳圖譜的構(gòu)建是重要經(jīng)濟(jì)性狀基因座(QTL)定位及其主效基因克隆研究中不可缺少的部分,而后者又為鴨遺傳改良提供理論依據(jù).然而,至今未見(jiàn)關(guān)于鴨遺傳圖譜構(gòu)建及QTL定位的研究報(bào)道.該文旨在通過(guò)構(gòu)建鴨微衛(wèi)星富集文庫(kù)克隆大量微衛(wèi)星DNA序列,利用克隆的序列設(shè)計(jì)引物,并通過(guò)PCR擴(kuò)增及其擴(kuò)增片段大小的分析,檢測(cè)來(lái)源于兩個(gè)北京鴨品系的三代群體基因型,在此基礎(chǔ)上通過(guò)遺傳連鎖分析構(gòu)建鴨第一張遺傳圖譜,并應(yīng)用區(qū)間定位方法發(fā)現(xiàn)一些對(duì)生長(zhǎng)、屠體及肉質(zhì)性狀具

2、有顯著作用的QTL.該研究應(yīng)用鏈親和素捕捉方法構(gòu)建了富集(CA)n、(CAG)n、(GCC)n及(TTTC)n重復(fù)類型的鴨混合型微衛(wèi)星富集文庫(kù),序列測(cè)定結(jié)果表明,1181個(gè)隨機(jī)克隆中832個(gè)含有10bp以上核心序列,571個(gè)克隆核心序列≥15bp,富集率為73.18﹪,平均插入片段長(zhǎng)度為372.87bp;完全型、不完全型、復(fù)合型及其它類型微衛(wèi)星的比例分別是65.29﹪、13.29﹪、8.25﹪及13.17﹪,完全型中(AC)n、(GCA

3、)n、(GCC)n及(TTTC)n類型重復(fù)微衛(wèi)星的比例分別是64.56﹪、12.81﹪、1.58﹪及5.96﹪;不完全型中上述四種重復(fù)類型微衛(wèi)星的比例分別是70.69﹪、6.03﹪、13.29﹪和8.25﹪.選擇核心序列≥15bp的微衛(wèi)星DNA序列,利用直接熒光標(biāo)記或M13間接熒光標(biāo)記的方法共合成300對(duì)引物,通過(guò)多重PCR反應(yīng)條件的優(yōu)化,篩選出了138對(duì)可用于大規(guī)?；蛐头治龅囊?根據(jù)優(yōu)化好的PCR條件,選擇12個(gè)全同胞家系包含31

4、個(gè)F0、16個(gè)F1、224個(gè)F2個(gè)體進(jìn)行全基因組掃描,并利用31個(gè)無(wú)相關(guān)個(gè)體F0代的基因型分析新微衛(wèi)星位點(diǎn)的特性,結(jié)果表明,25個(gè)位點(diǎn)純合,113個(gè)位點(diǎn)表現(xiàn)為多態(tài),等位基因數(shù)為2-18個(gè),平均為4.65個(gè).113個(gè)多態(tài)位點(diǎn)雜合度為0.03-1.0,平均雜合度為0.48;PIC為0.03-0.97,平均PIC為0.46.113個(gè)多態(tài)位點(diǎn)遺傳連鎖分析結(jié)果顯示,28個(gè)未與任何標(biāo)記連鎖,85個(gè)分布在16個(gè)連鎖群,平均、雄性及雌性圖譜分別覆蓋11

5、10.7、928.7、1377.2cM;16個(gè)連鎖群中,10個(gè)雄性圖譜長(zhǎng)于雌性圖譜,3個(gè)雌性圖譜長(zhǎng)于雄性圖譜,2個(gè)連鎖群在雄性或雌性圖譜中緊密連鎖,而1個(gè)連鎖群在平均、雄性及雌性圖譜中均緊密連鎖,16個(gè)連鎖群雄性與雌性圖譜差異為48.29﹪.區(qū)間定位結(jié)果表明影響1-7周齡體重的QTL分布在1、4、6、、10及16號(hào)連鎖群,顯著或極顯著影響1-7周齡體重的QTL的個(gè)數(shù)均為4個(gè);作用于7周齡體尺的QTL分布在2、3、4及14號(hào)連鎖群,具有顯