細(xì)菌的分類與命名

1、第六章 細(xì)菌的分類與命名,一、生物的分類六界：動(dòng)物界、植物界、真菌界、原生生物界、原核生物界、病毒界。細(xì)菌分類層次與其他生物相同，即：界、門、綱、目、科(Family)、屬(Genus)、種(Species)。,二、細(xì)菌分類的指征1. 形態(tài)學(xué)特性 2. 培養(yǎng)特性 3. 生活方式 4. 生理生化特性 5. 抗原構(gòu)造 6. 對(duì)噬菌體的敏感性7．對(duì)抗生

2、素及其他化學(xué)物質(zhì)的敏感性8．病原性 9．遺傳學(xué)特征。,三、細(xì)菌分類的方法 1、數(shù)值分類法 2．分子生物學(xué)分類法 3．血清學(xué)方法： 共同抗原 4．化學(xué)分類法：比較細(xì)菌各種細(xì)胞成分,1. 數(shù)值分類法 其分類范疇的基本單位是種，根據(jù)比較細(xì)菌在形態(tài)、生理和生化等方面的特性，計(jì)算出相似值來確定種的分類歸屬。,2．分子生物學(xué)分類法 （種系發(fā)生）1）DNA中G+C摩爾百分?jǐn)?shù)(%)含量測(cè)定

3、（G+C）mol%含量：某一生物DNA中的G+C配對(duì)堿基按摩爾數(shù)計(jì)算占全部堿基的百分?jǐn)?shù)。（反映該生物遺傳性能的一種本質(zhì)特征）。測(cè)定方法：梯度密度離心法、解鏈溫度法(Tm)等。,2）DNA或RNA同源性的測(cè)定DNA-DNA雜交試驗(yàn)(hybridization) 原理：同源DNA單鏈或非同源DNA單鏈，只要它們彼此在核苷酸序列上有相應(yīng)互補(bǔ)的部分，就可產(chǎn)生不同程度的結(jié)合。應(yīng)用：通過在體外測(cè)定菌株間DNA的雜合率，據(jù)此推算出DNA的相似

4、程度，判斷它們?cè)谟H緣關(guān)系上的親疏，幫助分類鑒定。,3）rRNA的分析 rRNA在遺傳信息傳遞中起重要作用，特別是16S rRNA能反映各種細(xì)菌間在系統(tǒng)發(fā)生方面的關(guān)系。從該rRNA的堿基序列可繪制系統(tǒng)發(fā)生樹。,四、細(xì)菌的分類體系 細(xì)菌分類有三個(gè)主要體系 前蘇聯(lián)、法國(guó)、美國(guó)《伯杰氏分類系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)》，該手冊(cè)共四卷（1984-1989）。并于1994年出版了《伯杰氏鑒定細(xì)菌學(xué)手冊(cè)》第9版，將細(xì)菌門分為33個(gè)部分，其中與獸醫(yī)學(xué)

5、和醫(yī)學(xué)有關(guān)的計(jì)13個(gè)部分。,五、細(xì)菌種的劃分和種以下的分類單位 (一) 種（Species) 種是生物分類的基本單位。凡屬同種的生物，均具有共同的基本性狀特征。它是生物在一定演化階段，具有相對(duì)穩(wěn)定的一定性狀特征的實(shí)體。,(二) 種以下的分類單位1.亞種(subspecies)：種內(nèi)可能存在一些在某些性狀上相互差異的類別。2.型(type)與亞型(subtype)：僅僅是某一方面的性狀， 如血清型。型內(nèi)還可按進(jìn)一步

6、的性狀差異區(qū)分為不同亞型。,3.菌株(strain)（品系）：是指同種細(xì)菌中不同來源的純培養(yǎng)物。具有典型特征的菌株稱為典型株或代表株或標(biāo)準(zhǔn)株。不同菌株可能性狀完全相同，也可能有某種微小差異。,六、細(xì)菌的命名“雙名法”命名（國(guó)際細(xì)菌命名規(guī)約）由屬名和種名兩部分組成。屬名（第一字母大寫）在前，種名在后。均用拉丁文或拉丁化的文字表示。翻譯時(shí)，種名在前，屬名在后。 如Staphylococcus aureus未確定種名的細(xì)