基于nLSU rDNA和ITS序列對(duì)側(cè)耳屬系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的研究.pdf

1、側(cè)耳屬(Pleurotus)真菌中許多種類與人類關(guān)系密切，且具有重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。側(cè)耳屬真菌種類繁多，起源和進(jìn)化關(guān)系復(fù)雜，分類較為混亂，其系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系一直存在爭(zhēng)議。隨著現(xiàn)代生命科學(xué)技術(shù)的飛速發(fā)展，新方法和新技術(shù)不斷涌現(xiàn)，并逐步應(yīng)用到側(cè)耳屬的系統(tǒng)發(fā)育和分類研究中。本文以傳統(tǒng)的形態(tài)分類鑒定為基礎(chǔ)，采用PCR產(chǎn)物克隆測(cè)序和直接測(cè)序獲得側(cè)耳屬27個(gè)種或亞種48個(gè)菌株的核糖體DNA大亞基(LSUrDNA)和ITS序列，以亞側(cè)耳(H.serotina

2、)、雙孢蘑菇(A.bisporus)和香菇(L.edodes)為外群，運(yùn)用PHYLIP和MAGA軟件中的距離法和最大簡(jiǎn)約法，分別構(gòu)建了側(cè)耳屬系統(tǒng)發(fā)育樹，以期進(jìn)一步探討其系統(tǒng)演化關(guān)系，為生產(chǎn)利用和科學(xué)研究提供參考依據(jù)。 根據(jù)菌絲體形態(tài)可將48株供試側(cè)耳分為5大類：第一類僅包括櫟側(cè)耳(P.dryinus)；第二類包括P.australis、鮑魚菇(P.abalones)、蓋囊側(cè)耳(P.cystidiosus)、P.cystidios

3、usvar.formosensis、P.smithii5種側(cè)耳；第三類包括紅側(cè)耳(P.djamor)和桃紅側(cè)耳(P.salmoneostramineus)；第四類為P.lampas；第五類包括其它所有的供試菌株。子實(shí)體形態(tài)特征觀察表明，除P.abieticola、P.euosmus、P.incarnates、P.lampas、P.rattenburyi、哥倫比亞側(cè)耳(P.columbinus)、具核側(cè)耳(P.tuber-regium)等

4、種類的菌株未出菇而不能進(jìn)行形態(tài)觀察之外，其它供試菌株均能鑒定到種。 基于LSUrDNA序列分析構(gòu)建的側(cè)耳屬系統(tǒng)發(fā)育樹表明：側(cè)耳屬菌株被分為6個(gè)主要分支。第I分支僅包括P.rattenburyi；第II分支包括P.djamor、P.salmoneostramineus、扇形側(cè)耳(P.flabellatus)、貝蓋側(cè)耳(P.calyptratus)、金頂側(cè)耳(P.citrinopileatus)和P.euosmus；第III分支主要

5、包括P.dryinus和P.tuber-regium；第Ⅳ分支包括Coremiopleurotus組的成員P.abalomus、P.smithii，P.cystidiosus及其變種；第V分支只有P.australis；第VI分支包括刺芹側(cè)耳(P.eryngii)種族群、糙皮側(cè)耳(P.ostreatus)復(fù)合群、肺形側(cè)耳(P.pulmonarius)和P.abieticola。糙皮側(cè)耳復(fù)合群包括P.ostreatus、灰白側(cè)耳(P.sp

6、odoleuces)、P.columbinus、美味側(cè)耳(P.spodoleucus)和佛羅里達(dá)側(cè)耳(P.floridanus)組成。系統(tǒng)發(fā)育樹還表明，Coremiopleurotus組的成員P.australis、P.abalomus、P.cystidiosus、P.smithii可能是一個(gè)多系起源的類群。 基于ITS序列分析構(gòu)建的側(cè)耳屬系統(tǒng)發(fā)育樹表明，該系統(tǒng)樹自根部逐漸延伸出6個(gè)主要分支，分別代表側(cè)耳屬6個(gè)主要類群。第I分支

7、包括P.rattenburyi和Hserotina；第II分支僅為P.tuber-regium：第III分支包括P.dryinus、P.citrinopileatus和P.euosmus：第IV分支為Coremiopleurotus組的成員P.australis、P.abalomus、P.smithii、P.cystidiosus及其變種：第V分支為P.djamor、P.salmoneostramineus、P.flabellatus、

8、P.incarnates和P.calyptratus：第VI分支包括P.pulmonarius、P.arbieticola、P.eryngii、白靈側(cè)耳(P.nebrodensis)、P.ostreatus、P.floridanus、P.columbinus、P.spodoleucus、黃白側(cè)耳(P.conucopiae)、P.spodoleucus。在這些類群中，同一側(cè)耳種的不同菌株也能很好的聚在一起。在第VI分支中，側(cè)耳屬菌株又被明

9、顯的分為5個(gè)類群。即：A類群為P.pulmonarius；B類群為P.arbieHcola；C類群為P.eryngii種族群；D類群為P.nebrodensis；E類群為P.ostreatus復(fù)合群。相比而言，ITS序列在種間和種內(nèi)分類鑒定中顯示出明顯的優(yōu)勢(shì)。該系統(tǒng)樹還表明Coremiopleurotus組的成員P.australis、P.abalomus、P.cystidiosus、P.smithii可能是單系起源的類群。據(jù)此推測(cè)，P

10、.fuscusval.ferulae可能就是阿魏菇(P.ferulae)。 基于LSU序列和ITS序列構(gòu)建的側(cè)耳屬系統(tǒng)發(fā)育樹均表明，側(cè)耳屬內(nèi)單系菌絲系統(tǒng)和二系菌絲系統(tǒng)菌株可能是多系起源的。P.calyptratus與P.djamor、P.salmoneostramineus、P.flabellatus關(guān)系密切。P.citrinopileatus與P.conucopiae為不同的種。P.lampas與側(cè)耳屬其它成員的親緣關(guān)系極遠(yuǎn)，