illumina 、454 、abi 測(cè)序儀比較

1、Illumina、454、ABI測(cè)序儀比較Illumina測(cè)序儀測(cè)序儀Illumina公司的新一代測(cè)序儀GenomeAnalyzer最早由Solexa公司研發(fā)，利用其專(zhuān)利核心技術(shù)“DNA簇”和“可逆性末端終結(jié)（reversibleterminat）”，實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化樣本制備及基因組數(shù)百萬(wàn)個(gè)堿基大規(guī)模平行測(cè)序。Illumina公司于2007年花費(fèi)6億美金的巨資收購(gòu)了Solexa，就是為了促成GenomeAnalyzer的商品化。GenomeA

2、nalyzer作為新一代測(cè)序技術(shù)平臺(tái)，具有高準(zhǔn)確性，高通量，高靈敏度，和低運(yùn)行成本等突出優(yōu)勢(shì)，可以同時(shí)完成傳統(tǒng)基因組學(xué)研究（測(cè)序和注釋?zhuān)┮约肮δ芑蚪M學(xué)（基因表達(dá)及調(diào)控，基因功能，蛋白核酸相互作用）研究。GenomeAnalyzer自上市以來(lái)，已經(jīng)為千人基因組計(jì)劃立下了赫赫戰(zhàn)功。今年早期，荷蘭科學(xué)家利用它首次繪出女性的基因組圖譜。而就在前兩周，《Nature》雜志上一連出現(xiàn)三個(gè)人類(lèi)基因組圖譜：炎黃一號(hào)第一個(gè)亞洲人圖譜；第一個(gè)癌癥病人圖譜

3、；第一個(gè)非洲人圖譜。它們?nèi)且蕾?lài)GenomeAnalyzer完成的。嘩，一下就來(lái)仨！這和第一個(gè)人類(lèi)基因組圖譜的13年形成了多么鮮明的對(duì)照。根據(jù)去年底的數(shù)據(jù)，GenomeAnalyzer已售出約200臺(tái)，估計(jì)是市場(chǎng)占有率最廣的。前不久，華大基因再添置了12臺(tái)，準(zhǔn)備放在香港和深圳的實(shí)驗(yàn)室，至此華大基因已經(jīng)有29臺(tái)GenomeAnalyzer。而著名的麻省理工學(xué)院和哈佛大學(xué)Broad研究院擁有47臺(tái)Illumina測(cè)序儀。眾多實(shí)驗(yàn)室之所以選擇

4、Illumina，看中的無(wú)疑是GenomeAnalyzer的高性?xún)r(jià)比。上個(gè)月，Illumina將GenomeAnalyzerII升級(jí)到GenomeAnalyzerIIx，距年底實(shí)現(xiàn)單次運(yùn)行獲得95GB數(shù)據(jù)的宏偉目標(biāo)又近了一步。GenomeAnalyzerIIx有兩個(gè)核心特征：其一是更大的試劑冷卻器，支持超過(guò)100個(gè)測(cè)序循環(huán)，進(jìn)一步提升了系統(tǒng)的易用性和自動(dòng)化；其二是全新的流動(dòng)池支架，讓每輪運(yùn)行所得的高質(zhì)量數(shù)據(jù)增加20%。依靠系統(tǒng)軟件和試劑

5、的改進(jìn)，GenomeAnalyzerIIx4.數(shù)據(jù)分析數(shù)據(jù)分析自動(dòng)讀取堿基，數(shù)據(jù)被轉(zhuǎn)移到自動(dòng)分析通道進(jìn)行二次分析。GenomeAnalyzer系統(tǒng)之所以如此暢銷(xiāo)，關(guān)鍵在于其技術(shù)上的優(yōu)勢(shì)。1.可擴(kuò)展的超高通量可擴(kuò)展的超高通量GenomeAnalyzer系統(tǒng)目前每次運(yùn)行后可獲得超過(guò)20GB的高品質(zhì)過(guò)濾數(shù)據(jù)。這個(gè)技術(shù)的可擴(kuò)展性保證了更高的數(shù)據(jù)密度和輸出，能用更少的經(jīng)費(fèi)完成更復(fù)雜的項(xiàng)目。到今年底，通量還有望上升到95GB，相當(dāng)于人類(lèi)基因組的30

6、倍覆蓋度。2.需要樣品量少需要樣品量少GenomeAnalyzer系統(tǒng)需要的樣品量低至100ng，能應(yīng)用在很多樣品有限的實(shí)驗(yàn)（比如免疫沉淀、顯微切割等）中。這也是很多研究人員所考慮的因素。3.簡(jiǎn)單、快速、自動(dòng)化簡(jiǎn)單、快速、自動(dòng)化GenomeAnalyzer系統(tǒng)提供了最簡(jiǎn)單和簡(jiǎn)潔的工作流程。即使是最小的實(shí)驗(yàn)室也能像大型基因組中心一樣進(jìn)行大規(guī)模的實(shí)驗(yàn)。制備樣品文庫(kù)可以在幾小時(shí)內(nèi)完成，一個(gè)星期內(nèi)就能得到高精確度的數(shù)據(jù)。ClusterStati