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文檔簡介
1、一步一步教你使用NCBI數(shù)據(jù)庫資源隨著ncbi數(shù)據(jù)庫各種資源的涌現(xiàn)，NCBI已經(jīng)成為科研工作者必不可少的資料查找，數(shù)據(jù)分析的工具。那么NCBI數(shù)據(jù)如何使用，新手入門一步一步教你認識和使用NCBI數(shù)據(jù)庫。一綜合數(shù)據(jù)庫NCBI數(shù)據(jù)庫集美國國立生物技術(shù)信息中心(NationalCenterfBiotechnologyInfmation)，即我們所熟知的NCBI是由美國國立衛(wèi)生研究院(NIH)于1988年創(chuàng)辦。創(chuàng)辦NCBI的初衷是為了給分子生物
2、學(xué)家提供一個信息儲存和處理的系統(tǒng)。除了建有GenBank核酸序列數(shù)據(jù)庫(該數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)資源來自全球幾大DNA數(shù)據(jù)庫，其中包括日本DNA數(shù)據(jù)庫DDBJ、歐洲分子生物學(xué)實驗室數(shù)據(jù)庫EMBL以及其它幾個知名科研機構(gòu))之外，NCBI還可以提供眾多功能強大的數(shù)據(jù)檢索與分析工具。目前，NCBI提供的資源有Entrez、EntrezProgrammingUtilities、MyNCBI、PubMed、PubMedCentral、EntrezGene、
3、NCBITaxonomyBrowser、BLAST、BLASTLink(BLink)、ElectronicPCR等共計36種功能，而且都可以在NCBI的主1.2新增primerBLAST分析工具2008年，NCBI新增了設(shè)計、分析PCR引物的工具——PrimerBLAST。PrimerBLAST的引物設(shè)計功能是基于NCBI現(xiàn)有的Primer3程序發(fā)展而來的，Primer3程序可以為一段DNA模板序列設(shè)計PCR引物。PrimerBLAST
4、在設(shè)計出引物之后還在某些相應(yīng)數(shù)據(jù)庫中進行BLAST搜索，因此可以得到特異性引物，擴增出目的片段。用戶在給出DNA模板的同時還可以限定正向引物或反向引物，這樣，NCBI就只會給出另一條引物。如果用戶給出了模板DNA和兩條引物序列，PrimerBLAST就只會運行BLAST程序，幫助用戶對引物進行分析。用戶也可以只給出兩條引物而不給出模板序列，這時PrimerBLAST會通過BLAST程序分析出與這對引物最匹配的模板序列。PrimerBLA
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