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1、1項(xiàng)目名稱(chēng):抗體抗體抗原分子識(shí)別的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)和功能抗原分子識(shí)別的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)和功能研究研究首席科學(xué)家:郭亞軍郭亞軍中國(guó)人民解放軍第二軍醫(yī)大學(xué)中國(guó)人民解放軍第二軍醫(yī)大學(xué)起止年限:20102010年1月20142014年8月依托部門(mén):總后勤部衛(wèi)生部總后勤部衛(wèi)生部上海市科委上海市科委3主要研究?jī)?nèi)容包括:主要研究?jī)?nèi)容包括:1利用地理信息系統(tǒng)(利用地理信息系統(tǒng)(GISGIS)空間信息分析技術(shù)尋找抗體抗原表面結(jié)合位點(diǎn)識(shí))空間信息分析技術(shù)尋找抗體抗原表面結(jié)
2、合位點(diǎn)識(shí)別規(guī)律別規(guī)律:在生物信息大規(guī)模抗體虛擬庫(kù)和抗體抗原分子識(shí)別的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)上,統(tǒng)計(jì)抗體抗原結(jié)合界面兩側(cè)的空間信息特征和特征,建立基于空間特征的蛋白質(zhì)抗原空間表位預(yù)測(cè)方法,進(jìn)行抗體抗原分子識(shí)別的分子動(dòng)力學(xué)模擬,采用地理信息系統(tǒng)(GIS)的“空間信息分析與模型分析”功能發(fā)展空間比對(duì)技術(shù),尋找抗體抗原表面結(jié)合位點(diǎn)識(shí)別規(guī)律。2抗體抗原相互作用結(jié)構(gòu)學(xué)基礎(chǔ):抗體抗原相互作用結(jié)構(gòu)學(xué)基礎(chǔ):綜合運(yùn)用結(jié)構(gòu)生物學(xué)、計(jì)算生物學(xué)、免疫學(xué)、分子生物學(xué)和生物化學(xué)的
3、方法,以具有重要生物學(xué)功能的抗原和抗體分子為研究目標(biāo),構(gòu)建抗原和抗體分子結(jié)構(gòu)測(cè)定平臺(tái),抗原表位測(cè)定的技術(shù)平臺(tái),以及抗體生物學(xué)功能機(jī)制的分析平臺(tái)。綜合運(yùn)用X射線(xiàn)晶體學(xué)、溶液核磁共振、冷凍電鏡、X射線(xiàn)小角散射等多種結(jié)構(gòu)生物學(xué)手段測(cè)定抗體和抗原分子以及它們的復(fù)合物的在不同分辨率尺度上和不同測(cè)定方法基礎(chǔ)上的三維結(jié)構(gòu)信息,確定抗原分子上具有重要活性的功能表位,揭示抗體特異性高效識(shí)別靶標(biāo)抗原的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ),闡明抗體發(fā)揮其生物學(xué)功能的分子機(jī)理。3.3.抗
4、體抗原復(fù)合物的分子分布特征及功能識(shí)別基礎(chǔ):抗體抗原復(fù)合物的分子分布特征及功能識(shí)別基礎(chǔ):利用近場(chǎng)光學(xué)顯微術(shù)結(jié)合熒光量子點(diǎn)標(biāo)記技術(shù)對(duì)單個(gè)抗原抗體在細(xì)胞表面的動(dòng)態(tài)分布狀態(tài)進(jìn)行可視化研究及數(shù)量化分析,結(jié)合單分子力譜測(cè)量技術(shù)和原子力顯微成像術(shù)對(duì)抗原抗體分子間結(jié)合,解離的動(dòng)態(tài)過(guò)程給以精細(xì)探討。進(jìn)一步闡明在生理?xiàng)l件下抗原抗體相互作用機(jī)制,修正已建立的數(shù)學(xué)理論模型。4基于計(jì)算生物學(xué)的抗體分子設(shè)計(jì)及功能進(jìn)化規(guī)律研究基于計(jì)算生物學(xué)的抗體分子設(shè)計(jì)及功能進(jìn)化規(guī)
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