金屬Pt和Pd的AMOEBA極化力場的構建.pdf

1、文章首先對分子力場和分子動力學方法做了簡要介紹，分子動力學模擬的效率主要是由力場的質量來決定的.傳統(tǒng)力場在對電荷的處理中并沒有考慮到電荷的極化以及電荷轉移帶來的影響，只是看作固定電荷來處理，然而在很多體系中極化效應普遍存在，例如蛋白質分子中就存在著大量極化基團和氫鍵網(wǎng)絡，溶液中溶劑水分子與溶液蛋白質之間也存在相互極化，因此發(fā)展極化力場非常必要.近幾年，極化力場發(fā)展迅速，尤其是Ren和Ponder創(chuàng)立的AMOEBA極化力場，相比于傳統(tǒng)力場

2、它考慮了電荷的極化效應，用偶極矩和四極矩來描述靜電相互作用.本文對目前極化力場的研究現(xiàn)狀進行了分析討論，并且重點介紹了AMOEBA極化力場及其應用情況.在催化領域，過渡金屬具有很好的催化性和穩(wěn)定性，而Pt、Ni、Pd等金屬尤為重要，具有非常重要的工業(yè)價值.由于沒有Pt和Pd的AMOEBA力場，為了研究它們的催化性質，因而構建了金屬Pt、Pd和常見有機小分子的AMOEBA極化力場.在具體研究中，通過對AMOEBA力場計算結果與量化結果的比

3、較，發(fā)現(xiàn)力場結果與量化結果差異較大，于是在力場中考慮了電荷轉移能修正項，通過與量化結果比較得到新的力場參數(shù)，計算結果與量化結果符合的很好.本文通過計算和參數(shù)擬合最后得到金屬Pt、Pd和幾種有機小分子的力場參數(shù)，構建了新力場.為了驗證得到的新力場參數(shù)，又分別對兩類體系Pt和甲烷、乙烷進行了分子動力學模擬，結合RDF、吸附能力和擴散系數(shù)對構建的極化力場進行了檢驗.進行動力學模擬時，分別對考慮與不考慮電荷轉移能修正項的兩種力場進行模擬，對二者