版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進行舉報或認領(lǐng)
文檔簡介
1、在現(xiàn)代生物遺傳學中,生物體的單倍型信息起著非常關(guān)鍵的作用,可以提高連鎖分析和關(guān)聯(lián)分析的功效和準確度,是人類得以探究基因的多樣性以及定位致病基因的重要手段之一.隨著科學技術(shù)的不斷發(fā)展,我們已經(jīng)可以得到生物體的基因型數(shù)據(jù),但是單倍型的信息卻無法直接獲得.十幾年來很多學者都致力于這方面的研究,發(fā)展了一系列的研究方法,其中最主要的是利用統(tǒng)計方法進行推斷,如:Clark's算法、EM算法、Bayesian方法、基于Bayesian模型或EM方法的
2、PL算法等等. 以上的所有方法都是基于完全基因型數(shù)據(jù)而進行的單倍型推斷,且沒有過于詳細的討論家系數(shù)據(jù),但是實際中的數(shù)據(jù)多是很龐大的、不完全的或是有部分缺失的,因此這些方法都不能用來很好的解決問題. 本文就是用來解決有缺失數(shù)據(jù)的多個家系的單倍型推斷問題.首先,針對完全基因型的大的家系數(shù)據(jù),利用傳統(tǒng)的EM算法詳細的給出其單倍型的推斷方法,分別解決了核心家庭數(shù)據(jù)和一般的家系數(shù)據(jù)問題.在此基礎(chǔ)之上,重點針對有缺失數(shù)據(jù)的家系進行研
3、究,充分利用家系中個體之間的親屬關(guān)系,考慮各個核心家庭個體間的遺傳制約機制.對于核心家庭中已知基因型的個體,引入Judge算子,排除不合理的雙倍型向量.再利用Induce算子,為未知基因型的個體補充雙倍型信息,由此得到所有個體的一切合理的雙倍型向量.以此數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),應用改進的EM方法得到參數(shù)的估計并得到了估計的標準差.再由極大似然的原則,分別就不同類型的個體,利用參數(shù)的估計(θ)給出單倍型的推斷方法.最后討論一個簡單的例子,即同胞對家系
溫馨提示
- 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
- 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
- 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預覽,若沒有圖紙預覽就沒有圖紙。
- 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
- 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負責。
- 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
- 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。
最新文檔
- 用于一般系譜的單倍型推斷方法.pdf
- 含有缺失機制的多元縱向數(shù)據(jù)分析.pdf
- 含有缺失數(shù)據(jù)的兩值吸毒數(shù)據(jù)分析.pdf
- 維生素D受體基因型和單倍型對血鉛濃度的影響.pdf
- 含有缺失數(shù)據(jù)圖模型的可識別性.pdf
- 臨床醫(yī)學研究中帶有缺失數(shù)據(jù)和截斷數(shù)據(jù)的統(tǒng)計推斷方法.pdf
- 不同單倍型塊定義在單倍型塊結(jié)構(gòu)推斷與htSNPs選擇中的效應.pdf
- 有缺失數(shù)據(jù)的雙向有序方列聯(lián)表的統(tǒng)計推斷.pdf
- 基于單倍型的關(guān)聯(lián)分析方法.pdf
- 單倍型的關(guān)聯(lián)分析方法研究.pdf
- 有缺失數(shù)據(jù)的AR(1)模型參數(shù)的估計方法.pdf
- 基因型對油菜遺傳轉(zhuǎn)化效率的影響和幾個轉(zhuǎn)基因油菜家系的表型分析.pdf
- 甘藍型油菜基因型對小孢子染色體加倍的反應及倍性鑒定.pdf
- 胃癌發(fā)生與XPC基因單倍型的關(guān)系.pdf
- 關(guān)于含有缺失的縱向二分類數(shù)據(jù)的邊際轉(zhuǎn)移模型分析.pdf
- 基因型頻率
- 1626個中國家系的HLA單倍型分析及新等位基因的鑒定.pdf
- 使用帶有基因型誤差數(shù)據(jù)的多基因定位.pdf
- 遺傳印記效應檢驗及基于單倍型推斷Hardy-Weinberg平衡律檢驗的統(tǒng)計方法研究.pdf
- B基因型和C基因型HBV轉(zhuǎn)錄活性差異的機制研究.pdf
評論
0/150
提交評論