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文檔簡(jiǎn)介
1、生物大分子在微尺度下的流動(dòng)特性,是近年來生物大分子研究的熱點(diǎn)之一。DNA是典型的生物大分子。DNA的流動(dòng)特性,即DNA在流場(chǎng)的不同條件下與時(shí)間有關(guān)的變形和流動(dòng)規(guī)律,
從19世紀(jì)60年代開始,人們把經(jīng)典力學(xué)的方法和分子生物的實(shí)驗(yàn)和統(tǒng)計(jì)分析技術(shù)相結(jié)合對(duì)DNA的桿狀螺旋結(jié)構(gòu)進(jìn)行研究,取得了大量成果。近年來,隨著計(jì)算機(jī)水平的大幅提高,布朗動(dòng)力學(xué)的計(jì)算機(jī)模擬作為一種數(shù)值研究手段在流變學(xué)領(lǐng)域得到廣泛的利用。對(duì)給定的模型可以很方便的設(shè)計(jì)
2、與之相應(yīng)的計(jì)算機(jī)模擬程序。
本文采用了帶有粘性的FENE模型來實(shí)現(xiàn)對(duì)DNA分子動(dòng)力學(xué)的模擬,在模擬時(shí)運(yùn)用了布朗動(dòng)力學(xué)方法,所得到的主要結(jié)論如下:
(1)導(dǎo)出了帶有粘性的FENE模型的動(dòng)力學(xué)方程和Euler迭代公式,運(yùn)用Euler方法模擬了該模型在延展流中的動(dòng)力學(xué),將教值模擬結(jié)果與Smith的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行了比較,發(fā)現(xiàn)結(jié)果與實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)比較吻合。
(2)給出了強(qiáng)1階收斂的Milstein方法的迭代公式,
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