色譜指紋數(shù)據(jù)處理算法研究及應(yīng)用.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、色譜分離檢測技術(shù)是常用的代謝組學(xué)分析技術(shù)。通過對樣本進(jìn)行色譜分離檢測,可以獲取樣本的代謝物色譜指紋輪廓,以進(jìn)行后續(xù)的代謝組學(xué)分析。由色譜技術(shù)可以得到幾百甚至上千個(gè)代謝物,而所檢測的樣本通常只有幾十個(gè)。即代謝組學(xué)色譜指紋數(shù)據(jù)具有高維小樣本的特點(diǎn)。如此高的代謝物維度及相對過少的樣本,加大了代謝組學(xué)色譜指紋數(shù)據(jù)的分析難度。因此,研究人員引入數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)用于處理代謝組學(xué)色譜指紋數(shù)據(jù)。
  對初烤煙葉色譜數(shù)據(jù)進(jìn)行分析是植物代謝組學(xué)中的一個(gè)重

2、要應(yīng)用。為滿足對煙草色譜數(shù)據(jù)存儲和分析的需求,本文開發(fā)了一個(gè)煙草色譜指紋圖譜數(shù)據(jù)分析系統(tǒng),并已投入實(shí)際應(yīng)用。同時(shí),數(shù)據(jù)融合方法常應(yīng)用于對多個(gè)年份中所采集的不同煙草樣本的香型品質(zhì)進(jìn)行分析。然而,不同年份的生態(tài)氣候差異會對香型差異造成干擾。為有效融合不同年份的色譜數(shù)據(jù),本文提出了一種基于統(tǒng)計(jì)假設(shè)檢驗(yàn)與局部尺度化相結(jié)合的數(shù)據(jù)融合方法。該方法只對受到年份影響的特征進(jìn)行尺度化處理,去除年份差異的影響。在將該方法應(yīng)用于對貴州兩年的烤煙樣本融合處理時(shí)

3、,同現(xiàn)有的數(shù)據(jù)偏移修正融合方法相比,有效地去除了不同年份生態(tài)氣候?qū)е碌牟町?,使得隨機(jī)森林和支持向量機(jī)對烤煙香型的分類性能均得到了提高。
  本文的另一內(nèi)容是對代謝組學(xué)時(shí)間序列色譜數(shù)據(jù)及時(shí)間序列隨機(jī)森林分類算法進(jìn)行研究,給出了一種與時(shí)間序列規(guī)律性變化度量相結(jié)合的時(shí)間序列隨機(jī)森林算法。該算法和普通的時(shí)間序列隨機(jī)森林相比,在選擇決策樹結(jié)點(diǎn)分劃特征時(shí),同時(shí)考慮了特征的區(qū)分能力及特征的時(shí)間序列變化規(guī)律特點(diǎn)。在將該算法應(yīng)用在家蠶的時(shí)間序列分類

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