基于離散事件方法的DNA復制過程仿真設計與實現(xiàn).pdf

1、本文針對真核生物的DNA復制過程的仿真，提出了一種基于離散事件的仿真方法。真核生物的DNA復制過程是從基因組上的多個位點開始的，這些位點被稱作復制源點。復制過程的開始是由復制源點的觸發(fā)引起的。當復制源點觸發(fā)會生成兩個沿著基因組異向運動的復制叉，當基因組上所有的復制叉都停止運動并且不存在還處于準備復制狀態(tài)的復制源點時，DNA的復制過程結束。
　　然而，在整個DNA復制過程當中復制源點的觸發(fā)時間并不確定，有些源點傾向于在復制過程早期觸

2、發(fā)，而另外一些則傾向于在晚期觸發(fā)，但是從整體來看，所有源點的觸發(fā)時間又體現(xiàn)出一定的隨機分布的規(guī)律，因此，其觸發(fā)機制尚未明確，而針對這一過程的仿真方法多樣而復雜，且主要分為兩類模型:確定性模型與隨機性模型。確定性模型將源點的觸發(fā)時間順序設定為確定的序列，在復制過程中源點的觸發(fā)有序進行。隨機性模型將源點的觸發(fā)時間順序進行隨機處理，在復制過程的進行中未觸發(fā)源點的觸發(fā)時間會發(fā)生變化。本文中，將會基于一種隨機混合模型來運用離散事件方法，該模型融合

3、了確定性模型和隨機性模型的特征。
　　針對DNA復制過程的仿真，本文提出了一種基于離散事件的仿真方法。文中分析了DNA復制過程的特點，將復制源點的狀態(tài)描述為離散狀態(tài)，而將復制源點的復制叉運動描述為連續(xù)狀態(tài);并明確離散狀態(tài)的改變是由連續(xù)狀態(tài)的改變而引起的，給出了離散狀態(tài)的轉變關系，既多個離散事件;提出了離散事件的定義，描述，特性及關系;提出了一套基于離散事件的仿真方法及流程，并進行了離散事件仿真程序實現(xiàn)。結果表明，本文提出的基于離散