淡黃金花茶譜系地理學(xué)研究.pdf_第1頁
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1、學(xué)校代碼10602學(xué)號(hào)201401l110分類號(hào)Q347密紱公開國屋匆吁釔尤謦\:::/GUAN6XINoRMALUNIVEP31TY碩士學(xué)位論文淡黃金花茶譜系地理學(xué)研究PhylogeographyofCamelliaflavida學(xué)院專業(yè)研究方向年級(jí)研究生指導(dǎo)教師完成日期:生命科學(xué)學(xué)院:生物學(xué):生物化學(xué)與分子生物學(xué):2014:韋素娟:唐紹清:2017年4月淡黃金花茶譜系地理學(xué)研究f蜘歲掣研究生:韋素娟年級(jí):2014級(jí)導(dǎo)師:唐紹清教授學(xué)

2、科專業(yè):生物學(xué)研究方向:生物化學(xué)與分子生物學(xué)摘要淡黃金花茶(Camelliaflavida)是金花茶植物的一個(gè)種,被列為瀕危物種,分布于廣西西南部,為石灰?guī)r專性植物。當(dāng)前淡黃金花茶在分類處理上仍然存在爭議,其自然種群遭受了一定程度的人為破壞,特別是淡黃金花茶變種,種群大小急劇下降,呈孤立狹窄的小種群分布。本研究以淡黃金花茶20個(gè)自然種群188個(gè)個(gè)體為研究對(duì)象,采用一個(gè)葉綠體片段(包括了ndhErpL32trnL—UAGJccsA四個(gè)基因

3、及其間區(qū)序列)和一個(gè)單拷貝核基因(phenylalanineammonialyase,PAL)片段進(jìn)行譜系地理學(xué)分析,了解淡黃金花茶的種群遺傳結(jié)構(gòu)和譜系模式,評(píng)估淡黃金花茶原分類處理的合理性,為淡黃金花茶的保護(hù)提供遺傳學(xué)數(shù)據(jù),研究結(jié)果如下:1)淡黃金花茶葉綠體片段序列總長5178bp,38個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),共檢測到17個(gè)葉綠體單倍型。基于葉綠體DNA數(shù)據(jù)進(jìn)行的SAMOVA聚類分析表明:淡黃金花茶原變種(Camelliaflavidavarf

4、lavida)的居群獨(dú)立聚為一組(ND,MQ,NFDYLLS,LR,SC,NX,LM,LL,MZ,LD,BZ,LX,LN),而變種(Camelliaflavidavatpatens)則分為(LHS,WM)和(SG,NXS,NGL)兩個(gè)組。葉綠體單倍型系統(tǒng)發(fā)育分析和單倍型網(wǎng)絡(luò)圖分析也得到相同的結(jié)果。淡黃金花茶核基因片段序列矩陣為653bp,含有69個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),共檢測到87個(gè)單倍型。與葉綠體分析結(jié)果不同,單拷貝核基因的SAMOVA分析表明

5、,淡黃金花茶20個(gè)種群最佳分組為三組,原變種分為2組:varflavida1(ND,MQ,NFDY,LLS,LR,SC,NX,LM,LL,MZ,LD)冪flvarflavida2(BZ,LX,LN);而變種(varpatens)獨(dú)立聚為一組(LHS,WM,SG,NXS,NGL)。在核基因單倍型網(wǎng)狀進(jìn)化圖中,變種(varpatens)的單倍型位于網(wǎng)絡(luò)圖的中faJ,將原變種的單倍型也分開為varflavida1和var1qavida2兩個(gè)部

6、分。盡管核基因單倍型系統(tǒng)發(fā)育分析支持率低,varflavida2(BZ,LX,LN)的單倍型獨(dú)立聚為一支,而varflavida1和varflavida2大部分單倍型也分別聚在一起。這三個(gè)分化組也得到了形念學(xué)的支持,所采集的淡黃金花茶樣品是由varflavida1、varflavida2和varpatens這三個(gè)分類群組成的。BZ種群采集自淡黃金花茶模式標(biāo)本的采集地,因此認(rèn)為varflavida2為真正的淡黃金花茶,核基因標(biāo)記對(duì)物種的劃

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