淡黃金花茶種群遺傳結(jié)構(gòu)研究.pdf

1、淡黃金花茶（Camellia flavida Chang）屬于山茶科(Theaceae)山茶屬（Camellia），包括淡黃金花茶原變種（C.avida var.flavida）和多變淡黃金花茶（C.flavida var.patens），分布在廣西南部和西南部常綠闊葉林石灰?guī)r山地的洼地或谷地。淡黃金花茶花瓣呈淡紅色、黃白至淡黃色，是一種金花茶植物，有重要的觀賞與科研價(jià)值，是珍貴的種質(zhì)資源。
　　本研究利用微衛(wèi)星分子標(biāo)記方法對19

2、個(gè)淡黃金花茶種群進(jìn)行全面的研究。旨在揭示其遺傳多樣性和種群遺傳結(jié)構(gòu)，探討石灰?guī)r生境異質(zhì)性及生境破碎化對淡黃金花茶影響。為有效保護(hù)與利用淡黃金花茶珍貴的種質(zhì)資源提供一定的依據(jù)。主要研究結(jié)果如下:
　　(1)分別采用454測序法和轉(zhuǎn)錄組測序法成功開發(fā)了21對頂生金花茶和38對淡黃金花茶微衛(wèi)星引物。其中，頂生金花茶21個(gè)有效的微衛(wèi)星序列在GenBank上的登錄號是:KJ670125～KJ670145。21對引物均表現(xiàn)出了較高的多態(tài)性。2

3、1個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)的等位基因數(shù)A在3～9間變化，觀測雜合度（HO）的范圍在0.200～0.963，期望雜合度（HE）在0.246～0.868間變化。上述兩種方法開發(fā)的微衛(wèi)星引物均為深入研究淡黃金花茶種群遺傳多樣性和種群遺傳結(jié)構(gòu)提供了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)。
　　(2)遺傳多樣性研究結(jié)果顯示:14對微衛(wèi)星引物在19個(gè)種群601個(gè)個(gè)體中共檢測到112個(gè)等位基因，每個(gè)位點(diǎn)檢測到的等位基因數(shù)介于7～20之間，平均值為8。其中，位點(diǎn)TER4的等位基因數(shù)（2

4、0個(gè)）最高，位點(diǎn)FLA12和FLA16的等位基因數(shù)（7個(gè)）最低。14個(gè)位點(diǎn)的觀測雜合(HO)范圍在0.411～0.672間，其平均值為0.563。期望雜合度（HE）在0.350～0.657之間變化，平均值為0.555。
　　(3)種群結(jié)構(gòu)研究表明淡黃金花茶兩兩種群間的遺傳分化系數(shù)(Fst)為0.276，種群處于較高分化的狀態(tài)。基因流(Nm)的范圍在0.565～5.036間，其種群間的基因流為0.732，表明種群間存在低水平的基因流

5、動;AMOVA分析結(jié)果表明淡黃金花茶原變種和多變淡黃金花茶的變異主要來自個(gè)體間，種群間的變異也較大。其中，淡黃金花茶原變種和多變淡黃金花茶種群間的變異為24.84％，淡黃金花茶原變種種群間的變異為25.49％，而多變淡黃金花茶種群間的變異為27.66％，表明種群間存在較高水平的遺傳分化;Mantle檢驗(yàn)表明遺傳距離與地理距離間存在極其顯著的正相關(guān)性(r=0.4383 p=0.0030);BOTTLENECK分析可能淡黃金花茶中NF種群經(jīng)

6、歷了近期的遺傳瓶頸;STRUCTURE分析表明淡黃金花茶的19個(gè)種群可以嚴(yán)格地劃分為2個(gè)大集群，其中集群Ⅰ包括LS、NZ、LL等12個(gè)淡黃金花茶原變種種群，集群Ⅱ則包含了5個(gè)多變淡黃金花茶種群和2個(gè)淡黃金花茶原變種種群（LN和LZ）。
　　本研究整體上揭示了淡黃金花茶具有一定水平的遺傳多樣性，表明現(xiàn)階段是保護(hù)淡黃金花茶的好時(shí)期。STRUCTURE聚類分析指導(dǎo)在對淡黃金花茶進(jìn)行保護(hù)時(shí)可以把它分為三個(gè)保護(hù)單元，針對種群較高的遺傳分化和