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    • 簡介:目的一是對中國重慶AIS進行遺傳流行病學調(diào)查分析,探討遺傳因素在發(fā)病中的作用和可能的遺傳模式。二是采取定位候選克隆方法對AIS的疾病候選基因SH3GL1的外顯子進行序列比對分析,研究是否存在堿基變異,為疾病基因篩查與鑒定做方法學準備。方法1遺傳流行病學調(diào)查設(shè)計AIS遺傳流行病學調(diào)查表,收集在西南醫(yī)院診治過的先證者資料。確立診斷標準為站立前后位X線片COBB角>10°為受累者,COBB角<10°為易感者,年齡小于12歲的表型正常者為未確定者。由經(jīng)過培訓的調(diào)查員對先證者及其家系成員進行詢問調(diào)查并填寫調(diào)查表。方法為門診、病房詢問與電話詢問相結(jié)合,為防止存在回憶偏倚對先證者、父親和母親分別進行詢問記錄。對懷疑受累者和易感者要進行臨床望診、ADAM彎腰試驗檢查,必要時經(jīng)過X線片檢查確定。2遺傳流行病學統(tǒng)計分析對遺傳流行病學調(diào)查數(shù)據(jù)采用SPSS100統(tǒng)計軟件進行分析。通過年齡發(fā)病率分析,家族聚集性分析,遺傳度計算FALCONER法分析確定遺傳因素的大小。根據(jù)單基因和多基因遺傳病的特點分析確定遺傳模式。3定位候選克隆設(shè)計以家系為基礎(chǔ)的“病例同胞對”研究方案,采集“同胞對”的血液標本,提取基因組DNA,根據(jù)基因SH3GL1核酸序列,以10個外顯子為重點設(shè)計引物對,進行PCR擴增、克隆和測序。4序列比對分析用GEOOL軟件對外顯子測序結(jié)果,進行“同胞對”之間和同胞對與NCBI之間的序列比對分析,判斷是否存在堿基變異,并進行蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預測分析。結(jié)果1遺傳流行病學調(diào)查設(shè)計了AIS遺傳流行病學調(diào)查表,并成功的對73個家系按調(diào)查表進行遺傳流行病學調(diào)查。2遺傳流行病學統(tǒng)計年齡發(fā)病率分析發(fā)病75%在11~14歲之間,平均年齡1084歲。家族聚集性分析病例家族總發(fā)病率為486%,一級親屬的發(fā)病率為1693%,二級親屬的發(fā)病率為721%,三級親屬發(fā)病率436%,而參照發(fā)病率為225%,統(tǒng)計學分析差異有顯著意義U6451,P<001。遺傳度計算先證者一級親屬的遺傳度84%、二級親屬的遺傳度88%和三級親屬的遺傳度85%,經(jīng)顯著性檢驗P<001各級親屬遺傳度有統(tǒng)計學意義。3定位候選克隆候選基因SH3GL1中的10個外顯子成功的在AIS“同胞對”的基因組DNA中得到擴增和克隆,并且序列測定均取得陽性結(jié)果。4序列比對分析通過比對分析在候選基因SH3GL1的10個外顯子中,共發(fā)現(xiàn)12處堿基變異,分別位于第22處、4、53處、6、8和102處,非編碼區(qū)六個外顯子上。其中先證者基因編碼MRNA第515位堿基如果為T,則形成終止密碼子TAG,導致蛋白閱讀框發(fā)生改變可能為107518區(qū)域堿基,或為7071213堿基,蛋白質(zhì)序列預測分析顯示編碼截短蛋白,從而影響蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)。結(jié)論1AIS是遺傳病年齡發(fā)病率分析顯示75%在11~14歲之間,比較集中,屬于遺傳病的特點;病例家族發(fā)病率和先證者一級親屬、二級親屬和三級親屬的發(fā)病率均明顯高于參照群體平均發(fā)病率,具有明顯的家族聚集性;一級、二級和三級親屬的遺傳度均大于84%,證明AIS與遺傳顯著相關(guān)。綜合上述分析結(jié)果證明AIS是遺傳病。2AIS是多基因遺傳病先證者的各級親屬發(fā)病率均明顯高于參照人群發(fā)病率;同胞發(fā)病率遠比12或1低;與先證者的親緣關(guān)系越近,發(fā)病率越高,有明顯的家族性聚集傾向。綜合分析證明AIS屬于多基因遺傳病。3基因SH3GL1是MS的致病基因之一堿基序列比對分析證明外顯子區(qū)域內(nèi)的10處堿基變異位于編碼區(qū)屬于結(jié)構(gòu)基因的變異,2處位于非編碼區(qū)內(nèi)的變異可能處于調(diào)控區(qū)域,先證者SH3GL1第5外顯子的第515位堿基如果發(fā)生C→T突變,將形成終止密碼子,導致蛋白閱讀框發(fā)生改變,通過氨基酸序列預測分析,編碼截短蛋白,從而顯著影響蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)。由此可以證明基因YHSGL1是AIS候選基因之一。
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    • 簡介:目的該課題旨在開發(fā)新的21號染色體STR基因座為各領(lǐng)域的應(yīng)用提供更多可供選擇的STR遺傳標記研究21號染色體上新的STR基因座在成都漢族群體中的遺傳多態(tài)性檢驗基因座的獨立性以期應(yīng)用于法醫(yī)學個人識別和親子鑒定用STR構(gòu)建DOWN綜合征診斷系統(tǒng)進行初步的臨床應(yīng)用研究方法尋找人類21號染色體DNA序列中新的STR基因座利用PRIMER3軟件設(shè)計引物應(yīng)用PCR方法對基因座進行擴增電泳分型對挑選出的STR基因座所有的等位基因測序構(gòu)建等位基因分型標準物并按國際法醫(yī)遺傳學會ISFG的推薦原則命名等位基因調(diào)查21號染色體上新發(fā)現(xiàn)的STR基因座在成都漢族群體中的等位基因頻率和基因型分布采用Χ檢驗分析新發(fā)現(xiàn)的STR基因座之間的相互獨立性構(gòu)建DOWN綜合征診斷系統(tǒng)計算系統(tǒng)的敏感度和特異度并運用Χ檢驗比較該方法與細胞遺傳學方法的檢驗結(jié)果根據(jù)我們提出的公式對STR遺傳標記及診斷系統(tǒng)的效能進行定量評估結(jié)論利用21號染色體的DNA序列信息我們發(fā)現(xiàn)了7個多態(tài)性較好、易于準確分型的STR基因座證實其中5對基因座相互獨立可在法醫(yī)學個人識別和親子鑒定中同時使用所構(gòu)建的DOWN綜合征分子遺傳學診斷系統(tǒng)具有較高的診斷效能可對DOWN綜合征進行確診盡管其陰性結(jié)果需結(jié)合其它的診斷方法該研究提出的概率計算公式為此類實驗診斷方法的遺傳標記效能評估奠定了基礎(chǔ)
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      上傳時間:2024-03-10
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    • 簡介:復旦大學博士學位論文甲狀腺乳頭狀癌的核外分子遺傳和表觀遺傳學研究姓名孫團起申請學位級別博士專業(yè)腫瘤學指導教師吳毅20070406復旦大學攻讀博士學位研究生畢業(yè)論文中文摘要甲狀腺乳頭狀癌的核外分子遺傳和表觀遺傳學研究研究生孫團起導師吳毅教授目的1檢測甲狀腺乳頭狀癌組織中線粒體DNAMTDNAD環(huán)區(qū)的突變情況,探討其是否為突變熱點2檢測甲狀腺乳頭狀癌組織中MTDNA含量拷貝數(shù)變化,分析其與臨床病理的關(guān)系3檢測甲狀腺乳頭狀癌組織中腫瘤抑制基因RASSFIA、P16咖№和ATM啟動子區(qū)異常甲基化,探討其與臨床病理的關(guān)系方法1采用自身對照研究,對35例甲狀腺乳頭狀癌患者的癌組織和外周血淋巴細胞抽提MTDNA,再行PCR擴增和直接測序方法對MTDNAD環(huán)的兩個高變區(qū)HVRI和IIVRII進行突變檢測。2應(yīng)用TAQMAN實時熒光定量PCR方法檢測29例甲狀腺乳頭狀癌、14例甲狀腺腺瘤和1L例結(jié)節(jié)性甲狀腺腫及其配對正常甲狀腺組織的MTDNA含量變化3應(yīng)用甲基化特異性PCR方法檢測52例甲狀腺乳頭狀癌、14例甲狀腺腺瘤和LL例結(jié)節(jié)性甲狀腺腫及其配對正常甲狀腺組織中RASSFIA、PL6I“O“和ATM基因啟動子區(qū)的異常帚基化。結(jié)果1在35例甲狀腺乳頭狀癌患者中有2例發(fā)現(xiàn)突變,突變率為57%突變位點5個,都在HVRII區(qū),均為同質(zhì)性突變,其中2個屬于微衛(wèi)星不穩(wěn)定,其余3個屬于堿基置換突變研究同時發(fā)現(xiàn)2個尚未報道的多態(tài)位點NT324CG;NTL6092T“A229例甲狀腺乳頭狀癌中MTDNA相對含量為22413421724配對癌旁正常組織MTDNA相對含量為886啦“06明顯高于癌旁正常組織PO053RASSFLA基因啟動子區(qū)在甲狀腺乳頭狀癌組織和癌旁組織中的甲基化率分別為654%和423%,癌組織中的甲基化率不僅高于癌旁正常組織,也高于甲狀腺良性病變P005
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    • 簡介:湖北麥冬LIRIOPESPICATATHUNBLOURVARPROLIFERAYTMA為中國藥典2000年版新增品種山麥冬的變種為湖北省的特有品種具有養(yǎng)陰生津、潤肺清心、除煩安燥等功效該論文主要從以下幾個方面對湖北麥冬進行了研究①湖北麥冬種質(zhì)資源的收集、外觀性狀和栽培學方面的研究②對GAP基地湖北麥冬的染色體進行了核型分析③采用分子生物學方法對湖北麥冬不同品種及其近緣植物的遺傳關(guān)系進行了研究研究結(jié)果如下1對GAP基地的湖北麥冬的形態(tài)學特征進行了觀察和詳細的描述研究了不同栽培措施對湖北麥冬單葉葉面積、塊根膨大程度、塊根數(shù)、產(chǎn)量和干物質(zhì)含量的影響表明了湖北麥冬早期移栽和生長期摘花梗能使干物質(zhì)含量增加塊根數(shù)增多從而可提高種植產(chǎn)量和品種質(zhì)量2用壓片法對湖北麥冬的染色體進行核型分析結(jié)果表明其染色體條數(shù)為54條是3倍體核型公式為2N3X5430M6SAT24SM這與形態(tài)學所觀察到湖北麥冬開花后不結(jié)實的現(xiàn)象相吻合3采用RAPD方法對湖北麥冬不同品種及其近緣植物的遺傳多樣性和親緣關(guān)系進行了研究結(jié)果檢測到湖北麥冬基因組74個位點多態(tài)位點54個占757%證明湖北麥冬不同品種間有豐富的遺傳多樣性并得到遺傳關(guān)系聚類圖和樣品相關(guān)系數(shù)表表明了湖北麥冬不同品種及其近緣植物間親緣關(guān)系的遠近及影響不同品種遺傳距離大小的主要因素是采集產(chǎn)地居群類型的不同與栽培方式無明顯關(guān)系
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      上傳時間:2024-03-11
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    • 簡介:衰老AGEINGSENESCENCE又稱老化通常是指在正常狀況下生物發(fā)育成熟后隨年齡增加自身機能減退內(nèi)環(huán)境穩(wěn)定能力與應(yīng)激能力下降結(jié)構(gòu)、組分逐步退行性變趨向死亡不可逆轉(zhuǎn)的現(xiàn)象。20世紀后期在老年學研究中引入分子生物學與細胞生物學理論與技術(shù)后研究者們發(fā)現(xiàn)衰老雖然機理復雜涉及面廣學說雖多但不外乎遺傳與環(huán)境兩個方面。位于染色體8P12上的WRN基因突變所致的隱性遺傳病WEMER早老綜合征成人型早老癥同一種屬不同個體具有不同衰老表型和不同的壽命家系調(diào)查、雙生子以及流行病學研究都表明衰老是一個高度個體化的過程衰老與遺傳因素密切相關(guān)。DNA多態(tài)性研究進展可分為3階段限制性片段長度多態(tài)性、微衛(wèi)星多態(tài)性和單核苷酸多態(tài)性SINGLENUCLEOTIDEPOLYMPHISMSNP。SNPS相比于前兩代遺傳標記其密度高、遺傳穩(wěn)定性好、具有代表性、分布不均勻且其分析易自動化。SNPS的變化尤其是位于編碼區(qū)和位于表達調(diào)控序列中SNPS的改變可能引起蛋白質(zhì)表達的質(zhì)或量的變化進而影響蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)或表達水平。因而研究SNPS有助于解釋個體的表型差異、不同群體和個體對于衰老和長壽的易感性差異。怎樣從眾多SNPS中找到確有臨床意義的與衰老和衰老疾病相關(guān)的SNP位點是揭示人類衰老致病原因的重要途徑之一。胰島素胰島素樣生長因子1INSULININSULINLIKEGROWTHFACTINSULINIGF1途徑交互作用于許多種蛋白同時調(diào)控大量的基因表達SIRT1、IL6、P16及KLOTHO四個基因或者參與INSULINIGF1信號途徑或者和INSULINIGFI1信號途徑交互作用從而可能影響衰老的進程。IL6是一個炎性細胞因子其能影響多個炎性和衰老相關(guān)疾病的發(fā)生、發(fā)展從而可能最終影響衰老的進程SIRT1是一個哺乳動物NAD依賴的脫乙?;冈诩毎芷谕虳NA修復中起作用其能減弱凋亡調(diào)節(jié)細胞老化P16相關(guān)于端粒縮短在細胞衰老時其表達常明顯增強KLOTHO能影響細胞內(nèi)信號通路調(diào)節(jié)成纖維細胞生長因子23信號P53P21CAMP蛋白激酶CPKC和WNT信號通路修復內(nèi)皮的機能障礙和調(diào)節(jié)一氧化氮的產(chǎn)生從而可能影響衰老的進程。本研究采用候選基因和病例對照的方法以中國沈陽地區(qū)漢族健康人群為研究對象按照生物學年齡分組用SNAPSHOT方法檢測SIRT1、IL6、P16及KLOTHO四個基因10個位點的基因型及基因頻率探討這些基因SNP與衰老的關(guān)系。所獲得的結(jié)果有助于深入闡明衰老的分子遺傳學機制并可為實現(xiàn)在基因水平上的衰老個體化評價乃至將來診斷治療病理性衰老奠定重要的實驗基礎(chǔ)。材料與方法本研究采用病例對照研究從1500余人中篩選出健康人442人從反映腦功能、心功能、血管功能、肺功能、腎臟功能和反應(yīng)R常生活狀況的一般指標總計70個指標利用統(tǒng)計學方法挑選出生物學標志物并構(gòu)建生物學年齡積分BIOLOGICALAGESCEBAS計算公式將研究對象按照生物學年齡分組分為衰老組228例和年輕組213人。利用生物信息學方法在四個候選基因上選擇10個SNPS遺傳標記。利用SNAPSHOT方法檢測個體基因型。用擬合優(yōu)度卡方檢驗驗證每個SNP基因型在抽樣群體中的分布是否符合HWHARDYWEINBERG平衡用GENEPOP34軟件檢驗HW平衡。采用SPSS統(tǒng)計軟件分析每個SNP位點等位基因及基因型在年輕組與衰老組之間的分布是否有顯著性差異從而推測SNPS位點與衰老的關(guān)系。使用SPSS統(tǒng)計軟件對相關(guān)數(shù)據(jù)進行X2檢驗、計量資料采用均數(shù)±標準差表示以P<005為顯著性水準。使用SHESIS軟件分析SNPS之間的連鎖不平衡程度、分析同一基因不同位點之間的相互作用。實驗結(jié)果1、挑選出7個生物學標志物TMTCCRMVESIMTMINDMAXMMEF7525PP并成功構(gòu)建生物學年齡積分公式BAS0169CCR0179MVES0184IMTMIN0155DMAX0158MMEF75250226CA0148PP0159TMT。2、衰老組和年輕組每個SNP基因型的HW平衡檢驗都符合HW遺傳平衡我們所選擇的研究對象的基因頻率能夠代表群體的基因分布。3、IL6的基因多態(tài)性在健康衰老組和對照年輕組中頻率分布比較RS2066992位點兩組間各基因型無顯著性差異X2005P082等位基因頻率在兩組間無顯著性差異X200909595%CI070~131P076RS1524107位點兩組間各基因型無顯著性差異X2032P057等位基因頻率在兩組間無顯著性差異X2020P066093295%CI068127。4、P16基因的基因多態(tài)性在衰老組和年輕組中頻率分布比較RS2811708位點兩組間各基因型無顯著性差異X2028P059等位基因頻率在兩組間無顯著性差異X2024P06209495%CI072122RS3731245位點兩組間各基因型無顯著性差異X2034P079等位基因頻率在兩組間無顯著性差異X201509495%CI070~127P070。5、KLOTHO基因的基因多態(tài)性在衰老組和年輕組中頻率分布比較RS571118位點衰老組CC型頻率高于對照組而CT型和TT型頻率低于對照組有顯著性差異X2728P0006T等位基因和C等位基因在兩組間有顯著性差異X2678P0009I42495%CI109186。RS1207568位點衰老組CC型CT型和TT型頻率在衰老組和年輕組比較差異有顯著性X2518P0023等位基因頻率在兩組間比較也有顯著性差異X251813195%CI078~138P002。RS2149860位點兩組間各基因型無顯著性差異X2030P058等位基因頻率在兩組間無顯著性差異X203110895%CI083~140P058。KLOTHO基因的RS648202位點兩組間各基因型無顯著性差異X2011P074等位基因頻率在兩組間無顯著性差異X2021P06409395%CI069126。6、SIRT1基因的基因多態(tài)性在衰老組和年輕組中頻率分布SIRT1基因的RS3758391位點兩組間各基因型無顯著性差異X2013P071等位基因頻率在兩組間無顯著性差異X207111495%CI083~202P002。SIRT1基因的RS4746720位點衰老與對照組的基因型及基因頻率相比較衰老組CC型頻率低于對照組差異有顯著意義X2385P004C等位基因頻率低于對照組差異有顯著性意義X243513395%CI102~173P003。7、連鎖不平衡分析結(jié)果KLOTHO的RS571118RS2149860RS1207568RS648202的四個位點之間顯示D<06RS571118RS2149860RS1207568RS648202四個位點之間不存在連鎖不平衡。IL6的RS2066992RS1524107之間D099RS2066992RS1524107位點之間強相關(guān)。P16的RS2811708RS3731245的之間D092RS2811708RS3731245位點之間強相關(guān)。SIRT1的RS3758391RS4746720位點之間進行連鎖不平衡及單倍型分析。結(jié)果顯示D053RS3758391RS4746720位點之間不相關(guān)。結(jié)論1、成功地構(gòu)建了生物學年齡積分公式按照生物學年齡分組較傳統(tǒng)時序年齡更合理地反映個體的衰老化進程。2、KLOTHO基因的RS571118的GG基因型和RS1207568位點CC基因型可能為沈陽漢族健康人群衰老的危險因素其遺傳易感性主要來自于等位基因G和C。KLOTHO基因的RS2149860和RS648202的兩個位點的多態(tài)性和沈陽漢族健康人群的衰老未見相關(guān)。3、IL6基因的RS2066992RS1524107的兩個位點的多態(tài)性和沈陽漢族健康人群衰老未見相關(guān)。4、P16基因的RS2811708RS3731245的兩個位點的多態(tài)性和沈陽漢族健康人群衰老未見相關(guān)。5、SIRT1基因的RS4746720位點CC基因型可能為沈陽漢族人群衰老的危險因素其遺傳易感性主要來自于等位基因CSIRT1基因的RS3758391位點的多態(tài)性和沈陽漢族健康人群衰老未見相關(guān)。
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    • 簡介:背景以染色體顯帶為基礎(chǔ)的常規(guī)細胞遺傳學技術(shù),包括染色體G顯帶、高分辨及其它顯帶技術(shù)(R、Q、N、C、G11、X小體、Y小體、SCE),在染色體研究中發(fā)揮了很重要的作用,并發(fā)現(xiàn)了許多染色體綜合征。然而,這些技術(shù)也有其自身的局限性,如它們一般只適用于中期染色體而不適用于間期有核細胞,分辨率僅能達到3000KB,無法確定許多標記染色體的來源等。目的為了克服上述局限性,本研究旨在應(yīng)用一套以熒光原位雜交(FISH)技術(shù)為基礎(chǔ)的分子細胞遺傳學技術(shù),結(jié)合細胞遺傳學對染色體微小異常進行檢測與定位,探討染色體末端結(jié)構(gòu)異常和染色體數(shù)目異常的一些可能形成機制,為進一步診斷和預防染色體異常提供依據(jù)。方法采用常規(guī)G帶、高分辨、N帶以及FISH技術(shù)對5例常規(guī)染色體分析疑有染色體異常的患者的外周血淋巴細胞、羊水細胞進行相應(yīng)染色體異常的檢測。結(jié)果常規(guī)染色體分析和FISH檢測結(jié)果顯示患者1診斷為11號與22號染色體相互易位攜帶者,其同源22號染色體隨體增加,其核型為46,XX,T(1122)(Q25;Q13)DN,22PSMATISHT(1122)(RP11232E17;RP11232E17),排除了22號同源染色體平衡易位?;颊?核型為46,XX,DEL(4)(P152P161)DN?;颊?核型為45,X7346,X,R(X)(P22Q22)26,患者4核型為45,X7146,X,R(X)(P11Q21)29?;颊?核型為45,X2946,X,IDIC(Y)(Q10)31ISH(X)(P1121)(RP11292J24),ISHIDIC(Y)(Q10)(RP11115H132)(SRY)。結(jié)論1FISH技術(shù)拓展了細胞遺傳學的檢測范圍,提高了細胞遺傳學識別異常的能力。精確定位了一例過度生長并伴有智力低下患者;準確鑒定了兩例X染色體為環(huán)狀染色體異常的病人,并明確區(qū)分一例標記染色體為Y染色體異常病例,為臨床診斷與治療提供了依據(jù)。2FISH技術(shù)雖有優(yōu)點但也有一定的局限性,只有在常規(guī)核型分析提供的線索指引下,恰當?shù)倪x用相應(yīng)的探針進行FISH檢測,才能進一步明確染色體異常的性質(zhì)。本研究即通過高分辨聯(lián)合FISH技術(shù),成功地糾正了一外院錯診病例,并挽救了一例正常胎兒。3FISH技術(shù)只是常規(guī)核型分析技術(shù)的必要補充,不可能完全代替常規(guī)染色體核型分析。
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    • 簡介:Y1414189北京訴和醫(yī)學院蹲上研究生論文論文題目NSPCL沉默日似基因的表觀遺傳學機制研究研究生姓名導師姓名學科專業(yè)入學時間所在院所吳旭東袁建剛教授強伯勤教授彭小忠教授生物化學與分子生物學2004年8月基礎(chǔ)醫(yī)學研究所2008年10月北京協(xié)和醫(yī)學院博士研究生論文體POLYCOMBR印RESSIVECOMPLEX2,PRC2和維持復合體POLYCOMBR印RESSIVECOMPLEX1,PRCL,其中PRC2成員EZH2能引起組蛋白H3K27三甲基化H3K27TRIMETHYLATION,ME3H3K27,這一修飾又能募集PRCL復合體進一步維持靶基因的轉(zhuǎn)錄抑制。近年來研究還發(fā)現(xiàn),PCGS的轉(zhuǎn)錄抑制效應(yīng)與DNA甲基化DNAMETHYLATION緊密相關(guān),而后者也是參與基因轉(zhuǎn)錄抑制的一種重要的表觀遺傳學修飾形式,在哺乳動物細胞內(nèi)由DNA甲基轉(zhuǎn)移酶DNAMETHYLTRANSFERASES,DNMTSDNMTL負責維持DNA甲基化。通過RTPCR實驗,我們發(fā)現(xiàn)PRC2成員EZ月R2或DNA甲基轉(zhuǎn)移酶刪丌敲低、或5一AZADC一種DNMTS抑制劑處理的HELA細胞中,付口煳7的表達也去抑制,即EZH2和DNA甲基化也參與了刪7基因的沉默。接下來,我們致力于揭示PCGS介導的組蛋白修飾與DNA甲基化如何協(xié)調(diào)而參與刪基因沉默。通過CHIP和基因組亞硫酸氫鹽修飾后測序BISULFITESEQUENCIN曲實驗,我們發(fā)現(xiàn)在HELA細胞中當PRC2成員胱敲低之后,將導致DNA甲基轉(zhuǎn)移酶DNMTL和PRCL成員NSPCL在刪7和H似BJ3基因啟動子區(qū)的結(jié)合都明顯減少;而敲低NSPCL之后,EZH2的募集和ME3H3K27水平不受影響,但是DNMTL結(jié)合卻被顯著抑制,并且相應(yīng)的DNA甲基化的水平也明顯下降;敲低刪”或者用其抑制劑5AZADC處理細胞,EZH2結(jié)合沒有變化,但NSPCL結(jié)合減少。因此,在刪基因沉默過程中,EZH2介導的ME3H3LQ7募集NSPCL/RING2復合體,后者促進相應(yīng)區(qū)域的H2A泛素化;同時,EZH2可以直接募集DNA甲基轉(zhuǎn)移酶DNMTS,起始并維持相應(yīng)CPG島的DNA甲基化;而下游的H2A泛素化及DNA甲基化這兩種表觀遺傳學修飾之間不是孤立的,而是相互依賴INTERD印ENDENT的,因為無論干擾舭J還是刪丌都會影響到對方在靶基因調(diào)控區(qū)的結(jié)合和功能,使靶基因去抑制,即它們協(xié)同作用,維持觥靶基因的穩(wěn)定、長期、不可逆的沉默。本論文揭示了PCG家族蛋白NSPCL的一種轉(zhuǎn)錄調(diào)控模式,這一模式與近年來提出的腫瘤發(fā)生的表觀遺傳學機制相似,建立了NSPCL與其它表觀遺傳調(diào)節(jié)因子如其它PCG蛋白和DNMTS在細胞增殖、腫瘤發(fā)生過程中的聯(lián)系。并且,其中對調(diào)節(jié)刪靶基因轉(zhuǎn)錄的研究,為進一步闡明NSPCL在胚胎發(fā)育過程中的作用奠定了基礎(chǔ)。關(guān)鍵詞POLYCOMBNSPCL腫瘤表觀遺傳學組蛋白泛素化DNA甲基化4
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    • 簡介:中圖分類號UDCR7464610碩士學位論文學校代碼Q53359例中國漢族CMT1X患者臨床、電生理和分子遺傳學特征CLINICAL,ELECTROPHYSIOLOGICALANDMOLECULARGENETICCHARACTERISTICSOF59CHINESEHANPATIENTSWITHCMT1X作者姓名學科專業(yè)研究方向?qū)W院系、所指導教師副指導教師李旭寧臨床醫(yī)學神經(jīng)病學湘雅三醫(yī)院資曉宏教授張如旭副教授論文答辯日期趁旦堇≥多答辯委員會主席中南大學2013年5月基金資助國家自然科學基金81071001國家自然科學基金30900805II
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    • 簡介:中國協(xié)和醫(yī)科大學中國醫(yī)學科學院博士學位論文肺癌的分子遺傳學改變及其臨床意義姓名安倩申請學位級別博士專業(yè)腫瘤學指導教師程書鈞200251中國協(xié)和醫(yī)科大學博士學位論文MOLECULARGENETICALTERATIONSINCHINESELUNGCARCINOMASBIOLOGICALANDCLINICALIMPLICATIONSABSTRACTLUNGCANCERHASBECOMETHELEADINGCAUSEOFCANCERRELATEDDEATHINCHINA,ANDTHEMORTALITYOT、THISNEOPLASIACOULDBEGREATLYREDUCEDBYDIAGNOSISANDTREATMENTATTHEEARLIESTSTAGESOFTHEDISEASEITISOFGREATSIGNIFICANCETODEVELOPEFFECTIVEDETECTIONMETHODSFOREARLIERDIAGNOSISOFLUNGCANCERUSINGMICROSATELLITEANALYSISANDSEMINESTEDMETHYLATIONSPECIFICPCRMSPLOSSOFHETEROZYGOCITYLOHINTUMORSUPPRESSORGENES’LOCIANDP16PROMOTERHYPERMETHYLATIONWEREDETECTEDINCLINICALSAMPLESFROMPRIMARYLUNGCANCERPATIENTSOMRDATASHOWED1FHIT,P53ANDP16WEREFREQUENTLYLOSTINTUMORTISSUESOTHERGENES,LIKEAPC,DPC4,DCCATMANDBRCAL,SEEMEDNOTTOBETHETARGETSOFALLELICLOSSESINTHECORRESPONDINGCHROMOSOMALREGIONSTHEFREQUENCIESOFLOHINTHREECHROMOSOMALREGIONSWHEREPRLTS,PTENANDP57LOCATEDWERESIGNIFICANTLYDIFFERENTBETWEENSQUAMOUSCELLCARCINOMASCCMADADENOCARCINOMAADCPRLTSWASMOREFREQUENTLYLOSTINADCTHANINSCC,IMPLICATINGALLIMPORTANTROLEOFTHISGENEINTHEDEVELOPMENTOFADC2SEMINESTEDMSPISASENSITIVEANDSPECIFICTECHNIQUEWHICHCANBEUSEDTOANALYZEABERRANTMETHYLATIONINTHEDNASAMPLES砒NANOGRAMQUANTITYFROMLUNG2
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    • 簡介:目的脆性X綜合征FRAGILEXSYNDROME,F(xiàn)XS是僅次于唐氏綜合征的發(fā)病率較高的一種遺傳性智力低下疾病,為不完全顯性X連鎖遺傳病,其發(fā)病機制是因為脫氧三核苷酸串聯(lián)重復拷貝數(shù)大大增加所致,主要表現(xiàn)為智力低下。由于在青春期前兒童的臨床表現(xiàn)無特異性,主要依據(jù)實驗室診斷。目前常用的實驗室診斷方法都有不足之處,本研究希望建立一套準確、快速、廉價的實驗室檢測FXS的方法。方法采用細胞遺傳學與分子遺傳學相結(jié)合的方法。細胞遺傳學方法首先對130例樣本的外周血淋巴細胞進行培養(yǎng),通過加入5FDU誘導脆性位點的表達,每個樣本鏡下分析100個中期細胞,計數(shù)X染色體脆性位點的表達情況,脆性位點表達率≥4%為陽性;PCR結(jié)合甲基化特異性PCR(MSPCR)的分子遺傳學方法對上述130例樣本的外周血提取基因組DNA,首先對所有男性和女性樣本都進行常規(guī)PCR擴增FMRⅠ基因CGGN重復序列,對不能有效擴增的男性樣本和所有女性樣本再進行MSPCR,用亞硫酸氫鈉對基因組DNA進行修飾,非甲基化的胞嘧啶轉(zhuǎn)變?yōu)槟蜞奏ぃ谆陌奏け3植蛔?,以修飾后的DNA為模板用兩套不同的引物對(甲基化特異性引物對和非甲基化特異性引物對)擴增FMRⅠ基因的CGGN重復序列區(qū),根據(jù)擴增產(chǎn)物片段大小判斷突變類型。結(jié)果對130個疑似病例的外周血細胞遺傳學分析發(fā)現(xiàn)有4例X染色體脆性位點檢出率≥4%(分析100個細胞,脆性位點≥4)。建立了PCR結(jié)合MSPCR方法,測序表明,常規(guī)PCR擴增產(chǎn)物為CGGN重復序列;經(jīng)亞硫酸氫鈉修飾后,未甲基化的CGGN重復轉(zhuǎn)變?yōu)镃AAN重復序列,甲基化的CGGN重復轉(zhuǎn)變?yōu)镃GAN重復序列。并利用該方法對130個臨床疑似病例進行分析,130個疑似病例基因組DNA常規(guī)PCR都能有效擴增FMRⅠ基因CGGN重復序列,產(chǎn)物的CGGN重復數(shù)都在1346P之間。結(jié)論建立了用PCR結(jié)合MSPCR檢測FXS的方法。該方法能同時檢測到FMRⅠ基因CGGN重復數(shù)和CPG島的甲基化情況,并且能對FMRⅠ基因的突變分型,彌補了單獨應(yīng)用PCR、傳統(tǒng)的細胞遺傳學方法、SOUTHERNBLOT等方法的缺點,結(jié)合臨床表現(xiàn),為FXS提供了一種準確、快速、廉價的實驗室檢測方法。
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    • 簡介:目的1、探討基線空腹血糖FASTPLASMAGLUCOSE,F(xiàn)PG與辛伐他汀SIMVASTATIN降總膽固醇TOTALCHOLESTEROL,TC療效的關(guān)系;2、分析體力勞動強度對農(nóng)村高脂血癥患者服用辛伐他汀后血清肌酸激酶CREATINEKINASE,CK變化的影響;3、探討ABCC2ATPBINDINGCASSETTE,SUBFAMILYC,MEMBER2基因G1324A多態(tài)性對服用辛伐他汀后肌酸激酶CK變化的影響。方法2005年3月至6月在安徽某農(nóng)村地區(qū)通過健康體檢篩選原發(fā)性高脂血癥患者,符合血清膽固醇水平TC572~832MMOLL和/或低密度脂蛋白LDL364~650MMOL/L’者,獲得其知情同意后進行辛伐他汀治療和隨訪,服用劑量為20MG/天,總共治療8周。共有408名符合入選標準的高脂血癥患者進入該研究,其中完成研究的374人,另有34人中途退出。所有研究對象于服藥前后分別測定血脂、血糖等生化指標,并進行流行病學問卷、體格檢查和心電圖檢測等,提取DNA進行基因型測定。使用SAS、SPLUS等軟件進行殘差分析、多元線性回歸和廣義線性模型分析等。結(jié)果1TC療效描述經(jīng)8周治療后,男性TC平均下降186MMOL/L,平均下降幅度29%女性TC平均下降215MMOL/L,平均下降幅度為32%;且存在性別差異PO05。2基線血糖與TC療效的多元線性回歸分析殘差散點圖顯示血糖與TC療效存在正相關(guān)的線性趨勢。若其他條件不變,患者基線空腹血糖每增加‘LMMOL/L,8周TC下降值將增加0136MMOL/L。3與服藥前CK相比,服藥8周后男性患者CK平均升高829RETOOL/L,升高幅度約77%;女性CK平均升高927MMOL幾,升高幅度約97%。4體力勞動強度與CK廣義線性模型分析顯示若其他條件不變,輕度體力勞動患者4周CK升高值每增加LMMOL/L,則男性重度體力勞動患者4周CK升高值相應(yīng)增加3309MMOLL;若輕度體力勞動患者8周CK升高值每增加LMMOL/L,則男性重度體力勞動患者8周CK升高值相應(yīng)增加5737MMOL/L,而女性重度體力勞動患者8周CK升高值相應(yīng)增加5742RETOOL/L。5ABCC2基因多態(tài)性與CK廣義線性模型分析顯示以GG基因型人群作為參照,攜帶AAAG基因型與8周CK升高值呈負相關(guān)關(guān)系。在其他條件不變情況下,若攜帶GG基因型患者8周CK升高值每增加LMMOL/L,則攜帶AAAG基因型患者8周CK升高值相應(yīng)降低282LMMOL/L;若攜帶GG基因型患者8周CK升高比值每增加1O,則攜帶AAAG基因型患者8周CK升高比值相應(yīng)降低034。結(jié)論1、本研究發(fā)現(xiàn)基線空腹血糖與辛伐他汀降TC療效存在正相關(guān),女性的相關(guān)關(guān)系顯著;2、農(nóng)村高脂血癥患者服用辛伐他汀治療期間,體力勞動強度會影響CK的升高;3、ABCC2基因G1324A多態(tài)性影響患者服用辛伐他汀治療后CK的升高幅度。
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      上傳時間:2024-03-13
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    • 簡介:中國協(xié)和醫(yī)科大學博士學位論文滋養(yǎng)細胞疾病的遺傳學研究姓名趙峻申請學位級別博士專業(yè)婦產(chǎn)科學指導教師向陽20060501中國協(xié)和醫(yī)科大學博士學位論文縮寫詞NGPBSPCRPEGAPHMPRSDSSETBSTETEMEDTRISUUGULUM英文全稱NANO目.ALNPHOSPHATEBU仃EREDSOLUDONPOLYMERASECHAINREACTIONPOLYETLLYLENE91”01ADIPATEPANIALBYDATIDIFONNMOLEPARTIALR鋤ISSIONSODIUMDODECYLSULPHATESODIUMCHLORID“EDTABUFF缸TRISBUFF醯SALINETRI“EDTABU伍暑RTE婦MEMYLETLLYLENEDIAMINE訂ISHYDMXYMETHYLAMINOMEMAILEUNITMICROGRAMMICMLITERMICMM01PER1ITER2中文全稱納克磷酸鹽緩沖溶聚合酶鏈式反應(yīng).多聚酶鏈反廊聚己二酸乙二醇酯部分性葡萄胎部分緩解十二烷基硫酸鈉氯化鈉/EDTA緩沖液TRIS緩沖鹽水TRIS/EDTA緩沖液四甲基乙二胺三羥甲基氨基甲烷酶單付微克微升微摩爾每升
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      上傳時間:2024-03-11
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    • 簡介:艾滋病即獲得性免疫缺陷綜合征ACQUIREDIMMUNODEFICIENCYSYNDROMEAIDS是由人類免疫缺陷病毒HUMANIMMUNODEFICIENCYVIRUSHIV引起的一種免疫缺陷性疾病人體感染HIV后致使機體免疫功能逐漸降低最后因各種機會性感染而死亡HLV感染流行難以控制的主要原因是其基因具有高度變異性目前HIV感染AIDS尚無法治愈也無有效的疫苗預防截止到2002年底全世界HIV感染人數(shù)已達6000萬已有2400萬人死于艾滋病到2002年12月中國HIV感染人數(shù)已超過100萬正處于艾滋病快速增長期因此有效地預防和治療艾滋病已成為當務(wù)之急該文通過微量全血分離法分離17株HIV1病毒并研究其生物學嗜性、復制動力隨疾病進展的變化應(yīng)用異源雙鏈泳動分析HETERODUPLEXMOBILITYASSAYHMA的方法研究48例HIV1準種的變化與疾病進展的相關(guān)性采用聚合酶鏈式反應(yīng)序列特異性引物技術(shù)POLYMERASECHAINREACTIONSPECIFICSEQUENCEPRIMERSPCRSSP檢測46例中國HIV感染者及AIDS患者HLAA、B、C位點等位基因特異性探討HIV感染與HLA的相關(guān)性結(jié)論1成功應(yīng)用微量全血分離技術(shù)分離出中國17株HIV1病毒株217株HIV1病毒分離株中8例為艾滋病患者其中7例病毒分離株為SI株1例為NSI株9例為HIV1感染者病毒其分離株均為NSI株病毒分離株的表現(xiàn)型與其CD4T淋巴計數(shù)具有顯著的相關(guān)性SI型病毒分離株與AIDS顯著相關(guān)3在對分離到的17株HIV1病毒株的P24抗原檢測中發(fā)現(xiàn)AIDS期病毒分離株的復制動力明顯高于HIV感染期17株HIV1復制動力與CD4T淋巴細胞計數(shù)負相關(guān)與病毒載量呈正相關(guān)4HMA方法檢測48例HIVAIDS準種變化的結(jié)果顯示在不同的疾病時期體內(nèi)病毒變異是不相同的在體內(nèi)CD4細胞計數(shù)較高血漿病毒載量低的個體內(nèi)病毒毒株有根強的變異特征體內(nèi)具有很高的準種復雜度而在CD4細胞計數(shù)很低病毒載量較高的個體病毒基因變異較少病毒準種較為單一5HIV感染的不同時期HIV感染者和AIDS患者體內(nèi)病毒變異是不相同的HIVAIDS準種復雜度與CD4T淋巴細胞計數(shù)相關(guān)SHANONNENTROPY和MMS與CD4T淋巴細胞計數(shù)呈顯著相關(guān)6首次對中國HIVAIDS患者的HLA1類分子等位基因與HIV1感染相關(guān)性進行了研究發(fā)現(xiàn)中國HIV感染者HLAB35的等位基因頻率明顯高于正常對照經(jīng)校正后差異仍有顯著性這可能與HIV感染的易感性有關(guān)提示等位基因HLAB35可能是HIV1感染的易感基因或與致病基因連鎖7中國HIV感染者HLAA32、BL8、B50、B53等位基因頻率高于正常人但差異沒有顯著性
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    • 簡介:肢帶型肌營養(yǎng)不良LIMBGIRDLEMUSCULARDYSTROPHIESLGMD是一組遺傳異質(zhì)性肌源性疾病主要表現(xiàn)為四肢對稱性的近端肌肉進行性無力萎縮。根據(jù)該病的遺傳方式不同常可分為常染色體顯性遺傳LGMD1型和常染色體隱形遺傳LGMD2型1由于不同基因的缺陷每型又分為許多亞型?,F(xiàn)1型有8個亞型1A1H其致病基因已被確定2型有16個亞型2A2P其2A2K致病基因和蛋白產(chǎn)物已被明確3。其他形式的致病編碼基因現(xiàn)還是一個未知數(shù)仍在探索之中。針對本研究家系的臨床特點和病理研究表現(xiàn)初步診斷為LGMD1B型。肢帶型肌營養(yǎng)不良1BLGMD1B是一種罕見的常染色體顯性遺傳病主要表現(xiàn)為進行性的骨盆帶和肩帶肌肉萎縮以對稱性下肢近端進行性肌肉萎縮開始逐漸影響到上肢肌肉萎縮伴有心臟傳導障礙的擴張型心肌病導致心律失常甚至心臟猝死10。LGMD1B與位于1Q21上的核纖層蛋白LAMINAC編碼基因突變相關(guān)臨床資料和基因診斷是對心臟病治療和遺傳咨詢至關(guān)重要的作用。遺傳性脊髓小腦性共濟失調(diào)SPINOCEREBELLARATAXIASSCAS是一類具有高度的臨床異質(zhì)性和遺傳異質(zhì)性的神經(jīng)系統(tǒng)退行性疾病多為常染色體顯性遺傳ADSCAS也有常染色體隱性遺傳SCARS和X連鎖隱性遺傳SCAXS。該病主要累及脊髓、小腦和腦干臨床表現(xiàn)為小腦性共濟失調(diào)伴有構(gòu)音障礙、吞咽困難等復雜的錐體系及錐體外系癥狀。目前已經(jīng)定位了33個SCA亞型的染色體位置克隆了21個SCA亞型的致病基因其中與動態(tài)突變有關(guān)的亞型主要有SCA1、SCA2、SCA3、SCA6、SCA7、SCA17編碼區(qū)CAG擴增SCA85UTR的CTG擴增SCA125UTR的CAG擴增SCA10內(nèi)含子ATTCT擴增SCA31內(nèi)含子TGGAA擴增和SCA36內(nèi)含子GGCCTG擴增21。先天性房間隔缺損ATRIALSEPTALDEFECTASD是指心房在發(fā)育過程中房間隔吸收和融合出現(xiàn)異常左右心房之間殘留未關(guān)閉的房間隔是先心病中最常見的病變。房缺可單獨存在也可與其他心血管畸形合并存在絕大部分由遺傳因素和環(huán)境因素共同作用引起但也有單基因遺傳的房缺家系。這次研究主要對來自西南地區(qū)的1例LGMD和1例SCA伴房間隔缺損先證者進行家系的調(diào)查并收集相關(guān)的臨床資料分別對其進行基因診斷和突變篩查不僅對患者確認了診斷還可以確認或者排除家系中其他的癥狀更細化了基因突變圖譜對家系成員的生育指導、疾病控制也有重要意義。第二章房室傳導阻滯一家系的遺傳學研究研究方法對1例先證者進行了家系調(diào)查和臨床資料的相關(guān)收集采集包括先證者在內(nèi)的8名家系成員以及100名健康對照者的靜脈血標本并提取了基因組DNA。采用聚合酶鏈式反應(yīng)和直接測序的方法對收集到的家系成員分別進行肢帶型肌營養(yǎng)不良癥相關(guān)致病基因進行突變檢測和共分離分析。研究結(jié)果1該家系為常染色體顯性遺傳模式先證者臨床表現(xiàn)為對稱性四肢肌肉無力活動后胸悶、心悸等癥。家族史呈陽性。2在家系患者中發(fā)現(xiàn)了一個新的LMNA基因第9號外顯子22514位核苷酸出現(xiàn)TC的突變C1558TC該突變導致LMNA基因編碼蛋白的第520位氨基酸由色氨酸變?yōu)榫彼酺RP520ARG其突變位點為本研究首次發(fā)現(xiàn)。家系的正常成員及選取的健康對照中均未發(fā)現(xiàn)該突變位點。3結(jié)合家族史、臨床表現(xiàn)、常規(guī)實驗室的檢查和致病基因LGMD1B突變檢測本研究的先證者及患病的家系成員可明確診斷為LGMD1B篩選無癥狀家庭成員散發(fā)病例。第三章脊髓小腦共濟失調(diào)合并房間隔缺損一家系的遺傳學研究方法對4代SCA家系分別對脊髓小腦共濟失調(diào)和房間隔缺損兩個疾病表型進行臨床診斷、家系調(diào)查和系譜分析收集相關(guān)臨床資料及采集靜脈血標本通過聚合酶鏈式反應(yīng)和直接測序的方法對收集到的家系成員分別進行脊髓小腦性共濟失調(diào)和房間隔缺損相關(guān)致病基因進行突變檢測和共分離分析。研究結(jié)果1該家系4代共有脊髓小腦共濟失調(diào)現(xiàn)癥和已故共15名呈常染色體顯性遺傳模式病史回顧示家系患者均無明確誘因出現(xiàn)行走不穩(wěn)、飲水嗆咳、言語不清等共濟失調(diào)的臨床特征?;蛟\斷發(fā)現(xiàn)該家系患者SCA3致病基因CAG異常擴增。2在家系中還發(fā)現(xiàn)包括先證者在內(nèi)的5名先天性房缺患者對房缺相關(guān)基因進行突變篩查發(fā)現(xiàn)3名房缺患者均攜帶有MYH6基因編碼區(qū)的一個錯義突變C1154CT導致第385位氨基酸由絲氨酸變?yōu)榱涟彼酳ER385LEU其余家系成員無此突變。3結(jié)合家族史、臨床表現(xiàn)、常規(guī)實驗室的檢查和致病基因突變檢測本研究的先證者可明確診斷為脊髓小腦共濟失調(diào)伴房間隔缺損。4該家系中SCA和ASD兩種獨立的疾病表型都分別以常染色體顯性遺傳的方式傳遞并且分別由SCA3的致病基因和MYH6基因的突變導致。
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      上傳時間:2024-03-11
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