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文檔簡介
1、昆蟲是動(dòng)物界中最大的類群,現(xiàn)存種類已超過100萬種。我國昆蟲資源相當(dāng)豐富,約占世界昆蟲總數(shù)的10%。昆蟲共生菌可能是新型天然產(chǎn)物的廣泛來源和新活性天然產(chǎn)物的重要來源,但是昆蟲腸道微生物的研究尚欠系統(tǒng)和深入,所涵蓋的昆蟲種類僅零星見于少數(shù),如蝎子、蜜蜂等。較為詳細(xì)的研究主要集中在白蟻,還有松毛蟲等農(nóng)作物害蟲,而美洲大蠊腸道微生物的研究鮮有報(bào)道。
本研究主要運(yùn)用數(shù)值分類,BOX-PCR,PCR-RFLP和16S rRNA基因序列的
2、系統(tǒng)發(fā)育分析以及免培養(yǎng)方法對樣品中內(nèi)生細(xì)菌多樣性進(jìn)行研究,結(jié)果表明,美洲大蠊成蟲腸道內(nèi)有較為豐富的細(xì)菌多樣性。主要結(jié)果如下:
數(shù)值分類的分析結(jié)果表明,32株代表菌株在82%相似水平上可分為12個(gè)表觀群,群11是最大的類群,包含14株細(xì)菌;而代表菌株SCAU13,SCAU78,SCAU23,SCAU75,SCAU9,SCAU92分別單獨(dú)成群。
在PCR-RFLP分析中,用四種限制性內(nèi)切酶(HaeⅢ,HinfⅠ,TaqⅠ
3、,MspⅠ)處理后,HaeⅢ有8種酶切圖譜類型,HinfⅠ有7種酶切圖譜類型,TaqⅠ有3種酶切圖譜類型,MspⅠ有2種酶切圖譜類型,酶HhaⅢ較其他3種酶的帶型豐富,可以說HhaⅢ是研究細(xì)菌多樣性較為有效的酶。
在BOX-PCR分析中,在72%的相似水平處,所有的菌株都聚在一起,在86%的相似水平上,供試菌株可分為10個(gè)群。在10個(gè)遺傳群中,群Ⅱ最大,共有21株菌株,其次為群Ⅳ,由7個(gè)菌株組成。
同過測序比對,分離
4、菌株代表20個(gè)物種,屬于4個(gè)大的系統(tǒng)發(fā)育類群(Proteobacteria,Bacteroidetes,F(xiàn)irmicutes,Actinobacteria)的10個(gè)科、15個(gè)屬。多數(shù)菌株屬于Proteobacteria門(15株,占46.9%)和Bacteroidetes門(10株,占31.3%)。Shannon-Wiener多樣性指數(shù)(H)為4.87,均勻度指數(shù)(E)為1.62,表明美洲大蠊相關(guān)可培養(yǎng)細(xì)菌具有較高的物種多樣性和均勻度。
5、
在免培養(yǎng)分析中,相似性比對分析表明,26個(gè)OTU屬于細(xì)菌域4個(gè)大的系統(tǒng)發(fā)育群(Proteobacteria,Bacteroidetes,F(xiàn)irmicutes,Actinobacteria)的8個(gè)科、13個(gè)屬,多數(shù)菌株屬于變形菌門(Proteobacteria,占56.9%)和擬桿菌門(Bacteroidetes,占21.4%),其次屬于厚壁菌門(Firmicutes,占18.8%),還有未確定分類的細(xì)菌(unclassifi
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