鱗翅目昆蟲線粒體全基因組結(jié)構(gòu)特點及其比較基因組學分析.pdf

1、合肥工業(yè)大學博士學位論文鱗翅目昆蟲線粒體全基因組結(jié)構(gòu)特點及其比較基因組學分析姓名：洪桂云申請學位級別：博士專業(yè)：農(nóng)產(chǎn)品加工及貯藏工程指導(dǎo)教師：姜紹通魏兆軍20091201粉鼬melete和樟蠶Epyretorum中多數(shù)采用完整的三聯(lián)密碼子TAA或TAG作為終止密碼子，少數(shù)的為不完整的T。5鱗翅目昆蟲的線粒體基因組中蛋白編碼基因密碼子的使用和氨基酸使用都有極強的偏向性，其中NNU和NNA密碼子的使用頻率相當?shù)母?。氨基酸組成中Leu，lie

2、，Phe及Ser的含量最高。6黑紋粉蚴melete和樟蠶Epyretorum的線粒體基因組22個tRNA基因的順序均與其它鱗翅目昆蟲相同，大小在60～72bp之間。除trnSl翻GN)和trnSe(UCN)9b，其余20個tRNA編碼基因的二級結(jié)構(gòu)為典型的三葉草型，堿基錯配以UG和UU為主。7鱗翅目昆蟲AT富含區(qū)存在以下結(jié)構(gòu)特點：rrnS基因下游有一段由‘ATAGA”引導(dǎo)的保守的|8—22bp多聚T結(jié)構(gòu)；除天薊yamamai，合目大蠶蛾

3、Cboisduvalii，煙草天蛾膨sexta#b，在其它已測序的鱗翅目昆蟲線粒體基因組AT富含區(qū)中都有串聯(lián)重復(fù)序列；位于trnM基因上游的AT富含區(qū)含有多聚T結(jié)構(gòu)(在p鏈上)。8基于線粒體基因組13個蛋白質(zhì)編碼基因的核苷酸序列及氨基酸序列的聯(lián)合數(shù)據(jù)集構(gòu)建了15種鱗翅目昆蟲的系統(tǒng)樹，采用BI和ML分析方法建樹，所得拓撲結(jié)構(gòu)類似，都顯示蠶蛾總科，尺蠖蛾總科和夜蛾總科關(guān)系較近，結(jié)果與前人研究的結(jié)果不完全一致。因此關(guān)于鱗翅目的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，有

4、待于基于更多樣本量的線粒體基因組數(shù)據(jù)進行深入探討。本研究首次對鱗翅目黑紋粉蝴melete和樟蠶Epyretorum線粒體基因組進行了序列測定、拼接及線粒體基因組注釋和分析，豐富了鱗翅目昆蟲的線粒體基因組數(shù)據(jù)，為進一步開展昆蟲線粒體譜系基因組學的研究提供重要參考。通過將兩種新測序的線粒體基因組與已測序的13種鱗翅目昆蟲線粒體基因組序列進行比較分析，從結(jié)構(gòu)、比較與進化基因組學的角度總結(jié)了鱗翅目昆蟲線粒體基因組的結(jié)構(gòu)組成以及序列進化等方面的一