子午沙鼠和長(zhǎng)爪沙鼠的分子系統(tǒng)地理學(xué)研究.pdf

1、子午沙鼠和長(zhǎng)爪沙鼠是蒙新動(dòng)物地理區(qū)生物多樣性的重要指示物種，并且分布范圍比較廣，特別是子午沙鼠。因此，它們可以作為研究蒙新區(qū)小型哺乳動(dòng)物系統(tǒng)地理學(xué)比較理想的研究對(duì)象。本研究主要目標(biāo)就是通過分析子午沙鼠和長(zhǎng)爪沙鼠現(xiàn)有種群遺傳變異地理分布格局，試圖探討第四紀(jì)冰期及青藏高原近代的隆升等地質(zhì)事件對(duì)我國(guó)蒙新區(qū)小型哺乳動(dòng)物地理分布格局形成及進(jìn)化的影響。 本研究測(cè)定了77個(gè)子午沙鼠和52個(gè)長(zhǎng)爪沙鼠細(xì)胞色素b基因全序列，通過構(gòu)建了單倍型的系統(tǒng)發(fā)

2、育樹和最小跨度網(wǎng)格圖，對(duì)子午沙鼠和長(zhǎng)爪沙鼠系統(tǒng)地理格局和種群歷史進(jìn)行探討，結(jié)果如下： (一)子午沙鼠的系統(tǒng)地理學(xué)研究 1．通過對(duì)19個(gè)采樣點(diǎn)77個(gè)子午沙鼠個(gè)體的Cyt6基因序列(1140bp)進(jìn)行分析，發(fā)現(xiàn)共有212個(gè)核苷酸變異位點(diǎn)(179個(gè)轉(zhuǎn)換、33個(gè)顛換)，共定義了59種單倍型。單倍型多樣性(H)和核苷酸多樣性(π)分別為O.991和0.047。 2．NJ樹、MP樹和Network圖都提示子午沙鼠種群可以劃分

3、為東南、西北和天山3個(gè)主要類群。3個(gè)類群的分歧大約發(fā)生在1.46～2.18百萬年前，即更新世早期S冰緣期。并且F<,st>分析的結(jié)果也提示3個(gè)類群出現(xiàn)了顯著的遺傳分化(P<0.01)。其中塔克拉瑪干沙漠有可能是天山類群與東南類群隔離的地理障礙。 3．東南類群個(gè)體間的歧點(diǎn)分布呈單峰狀，并且Tajima檢驗(yàn) (D=-2.005，P<0.05)和Fu中性檢驗(yàn)(Fs=-25.045，P<0.05)都是負(fù)值，提示該類群的子午沙鼠可能經(jīng)歷種

4、群增長(zhǎng)和擴(kuò)張事件。從單倍型在各地理單元中的分布來看，該類群未表現(xiàn)出明顯的系統(tǒng)地理格局。 (二)長(zhǎng)爪沙鼠的系統(tǒng)地理學(xué)研究 1．基于6個(gè)種群52個(gè)長(zhǎng)爪沙鼠個(gè)體的線粒體細(xì)胞色素b(Cyt b)基因全序列 (1140bp)的遺傳變異分析，共發(fā)現(xiàn)74個(gè)核苷酸變異位點(diǎn)，包含轉(zhuǎn)換和顛換位點(diǎn)分別為65個(gè)和9個(gè)，共定義37個(gè)單倍型。單倍型多樣性(H)和核苷酸多樣性(π)分別為0.976和0.007。 2.系統(tǒng)發(fā)育分析(NJ樹、MP

5、樹)表明37種單倍型聚為明顯的兩支(A和B支)，其中B支含有賀蘭山東部種群中的3種單倍型，而A支包括其余的單倍型，分歧時(shí)間約為260ka B.P，可能在廬山冰期(240-370ka B.P)經(jīng)歷了一次強(qiáng)烈的種群瓶頸，從而導(dǎo)致其種群的分歧，賀蘭山東部可能作為冰期避難所，包含于所有的譜系分支中。 3.Clade A個(gè)體間的歧點(diǎn)分布呈單峰狀，并且Tajima檢驗(yàn)值 (D=-1.86，P<0.05)和Fu檢驗(yàn)值(Fs=-21.89，P<