細菌轉座子Tn5gusA5在野油菜黃單胞菌8004中轉座規(guī)律分析及生物學驗證.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、廣西大學碩士學位論文細菌轉座子Tn5gusA5在野油菜黃單胞菌8004中轉座規(guī)律分析及生物學驗證姓名：唐江濤申請學位級別：碩士專業(yè)：微生物學指導教師：唐紀良何勇強2003.5.1——一￡!查竺竺圭竺堡塑查ANALYSISANDIDENTI兀CArl0NOFTRANSPOSITIONTENDENCYOFBACTERIALTRANSPOSONTn59usA5INxcc8004ABSTRACTAmutantlibraryofXanthomon

2、ascampestrispvc冊pestris(hereafterXcc)strain8004wasconstructedbyrandomtransposonTn59usA5mutagenesisAfteramplifyinggenomicsequencesflankedwithTn59usA5byTAILPCRandDNAsequencing，thendoingBLASTwithgenomicsequenceofXcc8004，ins

3、ertionsitesof10981mutantswerelocatedpreciselyinXcc8004genomeAnalysisofTn5insertionaltendencyinXcc8004genomewascarriedoutusingprogramsdevelopedbyourbioinformaticsgroupemployingcomputerlanguageVisualBASICandSOLSever2000dat

4、abaseSometendencyofTn59usA5transpositionwerefoundthatallpreferredsitesofTnSgusA5inXcc8004genomicDNAareinAT—richregions；targetsequencesofTn59usA5havesoftiefeaturesthattheprobabilitiesofguanineandcytosinearehighrespectivel

5、yattheheadandtailbaseoftargetsequence；thelevelofgenetranscriptiondoesnotinfluenceinsertiondensityofTn59usA5significantlyInorderIoattesttheabovetendencyofTn59usA5transposition，weconstructedplasmidpL77whichisapUCl9derivati

6、vecontaininglowandhighGCsegmentsofXcc8004genomicDNAAfterculturingandscreeningJMl09：Tn59usA5／pL77weharvested55cloniesofJMl09／pL77：：Tn59usA5DNAsequenceanalysisindicatedthatTn59usA5ispronetoinsertintolowGCcontentregions；gua

7、nineisapreferentialbaseatthefirstplaceandcytosineatthelastsiteoftargetsequenceThetendenciesofTn5transpositionobservedbothinXcc8004genomicDNAandinpL77aresimilarKEYWORDS：Xanthwnonascampestrispvcampestris；BacterialTransposo

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