系統(tǒng)性硬皮病的云數(shù)據(jù)庫創(chuàng)建、臨床數(shù)據(jù)分析、全血miRNA篩查與靶基因預(yù)測.pdf

1、背景和目的:系統(tǒng)性硬皮病(系統(tǒng)性硬化癥，SSc)是一類以皮膚、內(nèi)臟器官（肺、心臟、消化道、腎臟等）進(jìn)行性纖維化為主要表現(xiàn)的自身免疫性結(jié)締組織病(AI-CTD)，可由于廣泛的器官受累引起皮膚硬化、肢體殘障及臟器功能衰竭。目前對該病的發(fā)病機制的研究尚處于探索階段，缺乏行之有效的治療手段。本研究旨在研發(fā)適用于SSc臨床研究的云數(shù)據(jù)庫（網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫），科學(xué)化采集并分析疾病臨床數(shù)據(jù)，同時評估SSc患者健康相關(guān)生活質(zhì)量，并進(jìn)行全血miRNA深度測序、

2、靶基因預(yù)測及GO分析等，以便全面認(rèn)識病情并尋找可能的治療靶點。
　　方法:
　　1、根據(jù)臨床需求建立以SSc為范例的新型網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫——云數(shù)據(jù)庫，首先通過紙質(zhì)表格搜集患者個人情況、圖片資料、標(biāo)本信息、血生化指標(biāo)、皮膚系統(tǒng)受累情況及自評量表計分等，隨后進(jìn)行云數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)錄入、分析、計算;在此過程中改進(jìn)云數(shù)據(jù)庫結(jié)構(gòu)框架及邏輯關(guān)系，總結(jié)云數(shù)據(jù)庫在皮膚科患者信息管理中的應(yīng)用經(jīng)驗。
　　2、以云數(shù)據(jù)庫資料為基礎(chǔ)進(jìn)行SSc流行病學(xué)的

3、描述性研究:搜集205例SSc患者的個人信息及臨床資料，對性別、發(fā)病年齡、病程、臨床表現(xiàn)、重要輔助檢查結(jié)果等進(jìn)行描述及分析。搜集90例SSc患者及50例健康對照的基本資料，分組進(jìn)行HAQ-DI量表、VAS量表及SAQ量表的自評打分，87例SSc患者及50例健康對照進(jìn)行SF-36量表的自評打分;使用秩和檢驗等統(tǒng)計學(xué)方法對量表結(jié)果進(jìn)行比較和分析。
　　3、使用深度測序法檢測8例中國漢族女性SSc患者和5例健康女性患者全血miRNA，確

4、定組間具顯著表達(dá)差異的miRNAs，使用cytoscape等分析軟件及DAVID Bioinformatics Resources6.7等生物信息學(xué)網(wǎng)站進(jìn)行靶基因預(yù)測及GO分析。
　　結(jié)果:
　　1、成功創(chuàng)建了針對SSc臨床研究的云數(shù)據(jù)庫，實現(xiàn)了多點操作和異地存儲等復(fù)雜應(yīng)用。搜集、收錄并處理了205例患者個人資料及臨床信息。
　　2、臨床研究結(jié)果(1)描述性研究結(jié)果:205例患者中性別比例男∶女約為1∶9.1，發(fā)病年齡

5、大于50歲者占42.65％，首發(fā)癥狀最多見為雷諾現(xiàn)象(77.06％)和皮膚硬化(49.49％);合并心臟呼吸系統(tǒng)、腎臟系統(tǒng)、消化系統(tǒng)同時受累的男性占男性患者的25.0％，高于合并多系統(tǒng)受累的女性患者比例(15.0％)，ANA及scl-70等免疫指標(biāo)在不同臨床亞型中陽性率不同，d-SSc患者（彌漫型）陽性率最高，分別為68.09％和51.06％。CREST綜合征的患者100％出現(xiàn)了肺間質(zhì)纖維化的影像學(xué)改變。
　　(2)健康相關(guān)生活質(zhì)

6、量研究結(jié)果:1.HAQ-DI量表結(jié)果顯示在穿衣整飾、個人清潔及獲取、握指等項目病例組較之對照組得分更高，即患者的精細(xì)機體功能較健康人群明顯受損。VAS量表各項得分病例組均明顯高于對照組，表明疼痛感及雷諾現(xiàn)象等癥狀嚴(yán)重影響患者生活質(zhì)量。SAQ量表的四系統(tǒng)獨立得分（血管系統(tǒng)、呼吸系統(tǒng)、消化系統(tǒng)、肌肉骨骼系統(tǒng)）存在明顯組間差異，病例組均高于對照組，表明患者存在多系統(tǒng)功能減退。2.SF-36量表結(jié)果顯示患者在生理機能、生理職能、軀體疼痛、一般健

7、康狀況、精力、社會功能、情感職能、精神健康狀況等各項得分均低于對照組，其中d-SSc組得分最低，HRQOL受損最嚴(yán)重;健康變化得分不具有組間差異。
　　3、病例組（B組）的miRNA的表達(dá)與對照組（C組）存在差異:BⅠ組vsC組出現(xiàn)表達(dá)差異的miRNA共94個，其中上調(diào)37個，下調(diào)57個;BⅡ組vsC組出現(xiàn)表達(dá)差異的miRNA共82個，其中上調(diào)26個，下調(diào)56個。兩組具顯著表達(dá)差異的miRNA對應(yīng)的靶基因重疊部分經(jīng)過GO分析及功能

8、富集共得到相互作用通路的21個靶基因及功能作用蛋白，其中包含5個靶基因:ACVR2B、BMP7、BMPR2、HGP與TNF，這5個靶基因分別指向6個miRNA:miR24-2-5p，miR1976，miR671-5p,miR939-5p,miR1229及miR491-5p。
　　結(jié)論：
　　1、云數(shù)據(jù)庫可以高效的儲存并處理以SSc為代表的自身免疫性皮膚病患者的資料、數(shù)據(jù)、圖片等，數(shù)據(jù)導(dǎo)出與計算快捷靈活、使用方便，其實際應(yīng)用對

9、信息管理、臨床科研及醫(yī)療決策具有重要意義。
　　2、臨床研究結(jié)論
　　(1)描述性研究結(jié)論:SSc女性發(fā)病率明顯高于男性，但男性患者病情更為嚴(yán)重，多系統(tǒng)受累更常見。50歲以上人群的發(fā)病率較高，常見的首發(fā)癥狀為雷諾現(xiàn)象和皮膚硬化。彌漫型SSc患者的ANA和scl-70陽性率較其他亞型更高。CREST綜合征患者肺部影像學(xué)結(jié)果陽性率最高。
　　(2)健康相關(guān)生活質(zhì)量研究結(jié)論:SSc患者較之健康人群的健康生活質(zhì)量存在明顯下降，