中國(guó)H3N2亞型人流感病毒神經(jīng)氨酸酶基因的分子進(jìn)化研究.pdf_第1頁(yè)
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文檔簡(jiǎn)介

1、為了了解中國(guó)大陸流行的H3N2亞型人流感病毒的NA基因變異特征與規(guī)律、進(jìn)化趨勢(shì)和毒株對(duì)NA抑制劑藥物的耐藥情況,本研究按一定原則選取了1968~2005年間國(guó)家流感中心保存的585株H3N2亞型人流感病毒毒株,通過(guò)對(duì)其NA基因的序列測(cè)定,采用生物信息學(xué)工具對(duì)序列進(jìn)行分析,得出以下結(jié)論: (1)我國(guó)歷年來(lái)NA基因的進(jìn)化路徑主要是以一主要的進(jìn)化主干伴隨著多側(cè)支的方式進(jìn)化,序列的差距與年代大體成正比,NA的進(jìn)化不存在明顯的地域特征,流

2、感病毒株新變種的出現(xiàn),在時(shí)間上無(wú)周期性。 (2)疫苗株在我國(guó)歷年來(lái)NA的核苷酸和氨基酸進(jìn)化樹(shù)上存在明顯的滯后現(xiàn)象。 (3)NA氨基酸和核苷酸各年間的進(jìn)化率呈折疊形,流行高峰年份的毒株進(jìn)化率位于峰點(diǎn)。從整體上看,氨基酸的進(jìn)化速度大于核苷酸,抗原決定簇位點(diǎn)的進(jìn)化最快,莖部與跨膜區(qū)次之,但是流行高峰期,具體到哪些位點(diǎn)會(huì)發(fā)生變異,沒(méi)有規(guī)律可言。 (4)NA歷年來(lái)只有48%的氨基酸位點(diǎn)出現(xiàn)變異,大部分位點(diǎn)保守且沒(méi)有氨基酸的

3、缺失與插入。7個(gè)抗原決定簇變異率均不相同,197~199位變異率最高,是最重要的抗原位點(diǎn),而153位變異率最低;所有位點(diǎn)中197位變異最快。NA的酶活性位點(diǎn)高度保守,且我國(guó)1968~2005年間在基因水平上沒(méi)有監(jiān)測(cè)到耐藥株。二硫鍵和糖基化位點(diǎn)相對(duì)保守,糖基化位點(diǎn)突然出現(xiàn)與消失可能是引起流感流行的原因之一。通過(guò)分析還發(fā)現(xiàn)143、267和385位氨基酸的變異率高于抗原決定簇位點(diǎn),但具體生物學(xué)意義不清楚。 (5)本研究是首次對(duì)中國(guó)大陸

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