基于多分類器組合的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用位點(diǎn)預(yù)測(cè)研究.pdf

1、本文從蛋白質(zhì)一級(jí)序列出發(fā)，采用支持向量機(jī)及多分類器組合算法對(duì)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用位點(diǎn)進(jìn)行分類研究，主要工作如下： (1)構(gòu)建包含四種不同類型的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用位點(diǎn)數(shù)據(jù)庫(kù)，數(shù)據(jù)庫(kù)由133條蛋白質(zhì)序列組成。 (2)采用兩種接觸面殘基定義方法，將蛋白質(zhì)序列中的殘基標(biāo)定為接觸面殘基和非接觸面殘基兩類樣本?；谛蛄休喞畔⑻崛》?，從蛋白質(zhì)序列中提取殘基的多種序列輪廓，組成大小不等的殘基信息窗，使用支持向量機(jī)對(duì)其進(jìn)行分類預(yù)測(cè)

2、、比較和分析，結(jié)果表明： 1)兩種接觸面殘基定義方法下，包含多個(gè)相鄰殘基的信息窗所得分類精度較單個(gè)殘基的信息窗均有不同程度的提高，以包含7個(gè)相鄰殘基的信息窗效果最好。 2)并不是相鄰氨基酸越多，支持向量機(jī)對(duì)殘基信息窗的分類精度就越高，相鄰殘基之間存在一定的信息融合問題，當(dāng)二者之間存在矛盾或不協(xié)調(diào)時(shí)，分類結(jié)果將降低；當(dāng)二者信息互補(bǔ)時(shí)，分類結(jié)果將提高。 (3)提出將多分類器組合算法應(yīng)用于蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用位點(diǎn)預(yù)測(cè)