三株原核微生物新屬種的多相分類及不同營養(yǎng)因子對微生物新物種分離的影響.pdf

1、本論文共包括兩部分研究內(nèi)容，第一部分對本實驗室分離自菊三七屬植物的菌株HBUM179779T、HBUM179663T和分離自污泥的菌株3-BNT進(jìn)行多相分類研究；第二部分通過在VL55基礎(chǔ)培養(yǎng)基中添加6種不同的營養(yǎng)因子，利用常規(guī)稀釋和大量稀釋對土壤中的微生物新物種進(jìn)行分離。獲得以下成果：
　　菌株HBUM179779T屬于噬幾丁質(zhì)菌科（Chitinophagaceae）的一個新屬，革蘭氏陰性，細(xì)胞呈短桿狀，具有周生鞭毛，大小為0.

2、2-0.4μm×1.4-1.6μm。根據(jù)16S rRNA基因序列同源性比對，菌株 HBUM179779T與根際假黃桿菌（ Pseudoflavitalea rhizosphaerae） T16R-265T的親緣關(guān)系最近，序列相似性為94.46％?；蚪MDNA（G+C）mol%含量為47.1%。甲基萘醌種類為MK-7。主要脂肪酸類型為iso-C15:1 G、iso-C15:0和iso-C17:03-OH。主要磷酸類脂有PE和兩個未鑒定脂類

3、。
　　菌株HBUM179663T屬于草藥菌屬（Herbiconiux）的一個新種，革蘭氏陽性，細(xì)胞呈短桿狀，無芽胞，無鞭毛，無運(yùn)動性，大小為0.4-0.5μm×1.4-1.6μm。根據(jù)16S rRNA基因序列同源性比對，菌株 HBUM179663T與馬鈴薯草藥菌（Herbiconiux Solani）K134/01T的親緣關(guān)系最近，序列相似性為96.65%?；蚪MDNA（G+C）mol%含量為75.7%。甲基萘醌種類為MK-11

4、。主要脂肪酸是anteiso-C15:0、anteiso-C17:0和C16:0。主要磷酸類脂有PLS、PME、PE和DPG。
　　菌株3-BNT屬于伯克氏菌科（Burkholderiaceae）的一個新屬，革蘭氏陰性，細(xì)胞呈桿狀，無芽孢，單端生鞭毛，大小為0.4-0.6μm×1.8-2.1μm。根據(jù)16S rRNA基因序列同源性比對，菌株3-BNT與烏汶伯克霍爾德氏菌（ Burkholderia ubonensis）CIP107

5、078T的親緣關(guān)系最近，序列相似性為92.83%?；蚪MDNA（G+C）mol%含量為42.4%。泛醌種類為UQ5、UQ6和UQ8。主要脂肪酸是C16:0、C18:1ω7c和cyclo C17:0。主要磷酸類脂有DPG、PE和PG。
　　本實驗通過在VL55培養(yǎng)基中添加6種不同的營養(yǎng)因子，利用常規(guī)稀釋和大量稀釋對采自河北、青海和云南三個地區(qū)的3份土壤樣品進(jìn)行微生物新物種的分離，共分離得到415株純培養(yǎng)物。河北土樣通過常規(guī)稀釋分離得

6、到的72株菌歸屬于14個屬，大量稀釋分離得到的52株菌歸屬于22個屬；青海土樣通過常規(guī)稀釋分離得到的37株菌歸屬于9個屬，大量稀釋分離得到的50株菌歸屬于17個屬；云南土樣通過常規(guī)稀釋分離得到的71株菌歸屬于23個屬，通過大量稀釋法分離得到的133株菌歸屬于15個屬。其中，菌株HBUM200206是通過大量稀釋從青海土樣中分離得到的一株菌，與運(yùn)動?xùn)|菌（Dongia mobilis）LM22T的親緣關(guān)系最近，序列相似性為94.58%，因此

7、菌株HBUM200206可能是紅螺菌科（ Rhodospirillaceae）的一個潛在新屬。菌株HBUM200161、HBUM200202、HBUM200239、HBUM200240、HBUM200352、HBUM200424、HBUM200427、HBUM200448、HBUM200452、HBUM200488、HBUM200497和HBUM200503與親緣關(guān)系最近的模式菌株的16S rRNA基因序列相似性均小于98.65%，可能