侵染半夏的病毒檢測與大豆花葉病毒的分子系統(tǒng)學研究.pdf

1、對我國浙江、河南、山西、湖南、山東，湖北等半夏主產(chǎn)地的三葉半夏(Pinelliaternata(Thunb.)Breit.)進行病毒檢測，并對分離所得的7個大豆花葉病毒(Soybeenmosaicvirus,SMV)進行了核苷酸和氨基酸水平的分子系統(tǒng)學分析。 對收集的29個樣品進行了黃瓜花葉病毒(Cucumbermosaicvirus,CMV)、芋花葉病毒(Dasheenmosaicvirus,DsMV)、SMV的DAS-ELI

2、SA檢測及分子生物學鑒定。在DAS-ELISA檢測中發(fā)現(xiàn)SMV呈陽性的樣品，均呈陽性。為了進一步確定該線狀病毒，用馬鈴薯Y病毒屬(Potyvirus)通用引物和CMV基因組RNA3全長序列擴增引物，通過RT-PCR方法擴增出了CMV及Potyvirus的對應(yīng)片段。通過測序和序列比對進一步確定其分別為CMV與SMV，而后者不是的DsMV，由此確定侵然我國半夏的病毒主要為SMV及CMV，我國三葉半夏普遍受到這兩種病毒的侵然侵染。其中CMV的

3、檢出率為48.2％；SMV的檢率42.4％；有些樣品還存在兩個病毒的復合侵然。通過SMV、CMV的CP的氨基酸水平序列比對發(fā)現(xiàn)：相對來說，SMV半夏分離物與SMV大豆分離物有較大的差異，同源性在80.1％-81.3％之間；CMV半夏分離物根據(jù)CP的分組屬于CMV組Ⅰ。 將SMV陽性樣品進一步研究測序，并將所得的7個SMV分離物的外殼蛋白CP基因與其他分離自大豆的SMV、分離自半夏的SMV、分離自其他天南星科植物的DsMV以及侵然

4、葫蘆科的西瓜花葉病毒(Watermelonmosaicvirus,WMV)對應(yīng)基因進行了核苷酸和氨基酸水平的分子系統(tǒng)學分析。結(jié)果表明，SMVCP基因核苷酸同源序列具有較高的寄主相關(guān)性和部分地域相關(guān)性，而氨基酸同源序列的寄主相關(guān)性明顯高于地域相關(guān)性。侵染半夏的SMV的N端高度變異區(qū)是SMV普通株系和WMV基因重組的結(jié)果，在進化中承受選擇壓力。CP保守區(qū)的氨基酸序列是決定蛋白功能的主要部分，其序列相似性很高，種間差異較小。本研究初步揭示了S