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1、第一章第一章蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)與功能1、蛋白質(zhì)的基本組成單位和平均含氮量。蛋白質(zhì)的基本組成單位和平均含氮量?;窘M成單位為氨基酸。組成蛋白質(zhì)的元素:主要有C、H、O、N和S。有些蛋白質(zhì)還含有少量的P、Fe、Cu、Mn、Zn、Se、I等。各種蛋白質(zhì)的含氮量很接近,平均為16%2、2020種氨基酸的結(jié)構(gòu)及三字母英文縮寫(xiě)。種氨基酸的結(jié)構(gòu)及三字母英文縮寫(xiě)。(P9P9)含羥基的氨基酸:Ser、Tyr、Thr,其易被磷酸化。含硫的氨基酸
2、:半胱氨酸(SH)、胱氨酸、蛋氨酸(SCH3,又叫甲硫氨酸)。芳香族氨基酸:Tyr、Trp、Phe天冬酰胺、谷氨酰胺:酰胺基團(tuán)(CONH2)脯氨酸:屬于亞氨基酸(NH)酸性氨基酸:Asp、Glu堿性氨基酸:Arg、Lys、His3、氨基酸的理化性質(zhì)。氨基酸的理化性質(zhì)。①氨基酸具有兩性解離的性質(zhì):等電點(diǎn)(isoelectricpointpI)在某一pH的溶液中,氨基酸解離成陽(yáng)離子和陰離子的趨勢(shì)及程度相等,成為兼性離子,呈電中性。此時(shí)溶液的
3、pH值稱(chēng)為該氨基酸的等電點(diǎn)。②含共軛雙鍵的氨基酸具有紫外線吸收性質(zhì):測(cè)定蛋白質(zhì)溶液280nm的光吸收值是分析溶液中蛋白質(zhì)含量的快速簡(jiǎn)便的方法。③氨基酸與茚三酮反應(yīng)生成藍(lán)紫色化合物,最大吸收峰在570nm處。4、蛋白質(zhì)一級(jí)、二級(jí)、三級(jí)和四級(jí)結(jié)構(gòu)的概念及維系其穩(wěn)定的化學(xué)鍵。蛋白質(zhì)一級(jí)、二級(jí)、三級(jí)和四級(jí)結(jié)構(gòu)的概念及維系其穩(wěn)定的化學(xué)鍵。①氨基酸的排列順序決定蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)(primarystructureofprotein):指蛋白質(zhì)多肽鏈從
4、N端至C端的氨基酸殘基排列順序即氨基酸的線性序列。在基因編碼的蛋白質(zhì)中,這種序列是由mRNA中的核苷酸序列決定的。一級(jí)結(jié)構(gòu)主要的化學(xué)鍵:肽鍵②多肽鏈的局部主鏈構(gòu)象為蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)(secondarystructureofprotein):蛋白質(zhì)分子中某一段肽鏈的局部空間結(jié)構(gòu)即該段肽鏈主鏈骨架原子的相對(duì)空間位置,不涉及氨基酸殘基側(cè)鏈的構(gòu)象。維系二級(jí)結(jié)構(gòu)的化學(xué)鍵:氫鍵③三級(jí)結(jié)構(gòu)是指整條肽鏈中全部氨基酸殘基的相對(duì)空間位置,即肽鏈中所有原子在三
5、維空間的排布位置。主要的化學(xué)鍵——次級(jí)鍵。疏水作用、離子鍵、氫鍵、VanderWaals力。④含有二條以上多肽鏈的蛋白質(zhì)才可能具有四級(jí)結(jié)構(gòu):蛋白質(zhì)分子中各亞基的空間排布及亞基接觸部位的布局和相互作用,稱(chēng)為蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)。亞基之間的結(jié)合力主要是氫鍵和離子鍵非共價(jià)鍵5、肽單元和蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的主要類(lèi)型。肽單元和蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的主要類(lèi)型。肽單元:參與肽鍵的6個(gè)原子Cα1、C、O、N、H、Cα2位于同一平面,此同一平面上的6個(gè)原子構(gòu)成了所謂的
6、肽單元(peptideunit)。這一平面又被稱(chēng)為肽平面(peptideplane)或酰胺平面(aeplane)。肽單元是肽鏈折疊盤(pán)曲的基本單位。二級(jí)結(jié)構(gòu)的類(lèi)型:α螺旋、β折疊、β轉(zhuǎn)角、無(wú)規(guī)卷曲6、蛋白質(zhì)超二級(jí)結(jié)構(gòu)、模體、結(jié)構(gòu)域、亞基、蛋白質(zhì)等電點(diǎn)的概念。蛋白質(zhì)超二級(jí)結(jié)構(gòu)、模體、結(jié)構(gòu)域、亞基、蛋白質(zhì)等電點(diǎn)的概念。超二級(jí)結(jié)構(gòu)超二級(jí)結(jié)構(gòu):在許多蛋白質(zhì)分子中,可發(fā)現(xiàn)二個(gè)或三個(gè)具有二級(jí)結(jié)構(gòu)的肽段,在空間上相互接近,形成一個(gè)有規(guī)則的二級(jí)結(jié)構(gòu)組合,
7、被稱(chēng)為超二級(jí)結(jié)構(gòu)。模體模體:是蛋白質(zhì)分子中具有特定空間構(gòu)象和特定功能的結(jié)構(gòu)成分,其中一類(lèi)就是具有特殊功能的超二級(jí)結(jié)構(gòu)。一個(gè)模體總有其特征性的氨基酸序列,并發(fā)揮特殊的功能。結(jié)構(gòu)域結(jié)構(gòu)域:分子量較大的蛋白質(zhì)??烧郫B成多個(gè)結(jié)構(gòu)較為緊密且穩(wěn)定的區(qū)域,并各行其功度等)作用下,DNA雙鏈的互補(bǔ)堿基對(duì)之間的氫鍵斷裂,解開(kāi)成兩條單鏈的現(xiàn)象。DNA變性的本質(zhì)是雙鏈間氫鍵的斷裂,只改變其二級(jí)結(jié)構(gòu),不改變其核苷酸排列順序。在去除變性因素,并在適當(dāng)條件下,變性
8、DNA的兩條互補(bǔ)單鏈可恢復(fù)天然的雙螺旋構(gòu)象,這一現(xiàn)象稱(chēng)為復(fù)性(renaturation)。101010、、DNADNADNA的增色效應(yīng)和解鏈溫度的概念:的增色效應(yīng)和解鏈溫度的概念:的增色效應(yīng)和解鏈溫度的概念:的增色效應(yīng)和解鏈溫度的概念:增色效應(yīng)(hyperchromiceffect):在DNA解鏈過(guò)程中,由于有更多的共軛雙鍵得以暴露,DNA在260nm處的吸光度隨之增加。。在解鏈過(guò)程中,紫外吸光度的變化ΔA260達(dá)到最大變化值的一半時(shí)所
9、對(duì)應(yīng)的溫度稱(chēng)為DNA的解鏈溫度(融解溫度),又稱(chēng)Tm。其大小與GC含量成正比。熟悉熟悉:DNADNA的超螺旋結(jié)構(gòu)(的超螺旋結(jié)構(gòu)(P43)P43)。核酸的分子雜交。核酸的分子雜交(P53)(P53)。第三章第三章酶1、酶、酶:酶是由活細(xì)胞產(chǎn)生的、對(duì)其底物具有高度特異性和高度催化效能的蛋白質(zhì)是機(jī)體內(nèi)催化代謝反應(yīng)最主要的催化劑。2、單純酶、單純酶:有些酶其分子結(jié)構(gòu)僅由氨基酸殘基組成,沒(méi)有輔助因子。這類(lèi)酶稱(chēng)為單純酶(simpleenzyme)。
10、3、結(jié)合酶、結(jié)合酶:結(jié)合酶(conjugatedenzyme)是除了在其組成中含有由氨基酸組成的蛋白質(zhì)部分外,還含有非蛋白質(zhì)部分。酶的分子組成,酶蛋白和輔因子的作用。4、必需基團(tuán)、必需基團(tuán):必需基團(tuán)(essentialgroup)酶分子氨基酸殘基側(cè)鏈的化學(xué)基團(tuán)中,一些與酶活性密切相關(guān)的化學(xué)基團(tuán)。5、酶活性中心的概念、酶活性中心的概念:酶的活性中心或活性部位(activesite)是酶分子中能與底物特異地結(jié)合并催化底物轉(zhuǎn)變?yōu)楫a(chǎn)物的具有特定
11、三維結(jié)構(gòu)的區(qū)域。6、同工酶的概念:、同工酶的概念:同工酶(isoenzymeais?uenzaim)是指催化相同的化學(xué)反應(yīng),但酶蛋白的分子結(jié)構(gòu)、理化性質(zhì)乃至免疫學(xué)性質(zhì)不同的一組酶。7、酶促反應(yīng)的特點(diǎn):、酶促反應(yīng)的特點(diǎn):1、酶促反應(yīng)具有極高的效率:2、酶促反應(yīng)具有高度的特異性3、酶促反應(yīng)具有可調(diào)節(jié)性4、酶促反應(yīng)高度的不穩(wěn)定性8、酶促反應(yīng)特異性的類(lèi)型:酶促反應(yīng)特異性的類(lèi)型:絕對(duì)特異性(absolutespecificity):只能作用于特定
12、結(jié)構(gòu)的底物,進(jìn)行一種專(zhuān)一的反應(yīng),生成一種特定結(jié)構(gòu)的產(chǎn)物。相對(duì)特異性(relativespecificity):作用于一類(lèi)化合物或一種化學(xué)鍵。9、影響酶促反應(yīng)速度的因素:、影響酶促反應(yīng)速度的因素:酶濃度、底物濃度、pH、溫度、抑制劑、激活劑等。10、米氏方程及、米氏方程及Km的意義:的意義:v=vmax[s](km[s])[S]:底物濃度v:不同[S]時(shí)的反應(yīng)速度Vmax:最大反應(yīng)速度(maximumvelocity)Km:米氏常數(shù)(Mi
13、chaelisconstant)1Km值等于酶促反應(yīng)速率為最大反應(yīng)速率一半時(shí)的底物濃度2Km值是酶的特征性常數(shù)3Km在一定條件下可表示酶對(duì)底物的親和力.Km越大,表示酶對(duì)底物的親和力越小;Km越小,表示酶對(duì)底物的親和力越大。4Vmax是酶被底物完全飽和時(shí)的反應(yīng)速率11、不可逆抑制作用:、不可逆抑制作用:抑制劑以共價(jià)鍵與酶活性中心的必需基團(tuán)相結(jié)合,使酶失活。12、可逆性抑制作用:、可逆性抑制作用:①競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用:抑制劑與底物的結(jié)構(gòu)相似,
14、能與底物競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合酶的活性中心,從而阻礙酶底物復(fù)合物的形成,使酶活性受到抑制,稱(chēng)為競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用。抑制程度取決于抑制劑與酶的相對(duì)親和力和與底物濃度的相對(duì)比例。②非競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用有些抑制劑與酶活性中心外的必需基團(tuán)相結(jié)合,不影響酶與底物的結(jié)合,酶和底物的結(jié)合也不影響酶與抑制劑的結(jié)合。底物和抑制劑之間無(wú)競(jìng)爭(zhēng)關(guān)系。但酶底物抑制劑復(fù)合物(ESI)不能進(jìn)一步釋放出產(chǎn)物。這種抑制作用稱(chēng)作非競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用。③反競(jìng)爭(zhēng)性抑制作用:抑制劑僅與酶和底物形成的中間
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