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文檔簡介
1、microRNAs是一類由19~23個核苷酸組成的小RNAs,其通過使靶mRNA降解或抑制靶mRNA翻譯的方式來調控基因表達。研究報道顯示microRNAs參與許多生物學過程,且microRNAs的發(fā)現對計算生物學和傳統生物學有很大影響。人類mir-29家族由mir-29a、mir-29b、mir-29c組成。研究表明,mir-29可調控人體細胞中參與細胞代謝、分化、凋亡、免疫等生物學過程相關的基因表達,且在多種腫瘤和疾病中發(fā)現mir-
2、29的異常表達。mir-29家族成員具有相同的種子序列,有一些研究暗示它們可能對同一靶mRNA的調控程度并不相同。
本文主要研究mir-29家族成員對同一靶基因調控的熱力學性質,并通過生物實驗對理論計算結果進行驗證。本文主要研究工作及結果如下:
(1)本文通過三種預測軟件TargetScan、PicTar、miRanda預測mir-29家族的靶基因,并篩選出三種預測軟件共同的預測結果,從中挑選出與細胞周期及D
3、NA復制兩種生物學過程相關的4個靶基因,分別為REV3L、CDC42、CCND2、CDK6;
(2)計算mir-29家族各成員分別與4個靶基因結合位點的自由能。自由能反應熱力學性質的穩(wěn)定性,數值越小說明miRNA-mRNA結合越穩(wěn)定,microRNA對mRNA的調控程度可能越強。隨后為驗證理論設想是否正確,通過生物實驗對這一假想進行驗證;
(3)生物學實驗所得結果與理論設想一致,miRNA-mRNA結合雙鏈的
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