基于融合信息的蛋白質(zhì)亞葉綠體定位預(yù)測(cè)研究.pdf

1、葉綠體是綠色植物以及真核藻類的一種特定的亞細(xì)胞器，也是植物細(xì)胞所特有的能量轉(zhuǎn)換器，它在植物光合作用和新陳代謝中起到了重要作用。了解蛋白質(zhì)的亞葉綠體定位對(duì)研究葉綠體蛋白質(zhì)的功能及其與其他大分子的相互作用具有重要的意義。
　　本文計(jì)算了亞葉綠體蛋白質(zhì)的氨基酸組分分段信息、化學(xué)位移關(guān)聯(lián)信息、基于分子功能和生物過(guò)程的GO注釋信息、蛋白質(zhì)保守位點(diǎn)的進(jìn)化信息，并使用二項(xiàng)分布作為特征篩選方法，對(duì)三肽組分進(jìn)行特征篩選出最優(yōu)特征，以構(gòu)建葉綠體蛋白質(zhì)

2、的特征參數(shù)。最后將這些特征信息進(jìn)行融合，結(jié)合支持向量機(jī)算法構(gòu)建分類預(yù)測(cè)模型，在Jackknife檢驗(yàn)下的總體預(yù)測(cè)成功率達(dá)到90.2％。同時(shí)在交叉檢驗(yàn)和獨(dú)立測(cè)試下都得到了較好的預(yù)測(cè)效果。通過(guò)與其他研究者所提出的方法進(jìn)行多方面預(yù)測(cè)性能對(duì)比，證明了本文所提出方法具有優(yōu)良性能。本文還構(gòu)建了擬南芥蛋白質(zhì)的亞葉綠體定位數(shù)據(jù)集，根據(jù)植物蛋白質(zhì)的亞葉綠體定位數(shù)據(jù)集S60的預(yù)測(cè)中，挑選出具有較好預(yù)測(cè)效果的特征參數(shù)即蛋白質(zhì)保守位點(diǎn)的進(jìn)化信息和基于分子功能和