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文檔簡(jiǎn)介
1、隨著人類基因組計(jì)劃的順利完成,越來(lái)越多的DNA序列和蛋白質(zhì)序列被測(cè)定出來(lái),單純的生物實(shí)驗(yàn)已經(jīng)無(wú)法填補(bǔ)大量序列信息與嚴(yán)重不足的蛋白質(zhì)功能注釋之間的空隙,而且既耗時(shí),成本又高,所以迫切的需要通過(guò)計(jì)算的方法來(lái)預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)功能。然而,另有生物學(xué)研究表明,蛋白質(zhì)功能與蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位是密切相關(guān)的,蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位信息可以為蛋白質(zhì)功能的研究提供有用的線索。因此為了進(jìn)一步了解蛋白質(zhì)的功能,識(shí)別蛋白質(zhì)的亞細(xì)胞定位成為了蛋白質(zhì)組學(xué)的一個(gè)重要研究方向。
2、> 本文主要圍繞這一主題,針對(duì)蛋白質(zhì)序列的編碼方法和分類預(yù)測(cè)算法兩方面進(jìn)行了研究,并在不同的數(shù)據(jù)集上分別進(jìn)行了測(cè)試和分析。本文的主要?jiǎng)?chuàng)新工作概括如下:
本文提出了一種新的蛋白質(zhì)序列編碼方法,該方法由三個(gè)序列特征融合而成,第一個(gè)序列特征為傳統(tǒng)的20維的氨基酸基本組成,第二個(gè)序列特征為氨基酸位置信息,主要提取了每個(gè)氨基酸殘基在序列中的位置信息,第三個(gè)序列特征為氨基酸局部順序信息,我們將每個(gè)氨基酸殘基用五位ASCII碼表示,那么每
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