DNA條形碼和近紅外光譜(NIRS)技術(shù)鑒定研究中國(guó)蜘蛛抱蛋屬植物.pdf

1、蜘蛛抱蛋屬Aspidistra于1822年由J.Ker-Gwal.建立，隸屬?gòu)V義百合科Liliaceae，該屬植物分布于亞洲東部的熱帶和亞熱帶地區(qū)，在我國(guó)主要分布在長(zhǎng)江以南地區(qū)。目前全世界分布有該屬植物約120種，我國(guó)有約83種。本實(shí)驗(yàn)通過查閱和整理有關(guān)蜘蛛抱蛋屬植物研究的文獻(xiàn)資料，對(duì)該屬植物進(jìn)行野外考察和樣品采集，利用DNA條形碼和近紅近光譜分析技術(shù)對(duì)該屬植物進(jìn)行鑒定研究。
　　針對(duì)目前蜘蛛抱蛋屬植物種類較多，分類鑒別定難度大，

2、利用植物DNA條形碼研究方法，對(duì)該屬植物18種97批樣品的4個(gè)候選序列（marK、psbA-trnH、psbK-psbI和rbcL）進(jìn)行PCR擴(kuò)增、測(cè)序，采用CodonCode Aligner5.1.2軟件校對(duì)拼接各樣品的序列，使用Taxon DNA軟件進(jìn)行序列比對(duì)和分析各序列種內(nèi)、種間變異情況，作barcoding gap圖，應(yīng)用相似性搜索法(Blast1)計(jì)算各序列鑒定效率。最后，考察各個(gè)條形碼序列的擴(kuò)增成功率、測(cè)序成功率、種內(nèi)與種

3、間遺傳變異、Barcoding Gap和鑒定成功率，找到適用于該屬植物的條形碼序列。結(jié)果表明，psbK-psbI的鑒定成功率為88.7％，在單一序列中鑒定效率最高。同時(shí)考察了多序列組合對(duì)該屬植物的鑒定效率，結(jié)果鑒定效率明顯高于單一序列，其中matK+psbK-psbI的鑒定成功率達(dá)100％，采用MEGA5.0軟件基于matK+psbK-psbI序列構(gòu)建NJ樹，結(jié)果表明，同一物種的樣品聚集度較好，表現(xiàn)為單系性，基本能對(duì)不同物種進(jìn)行區(qū)分。因

4、此，認(rèn)為matK+psbK-psbI序列適合作為蜘蛛抱蛋植物物種鑒定的DNA條形碼。
　　本實(shí)驗(yàn)對(duì)蜘蛛抱蛋屬植物18種42批樣品的近紅外譜進(jìn)行采集，采用一階導(dǎo)數(shù)、標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)變量變換(SNV)和多元散射校正(MSC)方法對(duì)樣品的原始圖譜進(jìn)行處理，運(yùn)用TQAnlyst8.0化學(xué)計(jì)量學(xué)軟件對(duì)樣品近紅外光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行相似度計(jì)算，采用PASW Statistics18.0軟件通過組件連接和歐氏距離對(duì)光譜數(shù)據(jù)進(jìn)行聚類分析，繪制42批樣品的聚類分析