肝癌復發(fā)相關16號染色體拷貝數(shù)變異及差異表達基因篩選.pdf

1、目的：
　　肝細胞癌（Hepatocellular carcinoma，HCC）是一種預后差的惡性腫瘤，手術切除仍是目前最主要的治療方法，而術后肝內復發(fā)是治療失敗的最重要原因。16號染色體（Chromosome16，Chr16）拷貝數(shù)變異（Copy number aberration，CNA）頻繁發(fā)生于 HCC中，研究發(fā)現(xiàn)其與多種腫瘤的臨床預后密切相關。本研究旨在探討 Chr16 CNAs與 HCC術后肝內復發(fā)的相關性，并篩選復發(fā)

2、相關CNA片段上的差異表達基因。
　　方法：
　　1．采用微陣列比較基因組雜交（Array comparative genomic hybridization，aCGH）平臺檢測具有完整術后復發(fā)隨訪資料（隨訪時間3~73個月）的66例HCC樣本的Chr16 CNAs情況。應用 Log-rank檢驗，Kaplan-Meier生存分析及多因素 Cox風險比例模型（Cox proportional hazards models）分

3、析 Chr16 CNAs與HCC術后肝內復發(fā)的相關性。
　　2．對109例樣本進行 aCGH和基因表達聯(lián)合分析，篩選 HCC肝內復發(fā)相關 CNA片段上的差異表達基因?；?mRNA表達的組間比較采用 Mann-Whitney U檢驗。
　　結果：
　　1．66例 HCC中，16號染色體長臂（16q）丟失占62.1％，短臂（16p）丟失占51.5%。Chr16高頻（發(fā)生率＞20%） CNA片段共6個，均為丟失片段：16p

4、13.3-13.2、16p13.11、16q11.2-22.1、16q22.1、16q22.2-24.2和16q24.2。生存分析顯示，僅16q22.1丟失與 HCC術后肝內復發(fā)顯著相關（Log-rank檢驗，P=0.025）。多因素 Cox回歸分析顯示，16q22.1丟失是肝內復發(fā)的獨立危險因素（HR=2.32,95%CI=1.26～4.27，P=0.007）。
　　2．在 HCC復發(fā)相關16q22.1片段內，有21個基因（FA

5、M96B、CBFB、C16 orf70、TRADD、ELMO3、TMEM208、ATP6 V0 D1、FAM65 A、CTCF、GFOD2、RANBP10、THAP11、NUTF2、EDC4、PSMB10、DDX28、DUS2L、NFATC3、ESRP2、SLC7 A6和 SLC7 A6 OS）的mRNA表達水平在16 q22.1丟失HCC組顯著低于無丟失 HCC組（FDR-q<0.05，P≤0.001）。
　　結論：