基于雙聚類的基因表達芯片分析.pdf

1、DNA基因表達芯片可以高通量地同時分析基因在不同條件下的表達水平，揭示細胞內哪些基因是表達的，哪些基因是不表達的。分析基因表達數據的關鍵一步是尋找具有相似表達模式的基因組。如果兩個基因的表達模式是相似的，則它們或者是執(zhí)行相似的功能，或者參與同一個生物學進程。因而，如果一個新測序基因的表達模式與一個已知的表達模式相似，那么生物學家就有理由猜測這兩個基因可能執(zhí)行相似的功能?；虮磉_分析的另一個重要應用是揭示調控途徑，相似的表達模式通常意味著

2、協(xié)同調控。因此，分析基因表達數據的關鍵就是尋找這樣相似的“模塊”。 本論文的主要特點有： 1.從數學角度介紹了常用的聚類分析的優(yōu)點和缺點及相關的選擇方案。 2.對比分析了聚類分析的缺陷以及與雙聚類分析的異同點。 3.詳細介紹了雙聚類方法中的Cheng和Church方法以及基于模擬退火的雙聚類算法，前者為貪婪式的算法，后者為隨機智能優(yōu)化算法。 4.作者將遺傳算法和禁忌搜索算法整合應用與基因表達數據的