肝內(nèi)膽管細胞癌差異LncRNA表達分析.pdf

1、【目的】：肝內(nèi)膽管細胞癌的發(fā)病率逐年上升且起病隱匿、易轉(zhuǎn)移、并對化療不敏感，具有不良的臨床后果。目前尚未有效的早期診斷標志物、治療方法、預(yù)后判斷標準。本實驗期望能夠通過對肝內(nèi)膽管細胞癌腫瘤組織中差異長鏈非編碼RNA進行分析，討論長鏈非編碼RNA在肝內(nèi)膽管細胞癌的發(fā)病中所可能起到的作用，并篩選出與ICC發(fā)病、治療或預(yù)后相關(guān)的LncRNA。
　　【方法】：收集經(jīng)臨床病理證實為肝內(nèi)膽管細胞癌的腫瘤組織與正常膽管組織，利用Angilent

2、4*180K人類LncRNA芯片檢測其mRNA與LncRNA的表達情況，并篩選出具有差異表達的mRNA與LncRNA。通過mRNA共表達分析預(yù)測差異LncRNA可能的功能，并從中篩選出于具有腫瘤相關(guān)性的LncRNA，以便行進一步研究。
　　【結(jié)果】：通過對芯片數(shù)據(jù)進行分析，共發(fā)現(xiàn)差異表達的mRNA718條，其中上調(diào)表達的mRNA有432條，下調(diào)表達的mRNA有286條；共發(fā)現(xiàn)差異表達的長鏈非編碼RNA1740條，其中上調(diào)表達的長鏈

3、非編碼RNA有1427條，下調(diào)表達的長鏈非編碼 RNA有313條。研究發(fā)現(xiàn)腫瘤相關(guān)性長鏈非編碼 RNA CRNDE、CBR3-AS1、SOX2-OT在肝內(nèi)膽管細胞癌中具有差異表達，并根據(jù)LncRNA預(yù)測結(jié)果從中篩選出具有腫瘤相關(guān)性且表達差異倍數(shù)大于4倍、P值小于0.01的LncRNA86個。
　　【結(jié)論】：長鏈非編碼RNA可能參與細胞功能的各個方面，在肝內(nèi)膽管細胞癌的發(fā)病中起著重要作用，其可能通過調(diào)節(jié)細胞內(nèi)信號通路而差異ICC致病