基于串聯(lián)質(zhì)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行蛋白質(zhì)序列庫(kù)搜索算法初探.pdf

1、蛋白質(zhì)序列庫(kù)搜索方法為液相-串聯(lián)質(zhì)譜聯(lián)用儀產(chǎn)生的高通量質(zhì)譜數(shù)據(jù)提供了快速的分析方式，使生物樣品中的蛋白質(zhì)可以得到快速定性定量分析。然而，該過(guò)程仍然存在很多問(wèn)題。本論文初步研究了蛋白質(zhì)序列庫(kù)搜索算法及對(duì)搜索結(jié)果進(jìn)行分析的算法，并嘗試采用化學(xué)計(jì)量學(xué)方法對(duì)蛋白質(zhì)庫(kù)搜索結(jié)果進(jìn)行判別分析。 在第二章中，論文對(duì)當(dāng)前廣泛采用的蛋白質(zhì)序列庫(kù)，庫(kù)搜索算法及蛋白質(zhì)定性方法進(jìn)行了介紹。同時(shí)對(duì)由五種不同質(zhì)譜儀產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù)的SEQUEST搜索結(jié)果，及

2、不同參數(shù)條件下的Mascot搜索結(jié)果進(jìn)行對(duì)比，發(fā)現(xiàn)在不同條件下得到的結(jié)果相差較大，并且在所有的結(jié)果中存在大量的錯(cuò)誤匹配。 為了對(duì)蛋白質(zhì)序列庫(kù)搜索結(jié)果進(jìn)行分析，并最大限度地消除錯(cuò)誤結(jié)果的影響，大量的分析算法被開(kāi)發(fā)出來(lái)，論文在第三章中對(duì)這些算法進(jìn)行了介紹，并嘗試采用化學(xué)計(jì)量學(xué)中的模式識(shí)別方法對(duì)搜索結(jié)果進(jìn)行判別分析，認(rèn)為化學(xué)計(jì)量學(xué)方法可以明顯消除SEQUEST搜索結(jié)果中假陽(yáng)性結(jié)果的影響。但對(duì)于Mascot搜索結(jié)果，這些方法無(wú)明顯提高