扁玉螺的遺傳多樣性研究.pdf

1、本文以中國(guó)北方沿海的扁玉螺(Neverita didyma Roding)野生群體為研究對(duì)象，應(yīng)用簡(jiǎn)單重復(fù)序列區(qū)間擴(kuò)增(inter simple sequence repeat，ISSR)分子標(biāo)記技術(shù)，對(duì)扁玉螺的遺傳多樣性進(jìn)行了研究，從群體遺傳學(xué)角度揭示了扁玉螺野生群體的遺傳結(jié)構(gòu)，對(duì)其種質(zhì)資源的遺傳多樣性進(jìn)行了評(píng)估，探討了不同野生群體之間的遺傳關(guān)系，以期為保護(hù)和合理利用扁玉螺種質(zhì)資源提供理論依據(jù)。主要研究結(jié)果如下： 1、通過(guò)優(yōu)化

2、ISSR-PCR反應(yīng)體系，從30個(gè)ISSR引物中篩選出13個(gè)用于ISSR分析。13個(gè)引物均顯示出不同程度的多態(tài)性，在3個(gè)群體90只個(gè)體中共檢測(cè)到161個(gè)位點(diǎn)，平均每個(gè)引物記錄12.4個(gè)位點(diǎn)，擴(kuò)增產(chǎn)物的分子量大多在200 bp-1600 bp之間。 2、多態(tài)性位點(diǎn)比例和Shannon's指數(shù)是衡量群體遺傳多樣性的重要指標(biāo)之一。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示：青島、大連和煙臺(tái)3個(gè)群體的多態(tài)性位點(diǎn)分別為74.53％、74.53％、85.09％，可見，煙

3、臺(tái)群體的多態(tài)性位點(diǎn)比例明顯高于青島和大連群體，雖然大連群體和青島群體的多態(tài)位點(diǎn)百分率相同，但綜合Shannon's信息指數(shù)(I)和Nei's基因多樣性指數(shù)(h)兩組數(shù)據(jù)來(lái)看，各群體遺傳多樣性水平的高低依次為YT>QD>DL。 3、Nei's基因多樣性指數(shù)(h)和Shannon's信息指數(shù)(I)在群體水平上分別為0.2811和0.4189，在物種水平上分別為0.3395和0.5113，顯示出扁玉螺群體擁有較高的遺傳多樣性水平，物種

4、水平的遺傳多樣性高于群體水平。群體內(nèi)遺傳多態(tài)度比例(Hpop/Hsp)為0.7873，群體間遺傳多態(tài)度比例(Hsp-Hpop)/Hsp為0.2127，即扁玉螺群體發(fā)生的遺傳變異有78.73％存在于群體內(nèi)，21.27％的變異存在于群體間，這說(shuō)明群體內(nèi)的變異是導(dǎo)致群體間分化的重要因素。 4、利用AMOVA的等級(jí)剖分法得出的群體間和群體內(nèi)對(duì)總的遺傳變異的貢獻(xiàn)率表明，扁玉螺27.16％的變異發(fā)生在群體間，72.84％的變異發(fā)生在群體內(nèi)，

5、顯著性檢驗(yàn)顯示扁玉螺群體間和群體內(nèi)均有極顯著的遺傳分化(φst=0.2720，P<0.001)。這與上述3中的分析結(jié)果是一致的。 5、群體內(nèi)的遺傳相似度反映了群體內(nèi)個(gè)體間的遺傳差異，本實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示：QD群體內(nèi)個(gè)體間的遺傳相似系數(shù)平均為0.7709；YT群體內(nèi)個(gè)體間的遺傳相似系數(shù)為0.7307；DL群體內(nèi)個(gè)體間的遺傳相似系數(shù)為0.7824，表明YT群體內(nèi)個(gè)體間的遺傳差異較大。 6、遺傳距離(D)和遺傳相似度(S)是衡量群體

6、間遺傳變異程度的重要參數(shù)，S值越大，表明親緣關(guān)系越近，遺傳變異越?。欢鳧值越大，則表明親緣關(guān)系越遠(yuǎn)，遺傳變異越大。通過(guò)對(duì)青島、大連和煙臺(tái)3個(gè)群體之間的遺傳相似系數(shù)和遺傳距離進(jìn)行比較的結(jié)果顯示：QD與DL之間的遺傳距離最大，DL與YT群體間的遺傳距離最小。遺傳相似度的結(jié)果為YT與DL群體間的遺傳相似系數(shù)最大。表明在扁玉螺3個(gè)自然群體中，DL與YT之間的親緣關(guān)系較近，DL與QD之間的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。 7、根據(jù)群體間的遺傳距離和個(gè)體間的

7、遺傳相似度，用NTSYS V2.20軟件中的不加權(quán)類平均聚類法(UPGMA)分別對(duì)三個(gè)群體及三個(gè)群體的90只個(gè)體進(jìn)行聚類。結(jié)果顯示：群體間的聚類結(jié)果與上述6完全相同；QD、DL和YT群體內(nèi)的各30只個(gè)體分別匯聚成各自獨(dú)立的一支，表明群體內(nèi)的個(gè)體間有高度的遺傳相似性。 8、扁玉螺3群體之間的基因分化系數(shù)(Gst)為0.1720，由Gst估算的基因流(Nm)為2.4063。這表明3群體之間存在著有效的基因流，遺傳漂變不是影響扁玉螺群