染色體1p13上位點(diǎn)多態(tài)性與糖尿病下肢血管病變的相關(guān)性研究及其機(jī)制的探討.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、糖尿病下肢血管病變(lower-extremity arterial disease,LEAD)又稱糖尿病周圍動(dòng)脈疾?。╬eripheral arterial disease,PAD),目前研究認(rèn)為糖尿病下肢血管病變的病理機(jī)制與動(dòng)脈粥樣硬化(atherosclerosis,AS)的形成有關(guān)。
  AS是下肢血管病變與冠狀動(dòng)脈疾?。–oronary Artery Disease,CAD)共同的病理基礎(chǔ)。與CAD相似,血脂異常、吸煙、

2、高血壓及糖尿病亦是PAD的危險(xiǎn)因素。此外,遺傳因素在PAD的發(fā)生發(fā)展中起到重要作用。全基因組關(guān)聯(lián)研究(Genome-wide Association Study,GWAS)發(fā)現(xiàn)了多個(gè)與疾病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的位點(diǎn),其中有些位點(diǎn)對(duì)疾病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)具有升高作用,有些位點(diǎn)對(duì)疾病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)則具有降低作用,其發(fā)現(xiàn)的遺傳變異研究已經(jīng)被用來預(yù)測(cè)CAD及PAD。而染色體9p21上的位點(diǎn)rs1333049不僅與CAD相關(guān),同時(shí)與PAD相關(guān),表明冠狀動(dòng)脈疾病及外周動(dòng)脈

3、疾病可能存在共同的遺傳學(xué)基礎(chǔ)。
  國內(nèi)外多項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn),rs599839單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)與CAD的發(fā)生存在顯著關(guān)聯(lián),rs599839及rs646776與急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)亦顯著相關(guān)。同時(shí),GWAS還發(fā)現(xiàn),人類染色體1p13上的位點(diǎn)rs599839、rs646776及rs12740374與血清膽固

4、醇(Total Cholesterol,TC)和/或低密度脂蛋白膽固醇(Low Density Lipoprotein Cholesterol,LDL-C)顯著相關(guān)。rs599839 SNP是心肌梗死和 LDL-C的風(fēng)險(xiǎn)變異,其機(jī)制可能與 rs12740374 SNP相關(guān)。sortilin1是定位于高爾基體的細(xì)胞內(nèi)蛋白,介導(dǎo)了包含載脂蛋白B的脂質(zhì)顆粒的轉(zhuǎn)運(yùn)過程。rs12740374 T位點(diǎn)使SORT1 mRNA的表達(dá)增加, sortil

5、in1蛋白水平升高,從而降低了血液中VLDL和LDL水平,進(jìn)而降低冠脈疾病患病風(fēng)險(xiǎn)。而rs12740374 G位點(diǎn)作用與之相反。
  血糖及糖化血紅蛋白水平是反映機(jī)體糖代謝狀況的重要指標(biāo)。當(dāng)血糖調(diào)節(jié)異常時(shí),可以增加2型糖尿病及大血管疾病的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。GWAS已經(jīng)確定了與血糖相關(guān)的32個(gè)位點(diǎn),其中有些位點(diǎn)與2型糖尿病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)亦相關(guān)。有學(xué)者研究發(fā)現(xiàn),印度錫克教徒染色體1p13上位點(diǎn)rs599839與空腹血糖水平及2型糖尿病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān),

6、但在中國尚未見報(bào)道。
  綜上所述,1p13上的位點(diǎn)與冠狀動(dòng)脈粥樣硬化性疾病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)及血糖、血脂異常存在一定的相關(guān)性,同時(shí)這些位點(diǎn)還與CAD及MI患病風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)。本文將研究1p13上rs599839、rs646776及rs12740374位點(diǎn)SNP與糖尿病下肢動(dòng)脈粥樣硬化性血管病變相關(guān)性,并探討其可能機(jī)制,以期更好的理解疾病的病理生理學(xué)機(jī)制及發(fā)現(xiàn)疾病治療的新靶點(diǎn)。
  第一部分染色體1p13上位點(diǎn)rs599839、rs6467

7、76及rs12740374多態(tài)性與糖尿病下肢血管病變的相關(guān)性研究
  目的:探討染色體1p13上位點(diǎn)rs599839、rs646776、rs12740374與2型糖尿病患者下肢血管病變的相關(guān)性。
  方法:
  1本研究DM組選取442例2型糖尿病患者,DMPAD組選取440例糖尿病PAD患者,所有研究對(duì)象均來自中國漢族人群,無血緣關(guān)系。排除甲狀腺機(jī)能亢進(jìn)及減退,嚴(yán)重肝腎功能障礙及基因分型失敗者。
  2收集所有

8、受試者的身高、體重、血壓、踝肱指數(shù)(ABI)、糖化血紅蛋白(HbA1C)、血脂等。提取外周血白細(xì)胞基因組DNA,應(yīng)用Taqman探針技術(shù)對(duì)3個(gè)候選SNPs進(jìn)行基因分型。
  3統(tǒng)計(jì)學(xué)分析采用 SPSS16.0軟件,兩組人群基因型頻率采用Hardy-Weinberg平衡定律檢驗(yàn)。計(jì)量資料組間比較采用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn)及秩和檢驗(yàn)。用基因計(jì)數(shù)法計(jì)算各組基因型和等位基因頻率(構(gòu)成比),計(jì)數(shù)資料、各組基因型和等位基因頻率之間比較采用卡方檢驗(yàn)。單

9、因素及多因素分析采用Logistic回歸分析。
  結(jié)果:1 DMPAD組與 DM組相比,年齡、病程、吸煙、高血壓、HbA1C、TC、高密度脂蛋白膽固醇(HDL-C)、LDL-C、體重指數(shù)(BMI)、降脂治療、冠心病及腦梗死患病率差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),性別、甘油三酯(TG)差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);2 DMPAD組與 DM組相比,rs599839 A與G、rs646776 A與G、rs12740374 G與T

10、等位基因頻率差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);在顯性模型,rs599839 AA與AG+GG, rs646776 AA與AG+GG,rs12740374 CC與CT+TT基因型頻率差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);在隱性模型,rs599839 AA+AG與GG,rs646776 AA+AG與GG,rs12740374 CC+CT與TT基因型頻率差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);3在DMPAD及DM組,rs599839 Hardy-

11、Weinberg平衡檢驗(yàn)?2值分別為0.069和0.439,P值分別為0.792和0.507;rs646776 Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)?2值分別為0.881和1.393,P值分別為0.347和0.237;rs12740374 Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)?2值分別為0.376和0.340, P值分別為0.539和0.559。3個(gè)位點(diǎn)基因型頻率均符合 Hardy-Weinberg遺傳平衡(P>0.05);4單因素lo

12、gistic回歸分析表明,年齡、病程、吸煙、高血壓、降脂治療、HbA1C、TC、HDL-C、LDL-C、BMI、rs599839、rs646776、rs12740374基因型、冠心病及腦梗死均與糖尿病PAD相關(guān)(P<0.05)。多因素logistic回歸分析,年齡、HbA1C、TG、LDL-C、吸煙、高血壓、糖尿病病程、冠心病及腦梗死是糖尿病PAD的獨(dú)立風(fēng)險(xiǎn)因素(P<0.05),而 HDL-C、rs599839、rs646776、rs1

13、2740374基因型是糖尿病PAD的保護(hù)因素(P<0.05)。
  第二部分1p13上位點(diǎn)rs599839、rs646776及rs12740374多態(tài)性與糖脂代謝的關(guān)聯(lián)研究
  目的:探討染色體1p13上位點(diǎn)rs599839、rs646776及rs12740374與血糖、血脂的相關(guān)性。
  方法:
  1研究人群同第一部分。收集所有受試者的身高、體重、血壓、ABI、空腹血糖( Fasting Plasma Glu

14、cose, FPG)、餐后血糖( Post-Prandial Glucosese,PPG)、HbA1C、TC、TG、HDL-C及LDL-C。
  2提取外周血單個(gè)核細(xì)胞基因組DNA,應(yīng)用Taqman探針技術(shù)對(duì)3個(gè)候選SNPs進(jìn)行基因分型。
  3統(tǒng)計(jì)學(xué)分析采用SPSS16.0軟件,正態(tài)分布計(jì)量資料用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示,非正態(tài)分布資料經(jīng)對(duì)數(shù)轉(zhuǎn)換成正態(tài)資料用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示,計(jì)數(shù)資料用百分?jǐn)?shù)表示,基因型與各指標(biāo)相關(guān)性采用協(xié)方差分析

15、和spearman法進(jìn)行檢驗(yàn)。
  結(jié)果:1校正年齡、性別、吸煙、高血壓、降脂治療后,所有研究人群rs599839、rs646776及rs12740374不同基因型間LDL-C差別均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;spearman相關(guān)分析表明兩者呈負(fù)相關(guān)(P<0.05),相關(guān)系數(shù)分別為-0.166、-0.131及-0.146;2所有研究人群校正年齡、性別、吸煙、高血壓、降脂治療后,rs599839、rs646776及rs12740374不同基因型間

16、FPG、PPG、HbA1c、TC、TG、HDL-C、BMI差別均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);3校正年齡、性別、吸煙、高血壓、降脂治療后,DMPAD組rs599839AA與AG+GG、rs646776AA與AG+GG、rs12740374GG與GT+TT基因型相比,LDL-C差別均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;spearman相關(guān)分析表明兩者呈負(fù)相關(guān)(P<0.05),相關(guān)系數(shù)分別為-0.172、-0.129及-0.150。
  4、DMPAD組校

17、正年齡、性別、吸煙、高血壓、降脂治療后,rs599839、rs646776及rs12740374不同基因型間 FPG、PPG、HbA1c、TC、TG、HDL-C、BMI差別均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。
  第三部分1p13上位點(diǎn)rs599839、rs646776及rs12740374多態(tài)性與糖尿病下肢血管病變相關(guān)性的機(jī)制研究
  目的:探討染色體1p13上位點(diǎn)rs599839、rs646776、rs12740374位點(diǎn)基

18、因多態(tài)性在糖尿病下肢血管病變發(fā)生發(fā)展中的作用機(jī)制。
  方法:
  1分別對(duì)第一部分DM組及DMPAD組進(jìn)行rs599839、rs646776及rs12740374基因型連鎖不平衡及單倍體型分析。
  2考慮到rs599839、rs646776及rs12740374基因型頻率,隨機(jī)選取第一部分DMPAD組中rs599839 AA、rs646776 AA及rs12740374 GG基因型各25例,另選擇rs599839A

19、G+GG、rs646776 AG+GG及rs12740374 GT+TT基因型各25例,其中每個(gè)位點(diǎn)的兩個(gè)基因型頻率比值與總DMPAD人群兩基因型頻率比值一致,檢測(cè)所選樣本SORT1 mRNA的表達(dá)。
  3應(yīng)用SheSIS軟件進(jìn)行rs599839、rs646776及rs12740374的連鎖不平衡及單倍體型分析。統(tǒng)計(jì)學(xué)分析采用 SPSS16.0軟件。不同基因型SORT1 mRNA表達(dá)情況比較采用兩獨(dú)立樣本t檢驗(yàn),P<0.05差異

20、有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
  結(jié)果:1 DM組rs12740374與rs599839,rs12740374與rs646776, rs599839與rs646776之間的連鎖不平衡系數(shù)D'分別為0.933,0.977,0.930;r2分別為0.689,0.914,0.655。DM組3個(gè)位點(diǎn)間均存在連鎖不平衡。rs12740374與 rs646776之間連鎖不平衡程度最強(qiáng);2 DMPAD組rs12740374與 rs599839,rs12740

21、374與 rs646776,rs599839與 rs646776之間的連鎖不平衡系數(shù)D'分別為0.915,0.959,0.922;r2分別為0.558,0.849,0.613。DMPAD組3個(gè)位點(diǎn)間均存在連鎖不平衡。rs12740374與rs646776之間連鎖不平衡程度最強(qiáng);3 rs12740374,rs599839與rs646776單倍體型TGG頻率在DM及DMPAD組間差別有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.01), OR值及95%CI為0.5

22、02(0.297-0.846);4 rs12740374 GT+TT與GG基因型,rs646776 AG+GG與AA基因型,rs599839 AG+GG與AA基因型相比,SORT1 mRNA表達(dá)均升高,2-△△Ct值分別為5.81(3.07,11.00),3.94(1.64,9.44),2.36(0.73,7.62),差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.01)。
  結(jié)論:
  1年齡、HbA1C、TG、LDL-C、吸煙、高血壓、糖

23、尿病病程、冠心病、腦梗死是糖尿病PAD的獨(dú)立風(fēng)險(xiǎn)因素,而HDL-C是糖尿病下肢血管病變的保護(hù)因素。
  21p13上位點(diǎn)rs599839AG+GG、rs646776 AG+GG、rs12740374GT+TT基因型是糖尿病下肢血管病變的保護(hù)因素。
  3在顯性模型,總研究人群及糖尿病下肢血管病變?nèi)巳簉s599839、rs646776及rs12740374基因多態(tài)性與LDL-C呈負(fù)相關(guān)關(guān)系。
  4 rs12740374

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