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文檔簡介
1、DNA分子自組裝是指利用核酸序列的可設(shè)計性以及堿基配對的高度可控性,自下而上,實現(xiàn)多種維度DNA納米結(jié)構(gòu)的程序化精確構(gòu)造。利用DNA分子自組裝技術(shù)可以構(gòu)建從一維到三維不同形狀的納米結(jié)構(gòu),并且這些結(jié)構(gòu)在微納米電子學(xué),納米生物學(xué)等眾多領(lǐng)域有許多潛在的用途。本文利用分子瓦自組裝和DNA折紙術(shù)分別構(gòu)建了兩種不同尺度的DNA納米管,討論了其組裝機理并表征了所制得的結(jié)構(gòu);利用T4DNA連接酶加固了分子瓦自組裝制備的DNA納米管結(jié)構(gòu);采用探針雜交法在
2、兩種納米管的外側(cè)連接不同直徑的AuNPs,構(gòu)建出不同形貌的雜化結(jié)構(gòu)并對其進行了表征。具體研究內(nèi)容如下:
(1)采用分子瓦自組裝技術(shù),以雙交叉DNA分子瓦為組裝單元,通過粘性末端的堿基互補配對使得分子瓦之間相互連接形成二維管狀結(jié)構(gòu),對DNA納米管的形成機理進行了分析并預(yù)測了最可能形成的DNA納米管的直徑。使用非變性PAGE,TEM,AFM和熒光顯微鏡對組裝后的DNA納米管進行了表征。結(jié)果表明組裝成功的DNA納米管直徑大小不一
3、,在7到20nm之間均有分布,長度最長可以達到60μm。結(jié)果還顯示DNA納米管在原子力針尖作用下很容易破裂成二維條帶狀結(jié)構(gòu)。
(2)針對分子瓦自組裝形成的DNA納米管很容易破裂的原因,在構(gòu)成分子瓦的DNA單鏈末端修飾磷酸基團,利用T4DNA連接酶連接DNA納米管中相鄰的DNA鏈之間的缺口,使用變性PAGE及AFM對連接前后的DNA納米管進行了表征。結(jié)果顯示缺口連接后的DNA納米管的整體連續(xù)性增加,在原子力針尖作用下能較好的
4、保持完整形貌。并且實驗結(jié)果還發(fā)現(xiàn)分子瓦中間的DNA鏈由于難以接觸到T4DNA連接酶而沒有連接成功。
(3)在雙交叉分子瓦單元中間鏈的3’末端引出15bs的黏性末端,使其與SH-ssDNA互補,SH-ssDNA通過Au-S鍵包覆在5nm的AuNPs表面,采用探針雜交法得到了分子瓦自組裝DNA納米管與AuNPs的雜化結(jié)構(gòu),TEM表征結(jié)果顯示AuNPs基本沿著DNA納米管排列,呈無規(guī)則形狀。
(4)利用三維DNA折
5、紙術(shù)軟件設(shè)計了雙層結(jié)構(gòu)的DNA納米管以及帶有30個連接位點的DNA納米管,緩慢退火得到DNA納米管結(jié)構(gòu)。分別用瓊脂糖凝膠電泳和AFM表征了DNA納米管結(jié)構(gòu),結(jié)果顯示組裝后的DNA納米管在形貌上與預(yù)期設(shè)計的相一致。同樣,用探針雜交法在納米管周圍連接10nm的AuNPs,瓊脂糖凝膠電泳純化后用TEM表征,結(jié)果表明AuNPs在DNA納米管周圍呈螺旋排列,且每個納米管上AuNPs的數(shù)目在7-9個之間。Uv-vis吸收光譜顯示雜交反應(yīng)后混合液的特
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