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文檔簡介
1、本論文中我們首先通過NCBI數(shù)據(jù)庫搜索到不同物種的跨膜區(qū)的序列,找出保守型最強的跨膜區(qū),分別是E.鈣粘蛋白的跨膜區(qū)(TM)和β2AR的第六跨膜區(qū)(TM-VI)。接下來我們采用TOXCAT方法分析跨膜區(qū)的二聚化,為了研究哪些殘基在二聚界面上發(fā)揮重要作用,又分別在一些相互作用序列模型中引入突變位點。我們采用Fmoc固相合成法,合成跨膜區(qū)多肽,利用圓二色譜(CD)研究其二級結構,利用SDS-PAGE研究其聚集狀態(tài)。另外,我們采用計算機模擬的方
2、法,在模擬的脂質(zhì)雙分子層中研究其二聚化的過程,找出跨膜螺旋相互作用的界面。
對于E.鈣粘蛋白的研究,通過TOXCAT分析的結果我們可以看出,插入跨膜片段的長度對其二聚化程度有影響。另外,定點突變的結果顯示真正介導E.鈣粘蛋白跨膜區(qū)二聚化的作用模型是聚亮氨酸拉鏈區(qū),而不是GxxxG作用模型,這一結論通過計算機模擬的方法也得到驗證。采用Fomc固相合成法合成跨膜區(qū)多肽,SDS- PAGE結果顯示其單體和二聚體條帶同時存在。對于
3、β2AR第六跨膜區(qū)的研究,通過TOXCAT分析的結果我們可以看出,插入跨膜片段的長度對其二聚化也有一定的影響,跨膜區(qū)的長度并不是越長二聚強度越高。采用Fomc固相合成法合成TM-VI多肽,SDS-PAGE結果顯示其二聚體條帶的存在。通過定點突變分析,我們發(fā)現(xiàn)GxxxG作用模型的破壞并沒有使二聚強度降低很多,很可能該作用序列只是部分參與了跨膜區(qū)的二聚化,并不是其關鍵的作用位點。我們的計算機模擬的結果顯示模擬200ns后兩條跨膜螺旋并無明顯
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