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文檔簡介
1、從山東省壽光市和濟寧市不同地區(qū)的番茄蔬菜大棚中采集11個番茄根際土壤樣品,通過培養(yǎng)總共獲得2892個細菌分離物。通過平板對峙法,以番茄灰霉病病原菌(Botrytiscinerea)為靶標(biāo)菌,獲得了168株番茄根際灰霉病拮抗菌。其中有34株拮抗菌具有高效穩(wěn)定的拮抗作用,生防潛力很大。
采用16S-RFLP,BOXAIR-PCR,16S rDNA全序列測序分析研究了168株番茄灰霉病拮抗菌的遺傳多樣性和系統(tǒng)發(fā)育,初步確定了拮抗
2、菌的分類地位。
BOXAIR-PCR聚類分析表明168株拮抗菌在87%的相似性水平上被分為33個群。其中包括兩個大群,15和19;16個小群和14個由單菌株形成的群,聚類的結(jié)果與地域性沒有任何聯(lián)系。BOXAIR-PCR基因指紋圖譜和聚類分析結(jié)果表明了這些拮抗菌具有豐富的遺傳多樣性。
16S-RFLP分析結(jié)果在91.5%的相似性水平上將168株番茄灰霉病拮抗菌分為28個群,群3,4,5,10,12,14,15,
3、16,17,18,19,21,23,25,26和28每一個群都包含單一的菌株。群6和13為兩個大群。
依據(jù)16S-RFLP, BOXAIR-PCR的聚類結(jié)果,從每個群中選出代表菌株做16S rDNA測序,并且在NCBI上檢索序列的相似度并找出模式菌株。構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹結(jié)果表明,66株代表菌株來自于14個不同屬的26個不同的種。Bacillus,Pseudomonas,Alcaligenes為優(yōu)勢屬,分別有126,10,10個
4、菌株。Pseudomonas,Bacillus,Streptomyces這三個分別至少包含3,8,5個不同的種。
168株番茄灰霉病拮抗菌中革蘭氏陽性菌占79.2%,而革蘭氏陰性菌只20.8%。在所有的番茄灰霉病拮抗菌中有20.8%的拮抗菌對番茄灰霉病病原菌有較強的抑制效果。首次發(fā)現(xiàn)蜂類芽孢桿菌(Paenibacillus apiarius)、雷氏普羅維登斯菌(Providenciarettgeri)、緩慢葡萄球菌(Sta
5、phylococcus lentus)、苜蓿中華根瘤菌(Sinorhizobium meliloti)、節(jié)桿菌(Arthrobacter arilaiti)、分產(chǎn)堿桿菌(Alcaligenes faecalis)、擬香味類香味菌(Myroides odoratimimus)、類短小芽孢桿菌(Brevibacillus parabrevis)、不動桿菌(Acinetobacter sp)、Tetrathiobacter mimigarde
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