甘藍(lán)型油菜粒重位點(diǎn)TSWA7a的精細(xì)定位及候選基因鑒定.pdf

1、千粒重是油菜產(chǎn)量性狀的重要組成部分，也是進(jìn)化過程中被選擇的主要農(nóng)藝性狀之一。本研究在A7染色體上的千粒重主效QTL TSWA7a定位的基礎(chǔ)上，利用含有目標(biāo)區(qū)段的BAC文庫序列信息開發(fā)新的標(biāo)記，開展精細(xì)定位和圖位克隆，并構(gòu)建了兩個候選基因的突變體用于功能分析，為解析油菜種子大小的調(diào)控機(jī)理和油菜產(chǎn)量育種提供新信息和新資源。所得主要結(jié)果如下:
　　1.根據(jù)本實(shí)驗(yàn)室TWSA7a位點(diǎn)的初定位結(jié)果，利用分布在目標(biāo)區(qū)段內(nèi)（標(biāo)記SSR434和BA

2、07-120之間）的8對標(biāo)記篩選雙親BAC文庫，得到分別含有兩種等位基因的38個BAC單克隆。從中篩選出14個分別來自不同等位基因的BAC單克隆建庫測序。利用測序結(jié)果開發(fā)出51對InDel標(biāo)記，選取3對共顯性標(biāo)記用于精細(xì)定位。
　　2.BC7F2∶3家系和BC8F2群體千粒重表型呈連續(xù)分布。利用BC7F2∶3表型和基因型數(shù)據(jù)進(jìn)行QTL掃描，將TSWA7a位點(diǎn)鎖定在BA07-145和BA07-81之間，LOD值為7.10，加性效應(yīng)和

3、顯性效應(yīng)分別為-0.30g和-0.04g。
　　3.對近等基因系重測序數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn)，上述目標(biāo)區(qū)段內(nèi)有21個ORFs。對這些基因的擬南芥同源基因突變體進(jìn)行了粒重分析，發(fā)現(xiàn)只有g(shù)ene11和gene15兩個基因的擬南芥突變體干粒重表型與野生型有顯著差異。通過近等基因系種子發(fā)育不同時期轉(zhuǎn)錄組表達(dá)分析發(fā)現(xiàn)，候選基因差異表達(dá)的時期與粒重產(chǎn)生差異的時期重合。根據(jù)擬南芥同源基因的注釋信息，這兩個基因都編碼WD-40蛋白家族的轉(zhuǎn)導(dǎo)蛋白。